Principe de la chimie pertinent à la pharmacologie

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1 Principe de la chimie pertinent à la pharmacologie
Pharmacologie et thérapeutiques UE 2.11 IFSI 1ère année Principe de la chimie pertinent à la pharmacologie F. Bengeloun – oct. 2015

2 Plan Introduction Les fondamentaux de la chimie Liaisons chimiques
Eau et solutions aqueuses Acidité et basicité des solutions ioniques Hydrophilie et lipophilie Application en pharmacologie Caractères physico-chimiques des médicaments

3 Introduction : la chimie
La chimie étudie : les éléments chimiques à l'état libre, atomes ou ions atomiques, les associations par liaisons chimiques les interactions La chimie est en lien avec : la biologie, la physique, la pharmacie …

4 Introduction : la chimie
La réaction chimique est un processus au cours duquel on observe un changement de composition de la matière : il y a transformation Loi de conservation de la matière (Antoine de Lavoisier ,1789) Au cours d’une réaction chimique, il y a conservation de la matière. C’est-à-dire qu’un élément peut apparaître sous différentes formes au début et à la fin d’une réaction mais en aucun cas il ne sera perdu. Un médicament ne disparait pas !!!!

5 Introduction Qu’est ce que le médicament?
= Molécule chimique active + Excipients Quelle est la composition du milieu biologique? Molécules biochimiques: Ions Protéines Sucres Lipides Environnement biologique Fluides (suc, sang, urine,…) pH Tissus (sanguin, Osseux, musculaire, nerveux…) Cellules (cellules nerveuses, cellules musc. ….)

6 Les fondamentaux de la chimie
L’atome : est le constituant élémentaire de la matière est le fragment le plus petit qui permet de différencier un élément chimique d’un autre est formé d’un noyau (nucléon), concentrant toute sa masse, autour duquel gravitent les électrons (nuage électronique) Les électrons sont répartis autour du noyau en formant des couches. La couche la plus éloignée est dans la majorité des cas incomplètement remplie donc assez instable (sf gaz rares). Afin d’augmenter leur stabilité, certains atomes vont tenter de gagner, perdre ou partager des électrons pour compléter ou vider cette couche. Lorsque l’atome perd ou gagne des électrons, il devient ion. Qd il partage des électrons avec un autre atome, il forme une liaison covalente créant une molécule.

7 Les fondamentaux de la chimie
Un atome contient autant de protons que d’électrons  il est électriquement neutre Un élément chimique se définit comme l'ensemble des atomes dont le noyau comporte un nombre donné de protons. Ce nombre est le numéro atomique, noté Z Chaque élément chimique est représenté par un symbole qui permet de l’identifier (Na = Sodium, Cl = Chlore…) Iode et ses isotopes (I 123, I 125; I 127)…émission de rayonnement pour utilisation en imagerie Ainsi, tous les atomes n'ayant qu'un seul proton dans leur noyau (Z = 1) correspondent à l'élément chimique hydrogène

8 Tableau périodique des éléments de MendeleÏev http://ekladata
Les éléments chimiques sont répertoriés dans la classification périodique de Mendeleïev. Le chimiste russe a classé les éléments par ordre croissant de leur masse atomique et a ainsi observé que leurs propriétés se répétaient à intervalles réguliers.

9 Liaison chimiques Les atomes ont tendance à s’associer pour donner différents types d’édifices chimiques ou molécules Les atomes vont établir entre eux des interactions ou des liaisons chimiques LIAISON COVALENTE LIAISONS NON COVALENTES Interactions électrostatiques Interactions de Vander Waals Liaisons Hydrogènes Effets Hydrophobes

10 La réaction chimique est caractérisée par la rupture de liaisons entre les éléments (= force de cohésion ou énergie qu'il faudra apporter pour casser la liaison)

