HINARI Cours de Courte Durée. Sommaire Contexte et ce quil faut faire ou ne pas faire Stratégies de recherche & Opérateurs Booléens Procédures de Connection.

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1 HINARI Cours de Courte Durée

2 Sommaire Contexte et ce quil faut faire ou ne pas faire Stratégies de recherche & Opérateurs Booléens Procédures de Connection Fonctionalités du site web HINARI Fonctionnement des partenaires Editeurs Recherche dans PubMed à partir de HINARI –Vue densemble du site Web de PubMed –Limites et Recherche Avancée –My NCBI Vue densemble du Matériel de Formation

3 HINARI HINARI est un Programme dAccès à la Recherche coordonné par lOrganisation Mondiale de la Santé (OMS) HINARI est un partenariat publique-privé entre lOMS, les Editeurs et dautres sources dinformations en santé Fournit des informations dans le domaine Biomédical et de la Recherche en Santé ainsi que des recommendations pour des institutions académiques à but non lucratif, des institutions de recherche, des départements gouvernementaux et des décideurs politiques dans les pays à faible revenue AGORA (recherche en agriculture) et OARE (recherche en environment) sont des programmes similaires

4 http://www.research4life.org/

5 HINARI: recherche en santé (8100 journaux) http://www.who.int/hinari/en/ AGORA: recherche en agriculture (2500 journaux) http://www.aginternetwork.org/en/ OARE: recherche en environnement (3900 journaux) http://www.oaresciences.org/en/ http://www.who.int/hinari/en/http://www.aginternetwork.org/en/ttp://www.oaresciences.org/en/ mise à jour: 2011 08

6 Eligibilité/Inscription Les Institutions des pays avec un PNB (produit national brut) par habitant en dessous de $1600 sont éligibles pour un accès gratuit (Bande 1) Les Institutions des pays avec un PNB (produit national brut) par habitant entre $1601 et $4700 paient un forfait de $1000 par an et par institution (Bande 2) Pour plus de détails, voir www.who.int/hinari/eligibility/en/

7 Qui est éligible pour HINARI-AGORA- OARE?

8 Principales cibles du Programme Les catégories dinstitutions éligibles sont : Universités nationales Instituts de Recherche Ecoles professionnelles (médecine, infirmier, pharmacie, santé publique, odontologie) Hôpitaux universitaires gouvernement: ministères et agences Bibliothèques médicales nationales Organisations non gouvernementales localement basées Tout membre du corps enseignant permanent ou visiteurs, le staff et les étudiants ont le droit à laccès et peuvent obtenir les identifiants de linstitution (Nom dutilisateur et mot de passe)

9 Partenaires Principaux éditeurs Elsevier Science Springer Wiley-Blackwell Sage Taylor & Francis Lippincott/Williams & Wilkins BioOne Oxford University Press Nature Publishing Other science/technical/ medical publishers Partenaires du programme Organisation Mondiale de la Santé-OMS Food and Agriculture Org. – FAO United Nations Environment Programme – UNEP Yale University Library Mann Library/Cornell University International Association of Scientific, Technical and Medical Publishers – STM Information Training and Outreach Centre for Africa National Library of Medicine Microsoft Librarians Without Borders/MLA

10 HINARI ce quil faut faire/Utilisateurs Le Matérial appartenant aux éditeurs rendu disponible à travers HINARI peut être utilisé par les utilisateurs autorisés et les visiteurs –Un utilisateur autorisé : un employer dune institution ou dun département gouvernemental, un enseignant permanant ou visiteur, un étudiant –Un visiteur: toute personne venant dans les locaux de linstitution et autorisée à y accéder à des services

11 HINARI ce quil faut faire/Articles Pour les participants HINARI en Bande 1: Les institutions peuvent donner du matériel en format imprimé ou électronique (document) aux employés de linstitution, aux enseignants, aux étudiants et tout autres utilisateur autorisé Une utilisation en zone éloignée est acceptable mais doit être limitée aux ordinateurs appartenant aux employés ou à linstitution Le corps enseignant peut placer les imprimés du matériel des éditeurs dans le lot des supports de cours ou dans les réserves électroniques des étudiants (à effacer à la fin du cours)

12 HINARI ce quil ne faut pas faire/Articles Téléchargement/Impression: lutilisateur ne doit pas télécharger la totalité des parutions dun journal ou dun livre (limite de 15% par parution de journal ou de livre) Support de cours: corps professoral –Ne doivent pas faire de profit à partir du matériel de éditeurs –Peuvent récupérer seulement le coût des impressions

13 HINARI ce quil ne faut pas faire/Articles Distribution de documents: vous ne devez pas distribuer les documents obtenus de HINARI à toute personne ou organisation en dehors des institutions inscrites Frais des documents: Linstitution ne doit pas fournir des documents moyennant un paiement à lexception des frais dimpression Téléchargement: Il nest pas permis de télécharger vers le site HINARI ou de poster le contenu de HINARI sur un site web accessible au public ou ailleurs

14 HINARI ce quil ne faut pas faire/Contenu & Logiciel Vous ne devez pas modifier, adapter, transformer ou créer un travail dérivé du contenu des éditeurs de même que les logiciels ou agent hôte.

15 HINARI ce quil ne faut pas faire/Accès Ne donnez pas le matèriel des éditeurs ou vos identifiants à dautres individus ou institutions Si dautres sintéressent à HINARI, orientez- les aux bibliothéques de leur institition Naccédez pas à HINARI lorsque vous vous trouvez en dehors de votre pays Ne mettez pas vos identifiants sur le site web de votre institution ou toute autre page internet Ne partagez ni ne publiez vos identifiants à travers des sites publiques dinternet: Groupes, Wikis ou Blogs Vous pouvez vous limiter à mettre un lien vers la page initiale de HINARI ou à donner des informations sur HINARI

16 Suggestion Modifier le modèle de ce quil faut faire ou ce quil ne pas faire (document Word) pour votre institution Imprimez ce modèle et distribuez-le aux utilsateurs de Hinari lorsque vous leur remettez le nom dutilisateur et le mot de passe Veillez à ce que chaque utilisateur lise ce quil faut faire et ce quil ne pas faire et signe quil comprend et accepte les limites Vous aurez ainsi accompli votre responsabilité en tant que founisseur de nom dutilisateur et de mot de passe de votre institution

