A L I M E N T A T I O N A G R I C U L T U R E E N V I R O N N E M E N T.

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1 A L I M E N T A T I O N A G R I C U L T U R E E N V I R O N N E M E N T

2 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Présentation générale du département MIA Quelques exemples de réalisations Eléments de cohérence et complémentarité avec lINRIA

3 Journées INRA-INRIA Mai 2007 -52 chercheurs; 35 ingénieurs; 23 techniciens et administratifs; 21 enseignants chercheurs ; 51 doctorants (au cours des 4 dernières années) -Discipline principale des chercheurs : Statistique : 66 % Informatique : 23 % Système dynamique et contrôle : 11 % Le département MIA

4 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Politique scientifique : Développer de la recherche dans nos disciplines pour faire avancer les sciences de la vie et de lenvironnement Privilégier les grands enjeux exprimés par nos partenaires des autres départements de lINRA Et sélectionner ceux pour lesquels nos disciplines peuvent apporter un plus décisif (essentiellement par de la recherche, mais aussi ingénierie et expertise). Le département MIA

5 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Deux champs thématiques : Bioinformatique, mathématiques et informatique pour les modèles issus du gène à lindividu Localisation de régions fonctionnelles dans les séquences et prédiction de leur fonction Cartographie génétique Analyse de données dexpression : transcrits et protéines Réseaux de régulation et biologie des systèmes Modèles et décision pour lagriculture, lenvironnement et lalimentation Ecologie et environnement Epidémiologie Gestion dagro-éco-systèmes Analyse du risque alimentaire Conception et conduite de procédés Le département MIA

6 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Nos priorités méthodologiques visent à dépasser les clivages entre disciplines Représentation et exploitation dinformations dynamiques et spatialisées Algorithmique et complexité calculatoire Modélisation et analyse statistique des données Système dinformation et ingénierie des connaissances Modèles pour laction Systèmes complexes Analyse et gestion du risque Le département MIA

7 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Le département MIA

8 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Quelques réalisations

9 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Quelques réalisations Une structure de gène est un chemin dans le graphe Les arrêtes sont pondérées par une « probabilité conditionnelle » (HMM) à paramètres variables Le meilleur chemin est déterminé par un algorithme linéaire en temps Eugene: détecteur de gène

10 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Quelques réalisations Eugene: détecteur de gène

11 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Quelques réalisations Meta analyse de QTL

12 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Quelques réalisations

13 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Projets et réalisations Projet Selommes : flux de gènes OGM à léchelle du paysage

14 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Projets et réalisations Quelques réalisations

15 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Projets et réalisations Quelques réalisations

16 Journées INRA-INRIA Mai 2007 Il y a de grands besoins en mathématiques appliqués et en informatique pour répondre aux enjeux des sciences de la vie et de lenvironnement complémentarité géographique complémentarité méthodologique construire des réseaux sur des enjeux méthodologiques Cohérence et complémentarité avec lINRIA