11 LIAISON COVALENTE LIAISON IONIQUE
Est le résultat de la mise en commun de deux électrons, un de chacun des deux atomes qui se lient. Le terme de covalence signifie que la liaison résulte de la mise en commun d'une valence (liaison) de chaque atome. La valence dépend de l'organisation des électrons de l'atome. EX : Valence 0 : He, N Ar, Kr, Xe, Rn Valence I : H, Li, Na, K, Cu, Ag, Au... LIAISON IONIQUE La liaison ionique résulte de l’attraction entre une espèce positive (cation) et une espèce négative (anion). La stabilité de la liaison est assurée par l'interaction électrostatique Existence jusqu’à 8 valences

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13 Liaison covalentes Exemple de la molécule d’eau H2O

14 Liaisons ioniques Exemple du Chlorure de sodium.
Forte différence d’électronégativité entre l'atome de Chlore et l'atome de Sodium qui conduit à un arrachement d'électron

15 Types de liaison chimiques
Acide acétylsalicylique: Constituée de simples et doubles liaisons covalentes ADN, protéines : Liaisons covalentes + liaisons hydrogènes

16 Eau et solution aqueuse : l’eau
Composé inorganique le plus abondant du système vivant (60 à 80% du volume des cellules vivantes) L’eau est un solvant : capable de dissocier les cristaux ioniques capable de transporter diverses molécules (nutriments, gaz respiratoires, déchets métaboliques) Milieu de réactions chimiques dont l’hydrolyse : décomposition de l’eau en ions (H+ et OH-)

17 Eau et solution aqueuse
Une solution est un mélange liquide homogène dans lequel un des constituants ( le solvant) est en gros excès par rapport aux autres constituants du mélange ( les solutés). Si le solvant est de l'eau on obtient une solution aqueuse La concentration exprime la quantité de soluté présent dans la solution.

18 Eau et solution aqueuse
Calcul de la quantité de soluté en solution Concentration = rapport entre quantité de matière et quantité de solvant La concentration massique ( en g / litre) La concentration molaire ou molarité Sa valeur physiologique est située entre 280 et 300 mOsm/L dans le plasma sanguin. m (en gramme) C = = en g.L-1 V (en litre) n (en môle) V (en litre) C = = en môle.L-1

19 Eau et solution aqueuse
En médecine : Perfusion avec : Solutions aqueuses salines (NaCl) Solutions aqueuses glucosées (G5) Solution = mélange homogène d’au moins 2 substances (solvant et soluté) constituant une seule phase Les milieux biologiques naturels sont des milieux aqueux Def: phase liquide contenant des espèces : majoritaire solvant (eau) minoritaires solutés

20 Eau et solution aqueuse
Exemple de calcul: solution de Chlorure de Sodium à 0,9% Formule brute: NaCl Na (23); Cl (35) donc NaCl = 23+35 Soit une masse molaire = 58 0,9% signifie 0,9g de NaCl pour 100 ml ce qui correspond à la dissolution de 9g de NaCl dans 1000ml soit 1litre d'eau. 9/58=0,155 soit 155 mmol/l On parle de solution d'électrolytes car il se forme des cations et des anions

21 Osmolarité = L'osmolarité est la concentration d'un milieu.
Ceci fait appel à la notion d'osmose. L'osmose est un phénomène de diffusion de la matière mis en évidence lorsque des molécules de solvant traversent une membrane semi-perméable séparant deux solutions dont les concentrations en soluté sont différentes ; le transfert de solvant se fait alors de la solution la moins concentrée (milieu hypotonique) vers la solution la plus concentrée (milieu hypertonique) jusqu'à l'équilibre (milieux isotoniques).

22 Osmolarité L'osmose est un phénomène de diffusion de la matière mis en évidence lorsque des molécules de solvant traversent une membrane semi-perméable séparant deux solutions dont les concentrations en soluté sont différentes ; le transfert de solvant se fait alors de la solution la moins concentrée (milieu hypotonique) vers la solution la plus concentrée (milieu hypertonique) jusqu'à l'équilibre (milieux isotoniques).

