Ordre du jour 10h45 Tour de table 11h00 Actions transversales de CIMENT 11h30 Nomination de nouveaux experts –11h45-13h30 repas au Magellan 13h30 Présentations.

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1 Ordre du jour 10h45 Tour de table 11h00 Actions transversales de CIMENT 11h30 Nomination de nouveaux experts –11h45-13h30 repas au Magellan 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets 16h00 Questions au conseil scientifique 16h30 Délibération du Conseil

2 Ordre du jour 10h45 Tour de table 11h00 Actions transversales de CIMENT 11h30 Nomination de nouveaux experts –11h45-13h30 repas au Magellan 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets 16h00 Questions au conseil scientifique 16h30 Délibération du Conseil

3 Contexte général calcul Partenariat avec le CEA –financement 2000-2006 (Région - CEA) 7MF –redéfinition et renforcement du partenariat dans le contexte du déménagement vers Paris du centre de calcul du CEA Utilisation des centres de calculs nationaux –IDRIS, CINES Développement de projets « calcul » mésoscopiques au sein des universités de Grenoble

4 Équipement pour le calcul Financement –Appel à projet national de Guy René Perrin, Nov 98 : 2MF –CPER 2000/2006 : 15MF –Compléments CNRS, IMAG, INPG, INRIA, etc. Projets –Observatoire, MIRAGE, Grappe de PC, Chimie calculatoire (CECIC), BioIMAGe, PhyNum –Formation transversale au niveau des écoles doctorales

5 Coordination du projet Comité de pilotage du projet : définit les grandes orientations Participation à la journée CINES-IDRIS de l’automne 1999 et de l’automne 2000 (26 octobre), CEA (Visualisation, hier) Mise en place d’un séminaire trimestriel (2000) http://ujf-grenoble.fr/CIMENT Structuration des projets de calcul au niveau des universités Grenobloises par des regroupements de projets : –“ Couplage modélisation hydrologique et météorologique ” inclus dans MIRAGE. –Génétique, bio-informatique et imagerie médicale (BIoIMAGe). –Création du CECIC :Centre d ’Expérimentation du Calcul Intensif en Chimie. –Le projet PhyNum pourrait s’associer au SCCIOG. Recrutement d’un Ingénieur de Recherche UJF pour le projet MIRAGE : Laurence Viry (mais manque encore d’ingénieurs sur nos projets) Accès prioritaire aux réseaux rapides au niveau du campus

6 Evolution réseau Le cas du Campus –Etat actuel –Etat en Q1-2002 Le Man Grenoblois –Etat actuel –Etat en Q4-2002 Jacques.Eudes@ujf-grenoble.fr Centre de Ressources Informatiques de Proximité - UJF

7 CIMENT Campus Cœur Giga/Eth100 (en production) Bâtiment OBS Bâtiment IRIGM Mirage Mécanique Mirage LMC Mirage Biologie Mirage Glaciologie Sortie Campus Imag Secu-UJF Ethernet 100 Ethernet 1000 Memory Channel Ethernet 100 (projet) Ferme Osug LPG Pôle Santé

8 CIMENT Campus Cœur Giga/Eth100 (Evolution Q1-2002) Bâtiment OBS Bâtiment IRIGM Mirage Mécanique Mirage LMC Mirage Biologie Mirage Glaciologie Sortie Campus Imag Secu-UJF Ethernet 100 Ethernet 1000 Memory Channel Ethernet 1000 (projet) Ferme Osug LPG Pôle Santé

9 Le réseau métropolitain Grenoblois MetroNet phase 1 -> Q4-2000/Q3-2002 Vers Paris (NIO2 RENATER) NRD 622 Mb vers Lyon, Puis 2,5Gb vers Paris Plaque métro 60 Mb Campus 100 Mb Inria 100 Mb Viallet 100 Mb CEA 100 Mb CNRS Technologie IP / Ethernet 100 commuté Technologie IP / ATM

10 Le réseau métropolitain Grenoblois MetroNet phase 2 à compter de Q4-2002 Vers Paris NRD 622 Mb Plaque métro 100 Mb Campus 1000 Mb Inria 1000 Mb Viallet 1000 Mb CNRS 1000 Mb CEA Technologie IP / Ethernet 1000 commuté