17 REGLES DUTILISATION DE HINARI Institution: _______________ Identité de lInstitution: ___________ Mot de Passe:______________ HINARI CE QUIL FAUT FAIRE Le Matériel appartenant aux éditeurs, rendu disponible à travers HINARI peut être utilisé par les utilisateurs autorisés et les visiteurs Un utilisateur autorisé est un employer dune institution ou dun département gouvernemental, un enseignant permanant ou visiteur, un étudiant Un visiteur est toute personne venant dans les locaux de linstitution et autorisée à y accéder à des services Les institutions peuvent donner du matériel en format imprimé ou numérique (document) aux employés de linstitution, aux enseignants, aux étudiants et tout autre utilisateur autorisé Une utilisation en zone éloignée est acceptable mais doit être limitée aux ordinateurs appartenant aux employés ou à linstitution Le matériel des éditeurs peut être placé dans le lot des supports de cours ou dans les réserves électroniques des étudiants (à effacer à la fin du cours) Supports de Cours: les enseignants peuvent placer des copies du matériel des éditeurs en format imprimé ou numérique pour lusage des étudiants. HINARI CE QUIL NE FAUT PAS FAIRE Ne pas mettre les identifiants sur le site web de linstitutiton; un lien vers la page HINARI ou des informations sur le programme sont acceptables. Ne pas partager les identifiants et ne pas les publiez sur des sites publiques dans Internet: Groupes, Wikis ou Blogs. Ne pas donner le matèriel des éditeurs ou vos identifiants à dautres individus ou institutions (Si dautres sintéressent à HINARI, les orientez aux bibliothéques de leur institition) Naccédez pas à HINARI lorsque vous vous trouvez en dehors de votre pays Téléchargement/Impression: lutilisateur ne doit pas télécharger la totalité des parutions dun journal ou dun livre (limite de 15% par parution de journal ou de livre) Support de cours: le corps professoral peut récupérer seulement le coût des impressions mais ne doit pas faire de profit à partir du matériel des éditeurs Distribution de documents: vous ne devez pas distribuer les documents obtenus de HINARI à toute personne ou organisation en dehors des institutions inscrites Téléchargement: Il nest pas permis de télécharger vers le site HINARI ou de poster le contenu de HINARI sur un site web accessible au public ou ailleurs Contenu et logiciel: Vous ne devez pas modifier, adapter, transformer ou créer un travail dérivé du contenu des éditeurs de même que les logiciels ou agent hôte SIGNATURE:___________________________________ DATE:_____________IMPRIMER LE NOM:___________________________________ Pour avoir une copie de ce document, voir HINARI_Usage_Policy_Template...doc Dernière mise à jour: 2010 12

18 Exercice 1 Faire lexercice 1 du cahier dexercice

19 Planifier une Stratégie de Recherche 1.Définir votre besoin en information Quel type dinformation recherchez-vous? Qui va utiliser cette information? 2.Choississez vos mots clès Mots spécifiques, phrases clès synonymes, orthographe alternative, pluriels, majuscules Sujet plus large 3.Décider de la source dinformation portails, bases de données, catalogues Journaux ou livres Sources de références - e.g. encyclopedies, dictionaires littérature grise- exp: Publications dorganisations gouvernementales ou non gouvernementales, sites web

20 4. Senquérir du mode de fonctionnement de loutil de recherche (il peut présenter des variations) – décrit dans les diapositives suivantes 5.Lancer la recherche Utiliser les termes/mots clès choisis dans la source appropriée lire les informations de la rubrique aide 6. Revoir et raffiner la recherche être préparé à revoir et réviser votre recherche essayer dautres sources dinformation sauvegarder la recherche et les références pour un usage futur promouvoir lusage des informations de grande qualité

21 Exemple: Trouver des informations sur les problèmes de santé liés à la pollution de leau - Mots clès–eau pollution santé - thème–dégradation environmentale ou gestion de lagriculture ou santé - Synonymes - Eau: rivières, lacs, mer, côtier, eau domestique, etc - Pollution: marrée noire, chimique, biologique, toxicité, etc - Santé: maladie, pathologie, etc - Orthographe Alternative: aucune - Pluriels: rivière(s), lac(s), maladie(s) - Majuscules: exp: nom dun lac donné, dune maladie, dune région

22 Les opérateurs Booléens (Recherche) Associent des termes et localisent des résultats contenant ces termes Insérer dans la case de recherche – AND, OR, NOT Ils doivent être écrit en MAJUSCULE lors de la recherche Les opérateurs AND, NOT sont pris en compte dans une séquence gauche- droite. Ils sont pris en compte avant lopérateur OR Lopérateur OR est aussi pris en compte de la gauche vers la droite

23 Opérateur AND (Pour combiner 2 concepts) Lopérateur AND est utilisé pour combiner 2 concepts exp: hip AND fracture – dans la zone ombragée

24 Opérateur AND (Pour combiner 3 concepts) Lopérateur AND est utilisé pour combiner 3 concepts exp: hip AND fracture AND elderly – dans la zone ombragée

25 Opérateur OR (information contenant lun ou lautre terme) renal OR kidney – Dans la zone ombragée avec au millieu, les résultats contenant les 2 termes

26 Lopérateur NOT (dans un terme et non dans lautre) pig NOT guinea – dans la zone ombragée; élimine les items contenant le 2nd terme (guinea) ou les 2 termes

27 Autres fonctions du moteur de recherche Recherche par Phrase ou Proximité: … ou (…) – permet de rechercher une phrase exacteinformation literacy prevention AND (malaria parasite) Truncatures/Joker: * –Permet de rechercher une orthographe alternative child* pour child OU childs OU children parasite* pour parasite OU parasites Orthographe Alternative: ? –Peut être utilisé pour substituer une lettre à nimporte quelle position dans un mot wom ? n va chercher woman ou women

28 Africa AND (malaria OR tuberculosis) malariatuberculosis africa Africa AND (malaria or tuberculosis) – Dans la zone ombragée, lopérateur (OR) retient les citations avec chaque terme et lopérateur AND est utilisé pour combiner 2 concepts