23 Osmolarité

24 Acide et bases : Acides = Composé susceptible de céder un proton H+ en solution aqueuse. La concentration de protons détermine la force de l’acide Ex: HCL + H2O Cl- + H+ + H2O  Cl- + H3O+ NB : H+ n’existe pas à l’état libre en solution aqueuse. Il se combine à la molécule d’eau pour former l’ion H3O+

25 Acide et bases : Bases = Composé susceptible de libérer des ions OH- après réaction avec l’eau. Ex: NaOH  Na+ + OH- Les ions hydroxyles (OH- ) se lieront aux protons H+ libres de la solution => formation de H2O Diminution de H+ = augmentation du pH eau

26 Acide et bases pH = potentiel hydrogène
La mesure de la concentration en H3O+ permet de définir le caractère acide ou basique d’une solution pH = -log [H3O+] Dans l’eau pure : [H3O+] = 10-7 mol.L = [OH- ] donc le pH de l’eau pure = -log [H3O+] = -log [10-7 ] = 7

27 Acide et bases Le pH sanguin est compris entre 7,35 et 7,45

28 Acide et bases

29 Hydrophile et lipophile : Composé hydrophile
Qui aime l’eau Grande affinité pour les solutions aqueuses Capacité à réaliser des liaisons chimiques faibles avec le solvant aqueux. (constituant polaires : OH, CO) Solubles dans le milieu aqueux Ex: ions (et composés ionisés), acide acétique, paracétamol, etc…

30 Hydrophile et lipophile
Dissolution : Que se passe t-il? Un composé est solide car les liaisons entre les atomes, molécules ou ions créent la cohésion = forces de cohésions  Introduction dans l’eau  Les molécules du solvant vont rompre les forces de cohésions

31 Hydrophile et lipophile
NaCl = solide ionique La cohésion du cristal est assurée par des forces électrostatiques. Les molécules d’eau doivent vaincre ces forces pour s’immiscer dans le cristal Chaque molécule d’eau entoure un ion  solvatation des molécules du cristal et dissolution du sel

32 Hydrophile et lipophile : composé lipophile
Qui aime les lipides Grande affinité pour les solutions huileuses Capacité à réaliser des liaisons chimiques faibles avec le solvant huileux (via des constituants apolaires : CH) Solubles dans le milieu huileux Ex: Hydrocarbures, acides gras,  molécules non ionisées…

33 Hydrophile et lipophile
Le principe de dissolution est identique: Les molécules du solvant vont rompre les liaisons intramoléculaires d’une substance (soluté) et créer des liaisons intermoléculaire avec le soluté. Les composés à longue chaîne carboné seront lipophiles (acide palmitique, acide oléique) La membrane d’une cellule: Bicouche lipidique Milieu de dissolution pour des substances lipophiles

34 Hydrophile et lipophile
Mais…. Tout n’est pas si bien tranché Certaines molécules sont à la fois hydrophiles et lipophiles = molécules amphiphiles 2 pôles au sein de la même molécule: Pôle polaire: capable de réaliser des liaison avec l’eau (hydrophile) Pôle apolaire: capable de réaliser des liaisons avec « l’huile » (hydrophobe) Ex: esters d’acide gras (stéroïdes), tensioactifs (polysorbates)

35 Hydrophile et lipophile

36 Hydrophile et lipophile
Dans un milieu aqueux, les molécules amphiphiles se réorganisent et forment des micelles               Les têtes polaires (hydrophiles) sont orientées vers l’extérieur (où se trouve le solvant = eau = hydrophile)

37 Hydrophile et lipophile
Les tensioactifs permettent la dispersion de constituants non miscibles Dispersion de la phase huileuse dans l’eau

38 Hydrophile et lipophile
Phospholipide Membrane plasmique

39 Application en pharmacologie
Et en pratique?…. Faire le lien avec les médicaments et leur devenir dans l’organisme, Leur mécanisme d’action