11 Collaborations autour du projet –Scientifique Thèses entre Observatoire et TIMC, ID et LMC, ID et Observatoire, Obs et PhyNum, … –Algorithmes d'ordonnancements optimaux en temps et en memoire : Etude de cas sur des problemes en mecanique quantique. These de N. Maillard, co-encadree par P. Valiron (LAOG) et J-L. Roch (ID). –une these coencadrées depuis 2 ans par le LGIT et le LPM2C : Renaud Hennino : il fera la partie presentation scientifique. (phynum - obs) Collaborations inter-projets –Simulations de la propagationdes ondes sismiques dans la croÛte terrestre (B. Van Tiggelen (LPMMC), M. Campillo (LGIT)) –Analyse génétique et localisation spatiale: Stéphanie Manel et Françoise Berthoud (BioIMAGe et PhyNum):

12 Collaborations autour du projet –Technique Partage des expertises –Séminaires, liste de diffusion, ingénieurs (bureau partagé au LMC), rapprochement du projet PhyNum de celui de l’Observatoire. Ex : » Portage de l'interface de programmation parallele Athapascan, developpee au laboratoire ID, sur les machines SMP de l'Observatoire. » Participation croisée à des commissions techniques d’appel d’offre pour gappes (ID-BioIMAGe) »collaboration technique entre Françoise Bertout (phynum) et Francoise Roch (obs) : une journée par semaine depuis 1 an. Expérimentation du calcul hétérogène –projet Data Grid (participation de ID, expérimentation de globus) –Chimie quantique sur un serveur et une grappe de PC (Obs.) Expérimentation de l’administration et du calcul sur grappes distribuées –Projet MRCT CNRS de Philippe Augerat (ID) « administration grappe de PC distribuée ». Partenariat (ID, LPMMC, LEGI- CORIOLIS, Observatoire de Grenoble, PRISM, TIMC)

13 Formation doctorale –Un projet de formation au Calcul Haute Performance transversale aux écoles doctorales => Formation accompagnée de TP (janvier 2002) Toutes les écoles doctorales relatives à CIMENT (Math applis et Info, Chimie, Physique, EDIV,…) participent. Accueil des cours et des TP au sein de l ’UFR IMA (mise en place des TP possible sur les pôles si c’est plus simple).

14 Formation doctorale –sous la forme de deux modules Introduction au calcul réparti –Introduction au parallélisme et au calcul intensif –Formation à l’optimisation de code, à MPI et à OPEN MP –Utilisation de bibliothèques de calcul scientifique (ScaLaPack, …) Modélisation numérique et calcul intensif –Différents problèmes apportés par les communautés utilisatrices, leur modélisation et leur résolution sur une grappe de PC, formeront les TP (MIRAGE, BioIMAGe, PhyNum,…) –Devra évoluer en cohérence avec le projets de formation doctorale de PhyNum prévu pour 2002-2003

15 Observatoire de Grenoble P.Valiron et F. Roch LAOG, LGIT, SGEP du LIS Projet : calcul intensif en astrophysique et géophysique. Solution retenue : IBM (SMP 16 procs 375MHz, 16Go, 24Gflops crête et 2 Quadri-Pro, SMP, 4 Go). Solution centralisée. Financement : 500kF COMI CNRS +165kF quadriennal UJF ; 600kF Ministère (CIMENT) + 495 KF quadriennal UJF (soutien du ministère quadriennal 400kF/an) État d’avancement : fin de mise en place juillet 2000 (coût 1,76MF) Projets scientifiques (une vingtaine de thésards) : évolution stellaire, disque proto-planétaire, astrochimie quantique : dynamiques microphysique, simulation numérique MHD et hautes énergies, propagation des ondes sismiques, reconstruction en sismologie, champs magnétique terrestre, modélisation de l ’ionosphère dans les zones polaires, Interactions cinétiques soleil/terre,...

16 Plate forme Mirage E. Blayo, L.Viry LMC, LEGI, LTHE, LGGE, LEA Projet : modélisation, calcul, visualisation dans les problèmes d’environnement et climat. 7 DS20 (bi-pro alpha EV67, 7x2,5Go, Memory Channel) et 3x100Go DD ; LSF et TotalView. Solution répartie sur 3 sites.Solution retenue : 7 DS20 (bi-pro alpha EV67, 7x2,5Go, Memory Channel) et 3x100Go DD ; LSF et TotalView. Solution répartie sur 3 sites. État d’avancement : En exploitation depuis janvier 2000 (1,5MF) Financement : 1,75MFFinancement : 1,75MF [ 600kF MENRT, 650kF COMI CNRS, 100kF BQR INPG, 60kF CNES, 200kF des laboratoires ] + 200kF INRIA, soutien du ministère (quadriennal 60kF/an) Projets scientifiques (une quinzaine de thésard) : modélisation des calottes polaires, couplage glace-atmosphère, Modélisation océanique, assimilation de données océaniques, modélisation interface sol-végétation atmosphère, hidrologie en zone montagneuse, assimilation de données avec Méso-NH.