29 Plus de techniques de recherche Recherche par champs spécifique –auteurs, titre, journal, date, url, etc. Restrictions de langue, Humains ou Animaux, Genre et autres limites (A discuter dans les LIMITS de PubMed) Classement par Pertinence –Un classement qui donne un poids supplémentaire à un document lorsque les mots clès apparaissent au niveau du titre ou sont en majuscule –Chaque document trouvé est calculé par 100% multiplié par langle formé par le vecteur de poids pour la requête et le vecteur de poids pour le document trouvé

30 Evaluation des Informations sur la toile Critères dEvaluation -Exactitude -Autorité -Actualité -Couverture -Objectivité Critères pour évaluer linformation en Santé http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/evaluatinghealthinformation. html

31 Recherche Google: Fièvre de la Dengue CDC: Dengue fever and dengue hemorrhagic fever.CDC: Dengue fever and dengue hemorrhagic fever. Le Centers for Disease Control and Prevention présente des informations détaillés sur cette infection transmis une moustique. www.cdc.gov/ncidod/dvbid/dengue/ - 37k – Dengue fever, disease information, NCID, CDCDengue fever, disease information, NCID, CDC Infectious Disease Information. Dengue Fever and Dengue Hemorrhagic Fever (Dengue Virus Infection). www.cdc.gov/node.do/id/0900f3ec80006ce4 - 17k Dengue FeverDengue Fever Factsheet with cause, symptoms, diagnosis, treatment, and prevention. www.niaid.nih.gov/factsheets/dengue.htm - 13k - Dengue Fever - MainDengue Fever - Main Subscribe to denguefever news. www.denguefevermusic.com/ - 8k – Wikipedia, the free encyclopediaWikipedia, the free encyclopedia Dengue and dengue hemorrhagic fever (DHF) are acute febrile diseases, en.wikipedia.org/wiki/Dengue_fever 39k – WHO: Dengue and Dengue WHO: Dengue and Dengue Haemorrhagic Fever Includes cause, prevalence, transmission, symptoms, treatment, and prevention. www.who.int/mediacentre/factsheets/fs117/ - 24k – eMedicine - Dengue Fever : Article by Daniel D Price, MDeMedicine - Dengue Fever : Article by Daniel D Price, MD Dengue Fever www.emedicine.com/emerg/topic124.htm - 75k -

32 The Google search engine Voici le moteur de recherche Google. Saisir vos termes de recherche dans la boite de recherche Google puis cliquer sur le bouton Google Search.

33 Google Scholar permet une approche simple pour une recherche exhaustive dans la littérature spécialisée. Vous pouvez chercher à travers plusieurs disciplines et ressources: articles revus par les pairs, thèses, livres, résumés darticles, à partir déditeurs de travaux académiques ou de sociétés professionnelles, des travaux préliminaires non encore imprimés, universités ou autres organisations spécialisées.

34 Exercice 2 Faire lexercice 2 du cahier des exercices.

35 HINARI Website Voici la page initiale de HINARI. Noter sur la colonne de gauche quil y a des liens vers les pages de Périodique, base de données et autres sources dinformation en texte intégral, Eligibilité, Inscription, Foire aux Questions et Formation. Pour accéder au site web de HINARI, saisir lURL http://www.who.int/hinari/ Nous pouvons passer à la version en Français du site en cliquant sur le lien Francais. Dans un premier temps, nous allons visualiser la page dinscription.

36 Avant dinscrire votre institution, vous devez vérifier si votre organisation est déjà inscrite ou non. Cliquer sur le lien liste dUniversités et Ecoles professionnelles de santé déjà inscrites. Cette liste est mise à jour de façon hebdomadaire. Noter que vous pouvez vérifier léligibilité de votre institution à HINARI en cliquant sur le lien (veuillez venifier les conditions deligibilite).

37 A partir du menu déroulant, cliquer sur votre pays – pour voir la liste des institutions inscrites. Pour cet exercice nous avons choisi le Viet Nam.

38 ` Voici une page du Profile dInstitution qui ne vous est pas accessible. Noter que les Détails de contact importants peuvent contenir des informations qui ne sont pas à jour. Pour une mise à jour de ces contacts, donnez le nom de votre pays, de votre institution, de votre bibliothécaire et/ou directeur et son adresse e-mail aux formateurs ou à HINARI via hinari@who.int.

39 Logging in to HINARI 1 Se connecter au site web de HINARI en cliquant sur Se Connecter (ici LOGIN). `

40 Vous devez saisir votre Nom dutilisateur et Mot de Passe dans la case appropriée, puis cliquer sur le bouton Se Connecter (Ici Login). Note: Si vous ne vous connectez pas correctement, vous naurez pas accès au texte intégral des articles.

41 Si vous ne passez pas par la page de Connection, vous aurez une deuxième option sur la page de Texte intégral des journaux, bases de donnée et autres ressources.

42 Dans cet exemple, nous avons ouvert le lien Find Journals by Subject et choisi de dérouler HIV/AIDS. Noter que seuls 7 journaux offrent un accès total tandis quil y a une longue liste de journaux qui nécessitent une Connection pour accéder à ces journaux.

43 Une fois connecté, vous allez être dirigés vers la page de Texte intégral des journaux, bases de données et autres ressources du site web. Noter le message Vous êtes connectés. La bonne connection est aussi confirmée par lurl: hinari-gw.who.int/whalecomextranet...

44 Les Journaux peuvent être accessibles à partir dune liste alphatétique (Trouver une revue par son titre). Note: Il y a aussi loption View complete list of journals (voir la liste complète des journaux).

45 Nous avons affiché la liste des journaux avec comme initiale L. Cliquons sur le titre The Lancet. La case verte signifie un accès au contenu du journal tandis que ! Signifie que laccès est refusé à linstitution (essentiellement les institutions de Bande 2 et parfois de Bande 1). Noter que les années des volumes disponibles sont précisées après le nom du journal.