40 Caractères physico-chimiques des médicaments
Substance active chimique ou biologique = principe actif Excipients: diluants, tensioactifs, colorants… Voie d’administration Per os Injection… Milieu général d’action: milieu aqueux

41 Caractères physico-chimiques des médicaments
Les médicaments sont des molécules, parfois des éléments, qui interagissent d'une manière le plus souvent spécifique avec certaines des molécules endogènes qu'ils rencontrent. Ces interactions sont à l'origine de leurs effets bénéfiques et indésirables ainsi que des biotransformations qu'ils subissent. Ils peuvent aussi interagir avec les constituants d'un micro-organisme, bactérie, virus, parasite... La plupart des médicaments ont un faible poids moléculaire, inférieur à Quand leur poids moléculaire est élevé, il s'agit en général de polypeptides analogues aux molécules endogènes. Les molécules endogènes sur lesquelles agissent les médicaments sont presque toujours des macromolécules: enzymes, récepteurs, canaux etc. La liaison qui s'établit entre le médicament et sa cible endogène est parfois de type covalent et le plus souvent de type interaction faible.

42 Caractères physico-chimiques des médicaments
En général, la structure chimique des médicaments contient beaucoup d’hydrogènes Liaisons H possible Phénomène de chélations possible avec des ions => Peut influencer l’absorption

43 Caractères physico-chimiques des médicaments
Diffusion passive: Certaines molécules peuvent passer à travers : des canaux ioniques la membrane plasmique

44 Caractères physico-chimiques des médicaments
Les principes actifs sont : Bases faibles ou acides faibles Peu nocifs chimiquement pour l’organisme Sous forme ionisé ou sous forme non ionisé dans le milieu biologique Lieu d’absorption différent : estomac (pH acide) ou intestin (pH basique) Seront transportés (acides faibles) par l’albumine dans le sang (forme de réserve)

45 Caractères physico-chimiques des médicaments
Sont hydrosolubles: Lieu de distribution immédiat: sang!!! Cas où le principe actif est incompatible utilisations de surfactifs

46 Caractères physico-chimiques des médicaments
Le plus souvent hydrophiles mais… Certains sont constitués d’une partie liposoluble plus ou moins importante Passage facilité dans le cerveau Passage transmembranaire rapide Distribution du médicament dans les compartiments osseux, dans le tissus graisseux,…)

47 Caractères physico-chimiques des médicaments
Sont des molécules de synthèse chimique Constitués d’atomes reliés par des liaisons covalentes (simple, double, triple) Sont capable de réagir chimiquement avec l’environnement Formation de nouvelles liaisons Dégradation par exposition aux acides, chaleur, lumière, oxydants….

48 Application en pharmacologie
Mode d’actions du médicament (cf pharmacodynamie) Interactions chimiques avec sa cible Récepteurs Enzymes Liaisons de faibles énergies (en général) Nécessité de passage transmembranaire  Nécessité de transport vers la cible

49 Application en pharmacologie
•liaison à un récepteur cellulaire •modulation d’ un canal ionique (récepteur modulant un canal) •modulation d’ une activité enzymatique (récepteur enzyme) •modulation d’ un transporteur •modulation de l’ expression du génome

50 La traversée des membranes cellulaires

51 Rôle du pH

52 Liaison aux récepteurs
Représentation par simulation numérique d'une molécule de médicament fixée sur son récepteur (généralement une protéine). © CNRS Photothèque

53 Liaison aux récepteurs
Interaction par liaisons faibles d’un principe actif avec un récepteur: ici l’erlotinib (anticancéreux) avec un récepteur Structure moléculaire du domaine kinasique en présence de l’inhibiteur Erlotinib

54 Conclusion Milieu biologique humain = milieu aqueux
Principes actifs = molécules chimiques capables d’interaction avec les constituants du milieu biologique Interactions dépendent du caractères intrinsèque du principe actif et de l’environnement entourant ce principe actif La capacité d’un principe actif à interagir avec sa cible définit sa propriété thérapeutique

55 Merci pour votre attention