27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 1/13 27 ème journée ISS France Caractérisation de milieux cellulaires partiellement observé par imagerie.

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1 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 1/13 27 ème journée ISS France Caractérisation de milieux cellulaires partiellement observé par imagerie microscopique 3D David Legland - INRA TPV-URPOI Transformation des Produits Végétaux Unité de Recherche sur les Polysaccharides, leur Organisation et leurs interactions

2 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 2/13 Plan Contexte Développements – Correction des défauts dacquisition – Amélioration de limage – Segmentation – Mesures et estimations Prolongements

3 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 3/13 Contexte biologique Objectif : caractériser un matériau cellulaire végétal Paramètres physico- chimiques, mécaniques, sensoriels ou génétiques Analyse par imagerie

4 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 4/13 Démarche générale Échantillonnage Prélèvements et acquisition images Segmentation Développement destimateurs Étude des différences entre variétés

5 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 5/13 Choix et échantillonnage du matériau Étude du péricarpe de tomate Traversées le long du péricarpe Échantillonnage uniforme à la surface de la tomate

6 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 6/13 Acquisition des images Pile dimages (512 x 512 x 30)

7 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 7/13 Correction baisse de luminosité Image de référence Image à corriger Image corrigée Utilisation du « Matching » dhistogramme

8 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 8/13 Amélioration des lignes Maximum de plusieurs filtres directionnels

9 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 9/13 Segmentation : Ligne de partage des eaux Détection des marqueurs : minima étendus + filtrage morphologique Image amélioréeDétection des minima Ligne de partage des eaux Traitement morphologique

10 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 10/13 Segmentation 2D

11 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 11/13 Segmentation 3D

12 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 12/13 Prolongements : Classification des différentes phases Développements destimateurs adaptés à la nature partielle des observations Cartographie des propriétés géométriques des espaces cellulaires et intercellulaires

13 27 ème journée ISS France - jeudi 5 février 2004 - 13/13 Deux variétés de tomate : Cameron Quest