46 Accessing journals by title 4 Une autre fenêtre souvre sur le site web de léditeur.

47 Pour chaque article, il y a 3 options: les formats [Abstract], [Full Text] ou [PDF].

48 Vous pouvez avoir larticle en format Full Text ou HTML qui inclut des liens vers les sections de larticle, les références et les articles apparentés

49 Avec le PDF ou Portable Document Format, vous recevez une image scannée de larticle. Ce format est similaire à loption imprimée traditionnelle. Pour télécharger un document PDF vous aurez besoin du programme Adobe Acrobat qui peut être gratuitement téléchargé à partir du site web de Adobe: www.adobe.com

50 Problèmes daccès au texte intégral des articles En utilisant la liste alphabétique Journals by title A-Z, nous avons essayé daccéder au texte intégral dun article du journal Blood. Bien que les utilisateurs de HINARI doivent avoir accès à ce journal, nous allons lutliser comme exemple pour décrire ce qui pourrait ne pas marcher.

51 Un problème daccès pourrait être posé par: 1)Une erreur de CONNECTION avec le Nom dutilisateur/Mot de Passe 2)Des problèmes techniques au site web de léditeur 3) Ou des problèmes au niveau des systèmes locaux (configuration du pare feu de linstitution de lutilisateur, configuration du navigateur) 4) Léditeur na pas autorisé laccès – principalement les pays de Bande 2 Par conséquent, vous pouvez recevoir un message de léditeur refusant laccès et demandant de se connecter ou de payer pour un article spécifique. Note: Les Noms dutilisateur/Mot de passe ne marchent pas dans ce cas.

52 Pour confirmer que vous avez utilisé les nom dutilisateur et mot de passe de votre institution, vérifiez que la mention Trouver une revue par son titre est affichée Celà est aussi confirmée par ladresse ou le URL dans le case de recherche du navigateur internet. Si vous êtes bien authentifiés, vous verrez lURL commençant par: hinari-gw.who.int/whalecomextranet.who.int...

53 Problèmes de Pare Feu de lInstitution Dans cette situation, un serveur mandataire est bloqué par le pare feu de linstitution. Veuillez vérifier auprès de votre département informatique si le pare feu de linstitution ne bloque pas le serveur mandataire. Le système informatique doit être capable daccéder au serveur mandataire de HINARI. Assurez-vous quil vous est permi daccéder à ladresse IP 158.232.242.4 à travers le pare feu de votre institution. Autrement vous ne pourrez pas vous Connecter correctement et accéder au texte intégral des articles de HINARI.

54 NOTE: Si vous avez un problème daccès au texte intégral dun journal à partir de HINARI/PubMed (pas à partir des liens au niveau de la page de HINARI), il ya une étape de plus à vérifier. (Plus de détails dans la section PubMed de ce cours). Si vous narrivez pas à accéder à un article dun journal via le Lien externe en icone de HINARI/PubMed, revérifiez en allant à la liste alphabétique Trouver une revue par son titre A-Z et vérifiez aussi les années des volumes disponibles

55 En visualisant nimporte quelle page de la liste alphabétique Journals by title A-Z, la case verte précise si votre institution a accès au contenu du journal. Le symbole ! précise que laccès est refusé à votre institution (essentiellement pour la Bande 2 quoique parfois la Bande 1). Si laccès au texte intégral dun article vous est refusé malgrès la case verte, suivez les instructions de la diapositive suivante. Noter que les années des volumes disponibles sont listées aprés le titre du journal.

56 Voici un exemple de capture décran qui a été envoyé en pièce jointe par e-mail à hinari@who.int pour un article de JEM. Elle précise que Cet artice requiert une souscription. Léditeur demande à lutilisateur de Se Connecter (Nom dUtilisateur et Mot de Passe pour une souscription individuelle) ou de payer une souscription de courte durée. Note: Cette Capture décran inclut lURL du journal. Cette information est précieuse pour le staff de HINARI qui va essayer de résoudre le problème daccès. Vous pouvez créer une capture décran en cliquant sur la touche Print Screen (ou Imp écran) pendant que vous visualisez la page web du journal. Ensuite coller (édition/coller ou control/v) le matériel sur un document world et envoyer-le en pièce jointe

57 Revérifiez que vous vous êtes bien Connecté à HINARI. Si celà nest pas le problème, notifiez au staff de HINARI (hinari@who.int) afin quil puisse enter en contact avec lEditeur pour résoudre le problème. Cet exemple est un e-mail reçu de la part dun utilisateur de HINARI en Uganda. Note: assurez-vous davoir inclu le Nom dutilisateur de votre institution, le nom du journal et de léditeur et dautres détails. Incluez aussi la capture décran qui contient lURL (Adresse Internet) du journal (voir diapositive suivante).

58 Sur cette capture décran additionnelle notez que le journal est sur la page J de la liste alphabétique des journaux Journals by Title A-Z, que la parution demandée est disponible et que par la case verte, linstitution devrait avoir accès au journal. Si le système dauthetification de HINARI avait fonctionné normalement, lutilisateur aurait eu accès à larticle de ce journal.

59 Note: Loption du lien find articles through HINARI/PubMed (trouver des articles à travers HINARI/PubMed) sera vue plus tard dans ce cours.

60 Cliquez sur le lien pour trouver les journaux par Spécialité. A partir du menu déroulant, nous allons choisir Parasitology and Parasitic Diseases.

61 Une liste alphabétique des journaux de la spécialité Parasitology and Parasitic Diseases est affichée avec des liens vers le site web des journaux. Cliquer sur Trends in Parasitology Aprés le titre du journal, les volumes/numéros disponibles sont listés.

62 En cliquant sur le titre du journal, vous ouvrez ce journal sur une nouvelle fenêtre: Trends in Parasitology.

63 I have added this slide – by clicking on Trouver les revues par langue so please write the text for this box!

64 Pour loption Find journals by publisher (Trouver les journaux par éditeur), cliquez sur le menu déroulant. Ceci est différent des services des partenaires éditeurs où les utilisateurs sinscrivent aux portails des éditeurs.

65 Nous pouvons aussi accédez au texte intégral des Services des partenaires éditeurs en choisissant à partir du menu déroulant (à discuter dans la section suivante).

66 Il ya un nombre de Bases de données et index bibliographiques (Databases and Bibliographic Indexes), is sont accessibles à partir de la liste sur le côté droit du site web. Ceci inclut des index régionaux de lOrganisation Mondiale de la Santé.

67 HINARI a aussi de nombreuses Sources de Références qui peuvent être accessibles à partir de HINARI. Beaucoup dentre elles contiennent des informations sur une variété de sujets.

