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M2R de Chloé MONESTIER 1 Nicolas Morellet / Michel Goulard Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques Laboratoire Comportement et.

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1 M2R de Chloé MONESTIER 1 Nicolas Morellet / Michel Goulard Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux Aquatiques Laboratoire Comportement et Ecologie de la Faune Sauvage / INRA Toulouse Département Mathématiques et Informatique Appliquées UMR 1201 DYNAFOR / INRA Toulouse

2 2 Etudes de sélection des ressources avec hypothèse : ressources ou conditions favorables => fitness (Levins 1968) Les processus qui gouvernent la mobilité et la sélection de lhabitat sont multifactoriels (Morrison et al. 2006) : Qualité et quantité des ressources alimentaires Abris Densité de population Densité de compétiteurs Perturbation humaines Prédateurs… Modifications du paysage notamment agricoles : fragmentation / destruction des habitats variation de disponibilité des ressources et des habitats Dans ce contexte importance détudier comment les espèces sadaptent à cet environnement changeant Cas du chevreuil (forte abondance et forte plasticité comportementale)

3 Chevreuil (Capreolus capreolus) Espèce dongulé la plus répandue en France Vit dans un paysage fragmenté et anthropique Objectif Estimer la sélection de lhabitat du chevreuil en termes de fréquences doccupation des habitats Estimer les transitions entre habitats Rôle du chevreuil dans les transferts (tiques, graines, nutriments…) 3

4 Copyright IGN km Localisation : Canton dAurignac (N 43°13, E 0°52) Superficie : ha Inclus dans la plateforme LTSER (Long-Term Socio-Ecological Research) des Coteaux de Gascogne Habitat fragmenté : Massifs forestiers rares (<15%) Prairies et cultures Bosquets Milieu agricole hétérogène Site détude représentatif des paysages agricoles modernes 4

5 Données GPS De 2005 à 2011 Suivis intensifs : 1 loc/10 min pendant 24 heures 12 à 17 jours de suivis par an 94 individus 5

6 6 Réalisation du parcellaire (occupation du sol) : parcelles agricoles, routes, haies, bâtis… Relevés annuels des cultures Renseignement du SIG

7 Utilisation dhabitatsMouvementSélection dhabitats occupation dun habitat par lindividu occupation conditionnée par le disponible capacités de déplacements des individus 7

8 Variable dépendante : habitat au temps t Variables explicatives : « Périodes » de la journée (4 modalités) « Saisons » (5 modalités) « Habitat à t-1 » (4 modalités) « Identité de lindividu » aube jourcrépusculenuit MAMJJASOND boisprairiescultureshaies 8 Bois Prairies Cultures Haies

9 Modèle de mouvement (données observées) Equations différentielles stochastiques (EDS) Cette formulation permet de passer par des vitesses intégrées un apprentissage statistique par des modèles additifs Brillinger et al. (2001), Preisler et al. (2004) Dérive = Partie déterministe Diffusion = Partie stochastique Accroissements en x et en y Processus brownien 9 )(),( ()(t dBttRD dtttRtdR

10 Détermination du disponible Modélisation du mouvement par individu Estimation du disponible à t sachant la localisation à t-1 (EDS) 100 simulations/localisation observée Pestimée traj = proba associée à chaque habitat (bois/haie/prairie/culture) en chaque point de la trajectoire 10 Pestimée traj

11 Utilisation dhabitatsMouvementSélection dhabitats Modèles Régressions logistiques multinomiales Modèles Equations différentielles stochastiques Modèles Régressions logistiques multinomiales avec offset 11

12 ModèleKAICc Delta AICc AICc Wt Habitat(t-1)*périodes+périodes*saisons+identité individus Périodes*saisons+habitat(t-1)+identité individus Habitat(t-1)*périodes+saisons+identité individus Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus Habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus Habitat(t-1)+périodes+saisons+identité individus Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+identité individus Habitat(t-1)+périodes+identité individus Habitat(t-1)+saisons+identité individus Périodes+saisons+identité individus

13 ModèleKAICc Delta AICc AICc Wt Habitat(t-1)*périodes+périodes*saisons+identité individus Périodes*saisons+habitat(t-1)+identité individus Habitat(t-1)*périodes+saisons+identité individus Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus Habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus Habitat(t-1)+périodes+saisons+identité individus Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+identité individus Habitat(t-1)+périodes+identité individus Habitat(t-1)+saisons+identité individus Périodes+saisons+identité individus

14 Effet de lhabitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection dhabitats 14 Probabilité dêtre dans le bois à t Périodes de la journée

15 Probabilité dêtre dans le bois à t Effet de lhabitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection dhabitats Périodes de la journée Transitions bois-bois > 55% 15

16 Effet de lhabitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection dhabitats Transitions bois-bois > 55% + de transitions le jour Pas de transitions du milieu ouvert vers le bois la nuit 16 Probabilité dêtre dans le bois à t Périodes de la journée

17 Effet de lhabitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection dhabitats Transitions prairie-prairie > 60% 17 Probabilité dêtre dans la prairie à t Périodes de la journée

18 Effet de lhabitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection dhabitats Transitions prairie-prairie > 60% + de transitions la nuit - de transitions le jour 18 Probabilité dêtre dans la prairie à t Périodes de la journée

19 Effet des périodes et des saisons sur la probabilité dêtre dans le bois 19 Probabilité dêtre dans le bois à t Périodes de la journée

20 Effet des périodes et des saisons sur la probabilité dêtre dans le bois + occupé le jour Peu occupé la nuit 20 Probabilité dêtre dans le bois à t Périodes de la journée

21 Effet des périodes et des saisons sur la probabilité dêtre dans le bois + occupé le jour Peu occupé la nuit Préférentiellement occupée en MA, SO et surtout en ND 21 Probabilité dêtre dans le bois à t Périodes de la journée

22 Effet des périodes et des saisons sur la probabilité dêtre dans la prairie 22 Probabilité dêtre dans la prairie à t Périodes de la journée

23 Effet des périodes et des saisons sur la probabilité dêtre dans la prairie Occupation maximale la nuit Occupation minimale le jour 23 Probabilité dêtre dans la prairie à t Périodes de la journée

24 Effet des périodes et des saisons sur la probabilité dêtre dans la prairie Occupation maximale la nuit Occupation minimale le jour Préférentiellement occupée en MA et MJ 24 Probabilité dêtre dans la prairie à t Périodes de la journée

25 Opposition bois/milieux ouvert pendant la journée couvert de protection moins de perturbations anthropiques pics dactivité aux levers et couchers du soleil Prairie plus fréquentée au printemps alimentation (jeunes pousses) mise bas des chevrettes 25

26 Approche méthodologique novatrice: sélection dhabitat conditionnée par les capacités de déplacement de lindividu Mouvements et sélection dhabitats influencés par les saisons et périodes de la journée Influence des mouvements du chevreuil sur les transferts de tiques, graines, nutriments dans le paysage 26

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