UNIX Pour débutant. Applications En directNavigateurCourrierMode consoleFenêtrage http smtp ssh X Protocoles de communication Protocoles de communication.

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1 UNIX Pour débutant

2 Applications En directNavigateurCourrierMode consoleFenêtrage http smtp ssh X Protocoles de communication Protocoles de communication Windows DirectX Windows Max OS Linux serveur

3 Windows - Linux Disques - Processeurs Windows Max OS Linux titus star6 ssh telnet ou ssh /home /genomics IGBMC Window s ssh

4 login login login: ripp password: tres_secret star6_ripp_> star6_ripp_> pwd /home/ripp star6_ripp_> star6_ripp_> logout

5 Les commandes élémentaires l pwd l ls l cat fichier l more fichier l rm fichier l mkdir repertoire l rmdir repertoire

6 ...élémentaires toujours, l mv ancien nouveau l cp source destination l cd repertoire l cd.. chmod 755 fichier rwx r-x r-x chmod 644 fichier rw- r-- r-- chmod 640 fichier rw- r-- ---

7 ...élémentaires encore ? l alias llt ls -rt l setgscope l man commande l apropos truc l date l logout

8 Une commande, c'est... l ls commande UNIX l xplor fichier exécutable (compilation, link) l settex alias l sauvetout shell script l ~ripp/prog/coucou avec chemin d'accès explicite l rehash shell built-in command

9 C'est toujours et uniquement... l un alias taper alias pour les connaitre tous l une Built-In Command du shell utilisé l un fichier qui se trouve dans le path which commande commande aliased to quelquechose commande : shell built-in command /usr/bin/commande

10 Un fichier exécutable l on le reconnait par – file fichier coeff alpha executable binay l obtenu par compilation et link – Fortran, C, C++... ou fichier système

11 Un shell script l sh, ksh, csh, tcsh, tclsh, perl,............................................. shell que j'aime: tcsh l c'est un fichier texte contenant.................................. des commandes l la première ligne contient le nom du shell #!/bin/tcsh................. qui est le programme qui interprète vos commandes

12 ... le shell script l on y met des commandes l on l'exécute en tapant le nom du fichier – ça crée un sous-process l qui exécute – /etc/csh.cshrc – ~/.cshrc – les commandes du fichier l qui oublie tout avant de revenir au process ou alors (pour les nuls) : source fichier

13 Le path Le path, l quand on tape une commande l on exécute un fichier l qui se trouve sur un disque l dans un répertoire cité dans path le path

14 le path, l est prédefini echo $path l est modifié par certaines commandes setmolscript l peut être modifié par set path=dir $path addpath dir (rr)

15 le path. l si vous voulez qu'un fichier /bidule/chose/fifi l devienne une commande fifi l deux solutions – addpath /bidule/chose – ln -s /bidule/chose/fifi ~/bin/fifi

16 Les plaisirs du lien l ln -s fichier lien l ln -s /home/ripp/moyenne /bin/moy c'est comme si /home/ripp/moyenne était copié l on fait vraiment comme si /bin/moy existait l ls -l /bin/moy (lrwx--... /bin/moy -> /home/ripp/moyenne) l rm /bin/moy (/home/ripp/moyenne reste) l rm /home/ripp/moyenne (le lien, seul, reste)

17 Input Output Pipeline 1/3 l Un programme « sympa » –lit des données en entrée ( input = stdin ) –calcule –écrit les résultats en sortie ( output = stout ) –signale les erreurs ( error = stderr ) xplor fichout

18 Input Output Pipeline 2/3 Si on ne met pas –lentrée standart est le clavier –la sortie standart est lécran –la sortie erreur est aussi lécran (>2 ou >&) l … mais si on veut que : la sortie de lun est lentrée de lautre ?

19 Input Output Pipeline 3/3 l progA < fichin | progB l progA | progB | progC > fichou Attention tous les programmes nacceptent pas ce mécanisme stdin stdout l Ne pas confondre entrée standart (avec <) et arguments

20 ... des questions?... plus de question?... merci !