68 A partir du menu déroulant de Other Free Collections, vous pouvez accéder à dautres sites web contenant le texte intégral dinformations utiles et pertinentes surtout des journaux électroniques. Vous navez pas besoin de vous connecter à HINARI..

69 Exercices 3-4 Faire les exercices 3-4 du livre dexercices.

70 Services des Partenaires Editeurs A partir du menu de Partner publisher services (Services des Partenaires Editeurs), cliquez sur le lien du site web de Elsevier Science - Science Direct. Noter que ce menu déroulant contient seulement les principaux éditeurs participant à HINARI. Pour une liste complète déditeurs et de journaux aller à la liste de Find journals by publisher (Trouver les journaux par Editeurs) sur la colonne de droite de la page.

71 Quand on ouvre les ressources des Partners publisher services (Services des Editeurs partenaires), une nouvelle fenêtre va souvrir. Nous devrons être authentifiés au nouveau site. Nous avons choisi ScienceDirect. Voici la page initiale du site web. A partir de là, nous pouvons localiser les articles ou les titres de journaux, chercher par spécialités et recevoir des alertes.

72 Searching – Science Direct Via les options de Search Science Direct, vous pouvez localiser les articles par Author (auteur), Journal/book title (titre de journal ou de livre), Volume & Issue and keywords (volume et parution et mot clé) (tout champs). Vous pouvez aussi Chercher par spécialiés et grands thèmes sur la colonne de gauche. Le site web est aussi une base de données darticles. Dans Science Direct, il ya plus de 10.400.000 articles en texte intégral.

73 Science Direct 2 En Recherche Avancée, ScienceDirect nous permet de rechercher à travers All Sources (toutes sources), Journals (journaux), Books and Images (livres et images) au sein même de la collection de Elsevier Science. Dans cet exemple, nous avons saisi le terme tuberculosis AND HIV et coché les cases All Journals (tous les journaux) et All Sciences (toutes sciences) et All Years (toutes les annés) puis nous avons cliqué sur le bouton Search.

74 HighWire Press 3 Voici la page initiale de HighWire Press. A partir de ce site, nous pouvons localiser des articles, des journaux, et mettre en place une alerte par e-mail. Le lien Free Access to Developing Economies est situé à la page initiale. Un autre lien intéressant est le Free full-text content. Il ya un lien vers les 2 pages dans le menu déroulant de Other Free Collections de la page de Texte intégral des journaux, bases de données et autres sources de HINARI. Note: Vous pouvez accéder au texte intégral des articles de HighWire Press puisque léditeur identifie ladresse IP des ordinateurs à partir des pays éligibles. Cest la seule exception permettant laccès sans utiliser les nom dutilsateur et mot de passe institutionnels de HINARI.

75 Vous arrivez à présent à la liste de Free Access to Developing Economies (Accès libre aux économies en développement) de HighWire Press. Comme noté, laccès est basé sur ladresse IP des ordinateurs et vous pouvez aller directement au site en utilisant ladresse url du site

76 HighWire Press 4 Au sein de HighWire Press, nous accédons à la page de Free Online Full-Text Articles. Notez que certains journaux sont un site libre tandis que dautres journaux ont des articles gratuits après un certain temps. Laccès dun pays éligible pour HINARI contient un mélange de titres.

77 Nous sommes à la page de la table des matières dune parution de JAMA avec les options Abstract, Full Text (HTML) et PDF des différents articles.

78 Wiley Interscience 2 Dans la catégorie Medical, Veterinary and Health Sciences, vous avez différentes options de recherche: Chercher par Categorie ou Titres de Publication et mots clés.

79 Exercices 5-7 Faire les exercices 5-7 du cahier dexercices

80 Vue dEnseble de PubMed A partir de la page web de HINARI, vous pouvez accéder à PubMed en cliquant sur Search HINARI journal articles through PubMed- Medline (Chercher les articles des journaux à travers PubMed-Medline). Note: Si vous ne vous connectez pas correctement, vous naurez pas accès au texte intégral des articles à partir de la base de données de HINARI/PubMed.

81 En Octobre 2009, laffichage de PubMed a été reconfiguré dans un format plus simple et plus ingénieux. Souvenez–vous quil est nécessaire daccéder à PubMed en passant par HINARI pour pouvoir accéder au texte intégral des articles dans PubMed.

82 La bas de la page initiale de PubMed affichée ici contient des liens hypertextes vers de nombreuses bases de données et outils produits par U.S. National Center for Biotechnology Information (NCBI)- Centre National des Informations Biotechnologiques des Etats-Unis. Noter que loption Bookshelf donne accès au texte intégral de nombreux livres électroniques.

83 La Case de recherche sur PubMed est active. Saisir vos termes de recherche sur cette case. Dans cet exemple, nous avons saisi le terme de recherche malaria infections AND Africa dans la case de Recherche. Pour lancer cette recherche, cliquez sur le bouton Search.

84 Les résultats de la recherche sont affichés sur le corps de cette page avec les options Format Summary, 20 références par Page et Listés selon les plus récemment ajoutés. Ces options de résultats constituent les options par défaut après chaque recherche. Noter les filtres additionnels pour les articles Free Full Text (Texte intégral gratuit) et HINARI. Cette option a été créée dans la recherche HINARI/PubMed sauvegardée dans My NCBI (voir module 4.5). Parmi les 3562 articles, 1471 sont disponibles via le filtre HINARI et 1091 via le filtre Free full text ( il ya quelques chevauchements).

85 Notez aussi le lien hypertexte vers Free article. En cliquant sur ce lien, vous allez être redirigé vers le format Abstract et vous pourrez accéder au texte intégral.

86 Nous avons affiché les résultats de la recherche en utilisant le format daffichage Abstract (que nous allons décrire dans les diapositives suivantes). En cliquant sur licône HINARI pour le résultat numéro 2, nous pouvons accéder au texte intégral de larticle.

87 En Aout 2008, PubMed a amélioré laffichage de Abstract. Pour des abstracts structurés, les chapitres clés (BACKGROUND, OBJECTIVE, METHODS, FINDINGS/RESULTS. CONCLUSIONS) sont listés en début de chaque paragraphe. Approximativement 25% des références de PubMed utilisent ce format.

88 Nous allons modifier le menu de Réglage dAffichage pour les options Format Abstract, 20 Résultats par Page et Affichage selon les plus récemment ajoutés. Pour activer ces options, nous allons cliquer sur le bouton Apply.

