Présentations BIN1001.

Présentation au sujet: "Présentations BIN1001."— Transcription de la présentation:

1 Présentations BIN1001

2 Parler à l’oral Montrer que le sujet est maîtrisé!
Ton/Force de la voix Quelques petits conseils : Attention au vocabulaire employé Ne pas lire vos notes Regardez l’auditoire le plus possible

3 Organiser votre présentation
Sections: Introduction au sujet (votre motivation, définitions de concepts, exemple introductif…) Annoncer le plan de votre présentation 2 ou 3 parties (exemple: aspects biologiques, aspects informatique, aspects bio-informatiques) Conclusion et ouverture générale

4 Organiser votre présentation
Contenu Expliquer les notions difficiles Citer TOUTES vos sources Travailler en équipe Ne pas se répéter Liens logiques entre les idées et les parties

5 Support de présentation (PowerPoint)
Texte: Attention à la quantité de texte Choix de taille du texte Choix de la police et des couleurs Diapositives: choix du fond (modèle) Figures: Taille des images / tableaux Légendes, axes, titres bien indiqués

6 Exercices sur les matrices de points, BLAST et FASTA
TP4 Exercices sur les matrices de points, BLAST et FASTA

7 Dotplot Description : Un dotplot est un représentation graphique des régions de similitude entre deux séquences Les séquences sont placés sur les axes d’une matrice. Partout où il y a une similitude entre les séquences un point est placé dans la matrice.

8 Dotplot Dans les régions où les deux séquences ont beaucoup de similitude, des points s’alignent pour former les lignes diagonales. Régions locales de similitude = longues lignes diagonales Des répétitions = lignes diagonales parallèles Insertions ou suppressions = discontinuités dans les lignes diagonales

9 EMBOSS dottup: Dessine un dotplot à partir de mots exacts.
dotpath: Dessine un dotplot à partir de mots exacts qui ne se chevauchent pas. dotmatcher: Dessine un dotplot à partir de mots avec un score supérieur à un certain seuil

10 Utilisation % dottup Displays a wordmatch dotplot of two sequences
Input sequence: seq1 Second sequence: seq2 Word size [10]: 10 Graph type [x11]:

11 Devoir 2 Remise avant le 23 février 2007 à 17h00
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