17 Pôle de chimie calculatoire S.Perez et P.Vatton LEDSS, CERMAV, Cristallographie, LEOPR, DPM Projet : création du CECIC : Centre d ’Expérimentation du Calcul Intensif en Chimie Solution : Une machine IBM SP (3 quadri Pro Power III 3x8Go) + une machine SGI 0200 quadri pro,4Go (logiciels de modélisation moléculaire) Avancement : En cours de démarrage. Financement : 1.5MF dans le cadre du CPER + 0,5MF CNRS + 462kF sur fonds propres labo Projets scientifiques (une dizaine de thésards) : Chimie quantique, Mécanique/Dynamique Moléculaires, Etat condensé, Recherches des Conformations Bio-Actives, Bases de données

18 Grappe de PC B.Plateau, P. Augerat ID, SIRAC et ReMaP (ENS L) Projet : expérimentation des systèmes et du calcul distribué sur une grappe de PC. Solution envisagée : 100 PC (bi-pro, 1Go) disposant d’un réseau rapide de technologie myrinet. Solution massivement distribuée. État d’avancement : expérimentation locale le i-cluster (225 PIII en réseau ethernet : no=385 du TOP 500/81,6Gflops). Un appel d’offre infructueux en cours de réactualisation. Simplification vers une solution grappe très intégrée Financement : 5MF (0,8MF MENRT, 0,3MF ENSL + CPER : 2,5MF INRIA et 1,2MF Région) Projets scientifiques (une dizaine de thésards) : outils d’exploitation et méthodes de programmation (projet RNTL : CLIC Bull, Mandrake,UJF distribution linux pour cluster incluant MPI/OPEN MP,…, athapascan).

19 Projet : Imagerie et modélisation biomécanique médicales Biologie informatique et analyse génétique spatialisée. Solution : modifiée au printemps 2001 pour migrer d ’une solution à base d ’alpha vers une grappe de PC bi-pro, 2Go, en réseau ethernet. Avancement : lié à grappe de PC. Financement : deux tranches CPER 800kF 2001, 1MF 2002(?) Projets scientifiques (une quinzaine de thésards) : reconstruction rapide en imagerie 3D, atténuation et diffusion en imagerie nucléaire (quantification),IRMfonctionnelle 3D, modélisation biomécanique d ’organes, Equations de Maxwell pour la modélisation de neurones, pôle bio-informatique (étude des structures génétiques spatiales, identification de matrices d ’interaction génique, modélisation du génome,…) Projet BIOIMAGE L. Desbat G. Bourrel TIMC-IMAG, Unité INSERM 438, RMN Bioclinique, Laboratoire de Biologie des Populations d'Altitude

20 Projet PHYNUM A. Pasturel et F. Berthoud IPMC (Louis Néel, Basses Températures et Physique Numérique) Solution envisagée : centralisée, 16 à 32 proc, 16 à 32 Go mais évolution possible vers une grappe de PC Avancement : 2002, couplage envisagé avec l’Observatoire. Financement : Dans le cadre du CPER (1,5MF 2002) Projet scientifiques (une quinzaine de thésards) –Simulations de la propagation des ondes sismiques dans la croûte terrestre -Etude de la diffusion multiple de la lumière en milieu complexe -Supraconductivité dans des systèmes de dimension réduite -Transport thermique dans un conducteur mésoscopique -Manipulation des états quantiques dans des nanocircuits supraconducteurs -Elasticité de la croissance cristalline et auto-organisation de nanostructures -Structures d'équilibre et dynamique réactionnelle de surfaces -Thermodynamique et Transition de Phases. -...