89 Les options Format Abstract avec 20 résultats par page et Affichage selon les plus récemment ajoutés sont affichées sur la ligne de Réglages dAffichage au dessus de labstract. Noter les filtres Free Full Text et HINARI.

90 Au bas de chaque référence en format Abstract, des informations sur les Types de Publication, Termes MeSH et les Financements peuvent être affichées. Cliquez sur le menu déroulant pour voir ces informations.

91 Nous revoyons le menu du Réglage dAffichage et choisissons les options Format Medline, 20 résultats par Page et Affichage selon les plus récemment ajoutés. Pour afficher cliquez sur le bouton Apply.

92 Noter laffichage des termes de Medical Subject Headings- MESH (Rubriques de Spécialités Médicales) dans loption Medline. Ces termes MeSH sont assignés par le National Library of Medicine (Bibliothèque Nationale de Médecine) pour lindexation dans PubMed. Les termes peuvent être utilisés pour rendre la recherche plus large ou plus précise.

93 Nous allons visualiser le menu déroulant de Display Settings (Réglage de laffichage) pour avoir les options Format Medline, 20 résultats par Page et afficahge selon les plus récemment ajoutés. Pour afficher, cliquez sur le bouton Apply.

94 Noter la liste des termes des rubriques de spécialités médicales (MeSH) dans loption Medline. Ces termes MeSH sont assignés par la Bibliothèque Nationale de Médecine pour lindexation dans PubMed. Ces termes sont utilisés pour rendre la recherche plus large ou plus précise.

95 Nous allons voir le menu déroulant du Réglage dAffichage pour choisir les options Format Summary, 200 résultats par Page et Selon les plus récemment ajoutés. Pour activer, cliquer sur le bouton Apply.

96 Un nombre plus grand de références par page est utile pour les pays à faible bande passante.

97 Nous visualisons le menu déroulant du Réglage dAffichage pour les options Format Abstract, 50 résultats par Page et Afficher selon linitiale du Titre.

98 En utilisant loption affichez selon linitiale du titre, on obtient dabord les réfrences dont le titre commence par A.

99 A partir du menu déroulant de Envoyez à (Send To), nous pouvons choisir les options Fichier (File), Collections, Commander (Order), Casier (Clipboard), E- mail et Ma Bibliographie. Les options Collections et Ma Bibliographie font partie de MY NCBI.

100 Vous devez cocher les cases sur la gauche des références que vous souhaitez envoyez aux options Fichier, Collections, Commander, Casier, E-mail et Ma Bibliographie. Si vous ne cochez pas ces cases, la totalité des résultats va être envoyée aux options choisies. Noter comment PubMed précise le # de références cochées

101 A partir du menu déroulant de Envoyer à, nous choisissons Créer Fichier, avec les options Abstract (Résumé) et Pub Date (date de publication). Ce sera un document à télécharger à partir de votre navigateur.

102 PubMed affiche un fichier.txt au bas du navigateur. Nous allons cliquer sur le Fichier et lafficher en utilisant Notepad. Note: dans dautres navigateurs, laffichage se fait à des endroits différents.

103 Nous voyons ici le texte à partir du téléchargement du fichier.txt en format Notepad. Vous pouvez sauvegarder ce fichier sur votre disque dur, sur une clé USB ou le graver sur un CD-Rom. Une fois sauvegardé, vous pouvez imprimer le document.

104 A partir du menu déroulant de Envoyer à (Send To), nous avons choisi E- mail, avec les options Summary et les plus récemment ajoutés. Ce sera un document à envoyer à ladresse e-mail du destinataire que vous avez saisie.

105 Dans le message en vert, PubMed notifie quun E-mail a été envoyé à ladresse e-mail du destinataire que vous avez saisie

106 Exercices 8-11 Faites les exercices 8-11 du cahier des exercices

107 Limits A partir de la page initiale de (HINARI) PubMed, nous allons cliquer sur loption de recherche par les Limites. Noter aussi les hyperliens vers les options Advanced search (Recherche avancée) et Help (Aide).

108 Les recherches peuvent être limitées en faisant des restrictions des termes par champs ou en choisissant des périodes de temps spécifiques ou des paramètres de marquage des résultats. Avant Janvier 2010, les Limites faisaient partie des options Advanced Search. Nous aborderons loutil Advanced Search à la fin du module.

109 Dans le menu de Published in the Last (Publiés dans les derniers), il ya plusieurs options allant de Toute date - Any date (par défaut) à 10 ans et Spécifier une période (Specify date range). Nous cliquons sur loption 1 an puis sur le bouton Search.

110 En utilisant loption de limite 1 an, nous avons trouvé 488 références. Les Limites Activées sont surlignées sur la case jaune avec les options (hyperliens) Change (Changer) et Remove (Enlever). Nous allons cliquer sur le lien Change pour retourner aux Limites.

111 Nous avons cliqué sur le bouton Reset (Redémarrer). Cette option a la même fonction que le lien Remove (enlever) de la page précédente – elle efface toutes les limites fixées pour en assigner dautres. Note: Si vous nutilisez pas les options Reset (redémarrer) ou Remove (enlever), votre prochaine recherche va continuer à utiliser les mêmes limites – dans cet exemple Publié dans la dernière année.

112 Nous allons faire une autre recherche avec une autre période en saisissant 2008 à 2010 dans loption Spécifier une période et on clique sur Search (chercher).

113 En utilisant les options de limites Date de Publication de 2008 à 2010, nous avons trouvé 1218 références – les articles les plus actuels sur HIV AND pregnancy (VIH et Grossesse). Nous allons retourner à la page des Limites en cliquant sur Change puis en cliquant sur Reset (redémarrer) pour effacer toutes les Limites.

114 En utilisant la même recherche HIV AND pregnancy, nous allons ajouter une limite de langue en cochant la case English puis en cliquant sur le bouton Search. Note: Vous pouvez cocher les cases de plusieurs langues.

115 En utilisant loption de limite de langue English, nous avons une recherche qui donne 10188 références et ce nombre nest pas significativement plus petit que celui de la recherche originelle. Nous allons cliquer sur le lien Change et retourner à la page des Limites.

