SISMER Banque de données de physique et chimie Marine M. Fichaut N

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1 SISMER Banque de données de physique et chimie Marine M. Fichaut N
SISMER Banque de données de physique et chimie Marine M. Fichaut N. Carn F. Le Hingrat

2 L’EQUIPE SISMER Direction : Catherine MAILLARD
Secrétariat : Béatrice MILOSAVLJEVIC Banque nationale de physique et chimie + catalogues Michèle FICHAUT Françoise LE HINGRAT Nolwenn CARN Banque Nationale de géologie te géophysique Eric MOUSSAT Céline CORDIER Guillaume GALIBERT (CDD) Océanographie opérationnelle CD ARGO/CORIOLIS Loic PETIT DE LA VILLEON Vincent BERNARD Christine COATANOAN Armel BONNAT Philippe LAINE – Pascal ROGARD Fabrice LEBEL (CDD) Données de référence (Données maillées, données géographiques) Michel BELLOUIS Patrick DANEL

3 Données de Physique / Chimie
Données temps différé des campagnes françaises ou des programmes internationaux CTD ( stations) BOUTEILLES ( stations) SERIES TEMPORELLES 2075 Courantomètres 123 Chaînes de thermistances 39 Piège à sédiments 46 Marégraphes

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7 Enrichissement de la BDD

8 Répartition temporelle

9 Circuit des données Demande de données Contrôle qualité
Fichier de données Format MEDATLAS Flags qualité = 0 (pas de CQ) CONVMED reformatage BDD SERVEUR SISMER Indexation P50 SCOOP META DATA format Flags qualités Renseignés Contrôle qualité Contrôle doubles Demande de données NAUTILUS Fichier de données Format X ASCII

10 Recherche des données manquantes
A partir de : Catalogue des campagnes océanographiques françaises Une fois par an : scientifiques contactés pour savoir s’ils peuvent nous remettre leurs données de : bouteilles, CTD, séries temporelles (courantomètres, chaînes de thermistance, marégraphes). Nouvelles données mises au format MEDATLAS, contrôlées et archivées

11 Récupération des données
2004 : temps écoulé entre la demande et la réception des données 2004 : Nombre de jeux de données reçus

12 Format MEDATLAS Format ASCII auto-descriptif adapté aux mesures au point fixe : séries temporelles et aux profils verticaux Méta-données Information sur la campagne ou le mouillage Commentaires Méthodes de mesures Description des capteurs …. Nombre de paramètres variable d’un profil vertical ou d’une série temporelle à l’autre au sein d’un même fichier de données

13 MEDATLAS FORMAT

14 Contrôles qualité (QC)
QCO : Contrôle automatique du format QC1 : Contrôle automatique et visuel des en-têtes stations QC2 : Contrôle automatique et visuel des données un indicateur de qualité à chaque valeur numérique (Échelle GTSPP) 1 2 3 4 5 9 Pas QC Bon Hors stat Douteux Faux Modif. Défaut

15 QC des entêtes de stations
Contrôle des dates et des positions Vitesse du navire Route du navire Bathymétrie

16 QC données : profils verticaux
QC multi-paramètres Pics Valeurs régionales Profils constants Inversion de densité (T,S) Rapports de Redfield (nutritifs) Comparaisons avec les statistiques existantes (Levitus, Medatlas) Visualisation Superposée Décalée

17 QC données : séries temporelles
QC multi-paramètres Pics Valeurs régionales Pression mesurée comparée à prof. Capteur Date croissante Comparaison avec la statistique sur la série temporelle Visualisation Superposée Décalée

18 Durée des QC Temps avant contrôle Durée contrôle
Disponibilité personnel SISMER Informations manquantes Disponibilité fournisseur Durée contrôle Erreurs sur les dates, positions ou sur les données Disponibilité fournisseur

19 Projet associé : MATER MAss Transfer and Ecosystem Response
Projet Européen ciblé Méditerranée Projet multidisciplinaire : biologie, physique, chimie, geologie, … Avec de nombreux partenaires 53 groupes de recherche de 13 pays 5 équipes pour la gestion de données

20 Produit final : CDRom Documentation HTML sur : Le projet
Les partenaires Les Méthodes de contrôle qualité Le format MEDATLAS Le jeux de données Les documents de référence du projet Cartes de localisation Fichier de données SELMATER Logiciel d’extraction et de visualisation des données

21 Projet associé : MEDAR/MEDATLAS II
MEDiterranean Data Archeology and Rescue (Godar component) Compilation et archivage : Température, salinité et les principaux paramètres biochimiques (oxygène, nutritifs, …) dans la Méditerranée et la Mer Noire Calcul d’une climatologie pour les paramètres principaux Publication et distribution du jeux de données et de la climatologie à la communauté scientifique

22 Produit final : CDRom Un jeu de 4 CDRoms CDROM 1
documentation HTML sur le projet et le jeux de données Inventaire des campagnes CDROM 2 Jeu de données +SELMED : Logiciel d’extraction et de visualisation des données Format de sortie : MEDATLAS, CSV ou ODV. CDROM 3 et 4: cartes, figures et fichiers Netcdf Climatologie Un jeu de 4 CDRoms

23 Défi Golfe de Gascogne (IFREMER)
profils de Température 21971 profils de Salinité

24 Données ADCP 3 navires IFREMER (Transect) 1 navire SHOM (Vmdas)
L’ATALANTE : NB 75 et NB 300 THALASSA : NB75 et BB 150 SUROÎT : BB 150 1 navire SHOM (Vmdas) BEAUTEMPS-BEAUPRE : NB 38 et BB 150

25 Mode de transmission Depuis 2001, configuration standard sur les navires IFREMER Données brutes transmises au SISMER à la fin de la campagne en temps différé Depuis 2004, Beautemps-Beaupré transmet les données d’ADCP en temps réel, une fois par jour Données pré-traitées par le logiciel VMAS d’acquisition Données traitées par le SISMER à la fin de chaque campagne

26 Traitement des données
Logiciel CASCADE développé à l’IFREMER par le Laboratoire de Physique des Océans (Matlab) 4 étapes de traitement : Reformatage des données brutes au format Oceansites NetCDF Conversion des données en coordonnées terrestre, filtrage, moyenne Calcul des vitesses absolues Contrôle qualité des données

27 Contrôle qualité de l’ADCP
Des flags sont attribués aux valeurs numériques

28 ADCP : 63 campagnes traitées

29 Données diffusées 2 fichiers NetCDF par campagne
1 fichier avant filtrage 1 fichier filtré Date/heure, Latitude, Longitude, Profondeur, N/S, E/W components, Vitesse verticale du courant, Echo intensité 1 fichier compressé d’archive Cartes des sections, images et vecteurs des sections 1 rapport d’exploitation Information sur le collecte des données Information sur les contrôles qualité et sur les traitements appliqués aux données Les problèmes éventuels rencontrés avec les données

30 Exemple de QC Transit ATALANTE avril 2005 Route du navire
Bathymetrie et route du navire Flags pour les données ADCP de tout le transit

31 Vecteurs de courant Section Panama - FdF 30 - 50 m

32 Images d’une section Section Panama – FdF Section Panama – FdF
Composante E/W du courant Section Panama – FdF Composante N/S du courant