21 Perspectives Maturation des grappes de PC (matériel et logiciel) => solutions économiques du calcul intensif => Plus grande diffusion Nécessité de former les étudiants aux techniques de calcul intensif Renforcement des actions transversales –Projet d’administration centralisée de grappes de PC distribuées (Philippe Augerat) –Formation transversale au niveau des écoles doctorales

22 Perspectives Projet ACI Grilles –Proposition CIMENT en avril 2001 2 postes de CDD 50kF de fonctionnement sur 2 ans –Octobre 2001 (?) Dans le cadre de CIMENT, pas de demande de crédit d’équipement, mais CDD (éventuellement fonctionnement). Coordonnés par « grappe de PC » Accompagnement/prolongement du projet MRCT CNRS de Philippe Augerat d’administration à distance de grappe par un soutien aux utilisateurs aux techniques de calcul réparti

23 Financement dans le cadre du CPER => Besoin de postes d’ingénieurs pour soutenir les projets BioIMAGe : + AFIP CNRS pour un AI (TIMC) Grappe de PC : +/- départ à mi-temps de P.Augerat => Financement 2002 = Agglo et Ville de Grenoble

24 Ordre du jour 10h45 Tour de table 11h00 Actions transversales de CIMENT 11h30 Nomination de nouveaux experts –11h45-13h30 repas au Magellan 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets 16h00 Questions au conseil scientifique 16h30 Délibération du Conseil

25 Pilotage et évaluation du Projet Comité de pilotage du projet –Les responsables des projets (réunion en gros trimestrielle) Conseil scientifique : –Un expert extérieur par projet –Un expert du parallélisme (président d’ORAP) –Les représentants des institutions et des établissements (CNRS, MENRT, IMAG, INPG, INRIA, UJF) –Les responsables des projets –Une réunion annuelle (28/09/2000, 27/09/2001)

26 Pilotage et évaluation du Projet Conseil scientifique : –Un expert extérieur par projet => Trois nouveaux experts CECIC BioIMAGe PhyNum

27 Ordre du jour 10h45 Tour de table 11h00 Actions transversales de CIMENT 11h30 Nomination de nouveaux experts –11h45-13h30 repas au Magellan 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets 16h00 Questions au conseil scientifique 16h30 Délibération du Conseil

28 Ordre du jour 10h45 Tour de table 11h00 Actions transversales de CIMENT 11h30 Nomination de nouveaux experts –11h45-13h30 repas au Magellan 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets 16h00 Questions au conseil scientifique 16h30 Délibération du Conseil

29 Grappe de PC Denis Trystram et Philippe Augerat 13h30 - 14h00

30 MIRAGE Eric Blayo et Laurence Viry 14h00 - 14h30

31 SCSI Pierre Valiron et Françoise Roch 14h30 - 15h00

32 CECIC Serge Perez et Pierre Vatton 15h00 - 15h20

33 BioIMAGe Laurent Desbat et Guy Bourrel 15h20 - 15h40

34 PhyNum Alain Pasturel et Françoise Berthoud 15h40 - 16h00

35 Ordre du jour 10h45 Tour de table 11h00 Actions transversales de CIMENT 11h30 Nomination de nouveaux experts –11h45-13h30 repas au Magellan 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets 16h00 Questions au conseil scientifique 16h30 Délibération du Conseil

36 Question 1 Formation – Intérêts des universités ? – Soutiens ? – Ouverture, partenariat ?

37 Question 2 Projet scientifique – Point sur visualisation – du partage d’expertise technologique vers les collaborations scientifiques

38 Question 3 Grappe de PC ou SMP IBM ???

39 Ordre du jour 10h45 Tour de table 11h00 Actions transversales de CIMENT 11h30 Nomination de nouveaux experts –11h45-13h30 repas au Magellan 13h30 Présentations scientifiques des 6 projets 16h00 Questions au conseil scientifique 16h30 Délibération du Conseil

40 FIN Merci et Bon retour

41 Plate forme Mirage E. Blayo, L.Viry LMC, LEGI, LTHE, LGGE, LEA Les financements Mirage 2001 : 50 KF d'autofinancement sur des contrats, 200 KF de la part de l'Inria (qui ont permis le debut de l'upgrade : passage en OS 5.1 + qq achats de disque et matos reseau pour un meilleur aspect "true cluster") Prevu en 2002 : 500 KF Inria pour fin de l'upgrade (essentiellement upgrade des procs)

42 Pôle de chimie calculatoire S.Perez et P.Vatton LEDSS, CERMAV, Cristallographie, LEOPR, DPM Financement :CIMENT 1500 kf ( 1250 + 250), Labos 462 kf, CNRS 250 kf (500 kf sur 2 ans) dont provisions pour logiciels 250 kf Travaux et équipement salle machine 100 kf Equipement réseaux 60 kf Matériel SGI et IBM 1745 kf Logiciels et Exploitation 57 kf Septembre : réunion inaugurale du conseil de Gestion du CECIC