116 En utilisant la même recherche et en maintenent la limite de langue English, nous allons cocher les 2 Limites dâge: Adolescent 13-18 ans et (Adulte jeune) 19-24 ans. Finalement, nous allons cliquer sur le bouton Search. Noter les options de Limites Espèces, Genre, Sous- ensemble qui ne seront pas abordées dans cette presentation.

117 En utilisant loption de Limite de langue English et les limites dâge Adolescent 13-18 ans et Adulte jeune, nous avons trouvé 2259 références Nous allons cliquer sur le lien Change et retourner à la page des Limites.

118 Aprés avoir cliqué sur le bouton Reset (Redémarrer) et effacé toutes les limites précédentes, nous allons cliquer sur les cases de Type darticle et choisir Practice Guideline (Recommendations sur la pratique) et Revue et les limites dâge: Adolescent 13-18 ans et Adulte jeune 19-24 ans. Nous allons ensuite cliquer sur le bouton Search. Noter quevous pouvez cliquer sur plus dune option de Type d Article.

119 Les Limites Activés et les Résultats (268) de cette recherche sont affichés sur la boite ci-dessus.

120 Nous allons à présent discuter des Options Limites de texte. Nous vous recommandons de NE PAS utiliser ces limites. Si vous cliquez sur les Liens à free full text (texte intégral gratuit), vous allez éliminer toutes les références de HINARI qui ne sont pas en même temps texte intégral gratuit. Celà va significativement limiter vos résultats de recherche.

121 Nous allons voir la Recherche avec les Limites de champs. Aprés avoir cliqué sur le bouton Reset, nous allons saisir nature biotechnology dans la boite de Recherche, puis cliquer sur le champs de recherche Journal ensuite sur le bouton Search. Noter la longue liste dans le menu déroulant et toutes les options que vous pouvez choisir.

122 La limite de Journal nature biotechnology donne 6207 références – tous les articles publiés dans ce journal. Nous allons à présent retourner à la page des Limites et utiliser une autre option de Recherche par champs.

123 Après avoir cliqué sur la boite Reset (Redémarrer), nous allons saisir ribeiro dans la boite de Recherche, et on choisit le champs Author puis on clique sur le bouton Search.

124 La limite dAuteur ribeiro donne comme résultats 6678 références. Nous allons regarder la page de Advanced Search (Recherche avancée). Note: vous avez aussi les options First Author (premier auteur) et Last Author (derniers auteurs) dans le menu déroulant de recherche par Champs.

125 Rappel: En travaillant avec les LIMITES, vous avez remarqué la ligne qui montre les options deLiens vers texte intégral, Liens vers texte intégral gratuit et Abstracts. En cliquant sur les 3 options, vous allez limiter la recherche à tous les articles en texte intégral ET ceux qui sont disponibles en tant quarticles avec texte intégral gratuit de diverses éditeurs ET ceux comportant un abstract. Par conséquent, votre liste HINARI va être limitée aussi bien aux articles à texte intégral gratuit quaux articles de HINARI – un nombre significativement plus petit.

126 Exercise 12-16 Faire les exercices 12-16 du cahier des exercices.

127 Recherche Avancée Nous allons à présent utiliser loption de Advanced Search qui vous permet dutiliser la caractéristique du bâtisseur de Recherche (Search Builder). Pour faire une recherche plus précise, vous pouvez ajouter des termes dans tous les fichiers ou dans les fichiers spécifiques en utilisant les opérateurs Booléens AND, OR, NOT. Vous pouvez accéder à Advanced Search à partir de la page initiale de PubMed ou la page de Résultats de recherche. Note: les Instructions du Bâtisseur de Recherche peuvent être affichées.

128 Nous avons ajouté le mot clé tuberculosis à la case de Recherche de PubMed, activé loption Text Word dans le Coonstructeur de Recherch (Search Builder), ajouté drug resistance à la boite de texte et cliqué sur loption Index. Nous allons cliquer sur AND plus loption Add to Search Box.

129 Aprés avoir cliqué sur AND plus loption Add to Search Box, le terme drug resistance[Text Word] a été ajouté à la case de Recherche de PubMed en même temps que le terme tuberculosis. Nous allons à présent ajouter un autre terme.

130 Nous allons cliquer sur loption MeSH Terms dans la rubrique Search Builder et insérer le terme developing countries dans la boite de recherche. Nous allons cliquer sur Show Index pour afficher les termes MeSH.

131 Les termes MeSH et Sous Titre MeSH de developing country sont affichés au niveau du menu déroulant. Nous allons cliquer sur AND plus loption Add to Search Box pour ajouter ce terme à la boite de Recherche de PubMed.

132 Les résultats de la recherche sur tuberculosis AND drug resistance AND developing countries donnent 110 références. Note: sur la liste Filtrer vos résultats, 21 sont en Texte Intégral Gratuit et 31 sont dans HINARI.

133 Nous sommes retournés à la page Advanced Search. Noter que Search History (Historique de Recherche) a été activée et affiche la recherche récente sous le #1. Dans le Module 4.4, nous allons discuter de loption Search History et comment combiner des résultats de recherche.

134 Exercice 17 Faire lexercice 17 du cahier dexercices.

135 MY NCBI Pour vous inscrire, ajouter des filtres et les options MY NCBI, vous devrez accéder directement à PubMed en utilisant ladresse suivante: www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed A partir de laffichage de PubMed, vous cliquez sur le lien MY NCBI/Sign in (connection à My NCBI) pour vous inscrire. Note: Si vous essayez de vous inscrire à partir de HINARI/PubMed, HINARI va vous empêcher de revenir en arrière aprés avoir travaillé dans MY NCBI.

136 Vous serez dirigés à la page dinscription de MY NCBI. Pour sinscrire à MY NCBI, cliquer sur le lien Register for an account (sinscrire pour un compte). Si vous êtes déjà inscrit, vous pouvez cliquer sur MY NCBI Sign In.

137 Vous devez remplir une petite page dinscription, Sélectionnez un Nom dutilisateur et un Mot de passe. Assurez-vous de noter ces identifiants pour des utilisations futures. Vous aurez aussi besoin de créer une Question Secrète pour le cas ou vous oubliez votre mot de passe.

