Travail de génétique 2°Doc Doppagne M.L. Evrard L. Peduzzi F. Schoenars P.

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1 Travail de génétique 2°Doc Doppagne M.L. Evrard L. Peduzzi F. Schoenars P.

2 Estimation de la variance génétique et phénotypique de divers caractères de croissance chez la chèvre Sicilienne «Girgentana»

3 Plan de l’exposé Présentation du sujet Présentation du sujet Commentaires des méthodes Commentaires des méthodes Résultats & Conclusion Résultats & Conclusion Applications pratiques Applications pratiques Bibliographie Bibliographie

4 I. Présentation du sujet  Animaux populaires dans le passé: -> élevés en centres urbains -> vente au détail de viande et lait  Restrictions sanitaires: -> interdiction d’élever en centres urbains -> interdiction de vendre le lait => EXTINCTION (de 30 000 en 83 à 524 en 94)

5 Pour éviter l’extinction, la race doit retrouver sa valeur génétique, zootechnique et économique:  Augmenter la production de viande  Retarder l’abattage à 45-60 jours

6 II. Commentaire des méthodes  1998 – 2000  276 chevreaux: 118 mâles 158 femelles 158 femelles  élevés en ferme expérimentale au lait maternel

7 1. Collecte de données: Numéro d’identification Numéro d’identification Pédigrée Pédigrée Sexe Sexe Poids corporel Poids corporel Taille de la portée Taille de la portée

8 2. Analyses statistiques: Modèle père multi-caractère incluant: Modèle père multi-caractère incluant: -> des effets fixes: - année de naissance - âge de la mère à la naissance - taille de la portée - sexe de l’enfant -> des effets dus au hasard: - pères dont on ne connaît pas l’âge à la naissance de l’enfant - autres

9 y ijklmn = µ + a i + b j + c k + d l + s im + e ijklmn y = caractère de croissance y = caractère de croissance µ = moyenne générale µ = moyenne générale a = année de naissance a = année de naissance b = âge de la mère à la naissance b = âge de la mère à la naissance c = taille de la portée c = taille de la portée d = sexe des chevreaux d = sexe des chevreaux s = effet du père lié à l’année de naissance s = effet du père lié à l’année de naissance e = erreur e = erreur

10 Héritabilité (h²) et variance génétique additive (σ² a ) h² = 4 σ² s / (σ² s + σ² e ) h² = 4 σ² s / (σ² s + σ² e ) -> σ² s : variabilité entre pères -> σ² e : variance résiduelle -> méthode ANOVA, ½ frères paternels (paternal half-sibs) σ² a = 4 σ² s /(1 – F) σ² a = 4 σ² s /(1 – F) -> F = consanguinité

11 Variance erreur de l’héritabilité (σ² h² ) σ² h² = 32h²/T σ² h² = 32h²/T -> T = pP où -p = nombre de descendants de chaque père -P = nombre de familles de demi-frères Probabilité que la variance erreur soit significative: Probabilité que la variance erreur soit significative: P 0 = 1/(s-1) { P-1/P (Σp²) }

12 III. Résultats et conclusions 1. Effets de l’environnement: - Sur le poids corporel (BW): -> effets fixes significatifs pour BW 0, 15, 60 -> seuls année et type de naissance significatifs pour BW 30 et 45 - Sur le gain quotidien moyen (ADG): -> taille de la portée significative sauf pour ADG1 -> année de naissance significative pour ADG1, 3 et 4

13 - Sur le poids corporel ET le gain quotidien moyen: -> année de naissance significative sauf pour BW30 -> âge de la mère significatif sur période pré- et post-sevrage càd entre 0 et 15 jours puis entre 45 et 60 jours -> BW augmente en moyenne avec l’âge de la mère -> ADG 2-4 augmente avec l’âge de la mère -> taille de la portée significative sur BW: « enfants uniques » ont meilleur BW et ADG

14 2. Effets génétiques - Sur BW: -> h² assez faible (valeur la plus élevée pour BW0?) -> corrélation génétique entre tous les BW significativement différente de 0 -> corrélation phénotypique inférieure à la corrélation génétique mais toutes positives, élevées, et significativement différentes de 0

15 - Sur ADG: -> h² faible inférieure à h² pour BW -> corrélation génétique négative entre ADG1 et ADG 2 - 4, diminue avec l’âge -> corrélation phénotypique augmente avec l’âge -Sur ADG et BW: -> corrélation génétique négative entre BW et ADG1 mais pas avec ADG 2 - 4

16 Conclusions Effets fixes expliquent 24 à 41% des variances phénotypiques: Effets fixes expliquent 24 à 41% des variances phénotypiques:  Année de naissance  Taille de portée  Age de la mère à la naissance Corrélation génétique entre BW0 – 60 et BW30 – 60 permet sélection indirecte des BW 60 en sélectionnant BW0 ou BW30 Corrélation génétique entre BW0 – 60 et BW30 – 60 permet sélection indirecte des BW 60 en sélectionnant BW0 ou BW30 Corrélation négative entre BW0 et ADG1 due à la perte de poids après la naissance Corrélation négative entre BW0 et ADG1 due à la perte de poids après la naissance

17 IV. Applications pratiques Gestion des facteurs d’environnement Gestion des facteurs d’environnement Sélection précoce au 30° jour Sélection précoce au 30° jour Sélection des parents limitée car héritabilité faible Sélection des parents limitée car héritabilité faible Attention à la consanguinité Attention à la consanguinité

18 V. BIBLIOGRAPHIE « Estimation of the genetic and phenotypic variance of several growth traits of the Sicilian Girgentana goat ». B. Portolano et al. Small Ruminant Research 45 (2002) 247 – 253 « Estimation of the genetic and phenotypic variance of several growth traits of the Sicilian Girgentana goat ». B. Portolano et al. Small Ruminant Research 45 (2002) 247 – 253 « Méthodes Statistiques en Médecine Vétérinaire ». P. Leroy, F. Farnir. Les éditions de l’université de Liège (2000 – 2001) « Méthodes Statistiques en Médecine Vétérinaire ». P. Leroy, F. Farnir. Les éditions de l’université de Liège (2000 – 2001) « Cours de génétique quantitative ». P. Leroy, J. Detilleux. (2004– 2005) « Cours de génétique quantitative ». P. Leroy, J. Detilleux. (2004– 2005)