138 Pour limage à 5 caractères, les saisir textuellement en incluant les majuscules. Une adresse e-mail est nécessaire pour lutilisation des options de MY NCBI que nous allons aborder. Si le formulaire est complet, cliquer sur Register. Rappel: assurez-vous de noter les nom dutilisateur et mot de passe.

139 Vous recevrez un e-mail de confirmation de la part de My NCBI. Allez à votre compte e-mail et ouvrez le message- efback@mail.nih.gov Pour compléter linscription, cliquer sur le lien hypertexte ci-dessousvisit the following Web sit – visiter le site web suivant. Sil ne sagit pas dun lien hypertexte sur votre navigateur, copier ladresse url et la coller sur la case de recherche de votre navigateur et cliquer sur le bouton send (envoyer).

140 Après avoir saisi ladresse du site web de My NCBI dans la case de Recherche, vous serez envoyés à cette page qui vérifie votre adresse e-mail. Connectez-vous à My NCBI en cliquant sur Sign In. Note: Sil sagit de votre ordinateur, vous pouvez cocher les options maintenez-moi connecté à moins que je me déconnecte ou sauvegardez mon nom dutilisateur.

141 Pour accéder à My NCBI, vous aurez besoin de vous Connecter (Sign In) avec votre Nom dUtilisateur et votre Mot de Passe. Note: cest la procédure une fois que vous vous êtes inscrit et que voulez retournez à votre compte My NCBI.

142 Voici la page MY NCBI qui inclue beaucoup doptions qui seront abordées – 1 er Filtres. Les filtres permettent aux utilisateurs de My NCBI didentifier des catégories darticles au sein de résultats de recherche. Ouvrir la section des Filtres en cliquant sur Manage Filters (Gérer les Filtres). Assurez-vous de maintenir les Filtres avec loption PubMed.

143 Dans loption Browse/Search for PubMed Filters (Naviguer/Chercher les Filtres pour PubMed), nous avons cliqué sur Popular. Les filtres les plus usuels sont cités sur cette page et vous pouvez choisir plus dune option. Lorsque vous choississez un filtre, la page My NCBI va actualiser et appliquer ce filtre. En cliquant sur la boite, choisir le filtre Free Full Text. Vous pouvez aussi choisir dautres filtres qui vous intéressent.

144 Noter que les filtres que vous avez choisi sont cités sur Votre liste de filtres PubMed et que le filtre le plus récemment ajouté est cité sur la boite verte. Pour ajouter un autre filtre important, cliquer sur la catégorie LinkOut.

145 Après avoir accédé à la catégorie LinkOut, saisir HINARI dans la case de recherche et cliquer sur le bouton search.

146 Une fois que loption LinkOut de HINARI apparait, cliquer sur la boite de Filtre et ajoutez ce 2 e filtre. Note: LinkOut est le programme de PubMed qui ajoute les icônes HINARI dans le format Abstract et permet laccès au texte intégral des documents.

147 Tous les 2 filtres que vous avez choisi sont affichés sur Votre liste de filtres PubMed. Vous pouvez supprimer nimporte quel filtre en le cochant sur la colonne Active. Retournez à votre première page MY NCBI en cliquant sur MY NCBI à côté de votre nom dutilisateur ou en cliquant sur le logo MY NCBI. Note: ces 2 filtres sont utilisés pour créer les tables HINARI et Free Full Text (texte intégral gratuit) qui apparaissent lorsquune recherche HINARI/PubMed est faite. Ils vont apparaitre sur nimporte quelle recherche My NCBI réalisée.

148 En utilisant la boite Search NCBI databases (bases de données de recherche NCBI), faites une recherche sur HIV AND pregnancy – en saisissant le terme dans la case de recherche et en cliquant sur le bouton de Recherche.

149 Dans PubMed, voici les résultats de la recherche pour HIV AND pregnancy. Cliquez sur lhyperlien Save search qui est disponible si vous êtes connectés à votre compte MY NCBI.

150 My NCBI vous donne loption de sauvegarder ou dannuler une recherche donnée. En sauvegardant cette recherche, vous pouvez recevoir des e-mail qui vous donnent la liste des nouvelles références darticles en texte intégral gratuit ou disponibles dans HINARI sur ce sujet.

151 My NCBI a confirmé que cette recherche a été sauvegardée. Vous avez à présent loption de recevoir des mises à jour par e-mail ou de ne pas recevoir des mises à jour (sur des articles publiés sur ce thème). Dans ce cas, les options de mise à jour par e- mail choisies sont: Yes (oui), once a week (une fois par semaine) par Monday (lundi) dans le Format Abstract (dautres options sont texte ou MEDLINE) et recevoir 50 items (articles). Choisissez les options que vous voulez et cliquez sur le bouton Save (sauvegarder).

152 Quand vous retounez à la page My NCBI, vous pouvez voir une liste de recherches sauvegardées dans la boite Saved Searches (recherches sauvegardées) – dans la case HIV AND pregnancy et malaria AND bednets. Vous pouvez reproduire une recherche en cliquant sur le titre de la recherche. Vous pouvez aussi supprimer la recherche en cliquant sur Managed Saved Searches. Note: le-mail que vous recevez de MY NCBI va comporter des références darticles récemment publiées. Pour avoir le texte intégral dun article, vous aurez besoin de retourner à HINARI et de localiser une parution donnée dun journal.

153 Nous sommes retournés à la page initiale du site web et nous voulons noter les ressources Training (Formation) et Utilisation de HINARI. Nous allons accéder à la sous-page Formation.

154 Add screen capture training page Cette page contient une série de modules qui détaillent beaucoup de caractéristiques de HINARI que nous avons abordées – mais avec plus de détails. Note Le Module 7 qui contient des informations sur des ressources additionnelles disponibles dans le site web de HINARI.

155 Cette diapositive additionnelle souligne le Brief training (Formation brève), Formation de courte durée sur HINARI et divers Outils de Formation plus des Présentations. Noter aussi le matériel Aptitudes a être auteur – série de modules écrits pour assister les chercheurs dans la publication de leur résultats.

156 Exercices 18-22 Faire les exercices 18-22 du cahier dexercices. Vous avez bouclé le Cours de Courte durée de HINARI! Pour des instructions plus poussées, aller à la page de formation de HINARI à www.who.int/hinari/training/en/ Mise à jour du Juin 2011