Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie

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Transcription de la présentation:

Epidémiologie des maladies infectieuses et écologie Apport des modélisations déterministe et stochastique

Comprendre les mécanismes de propagation des parasites afin d’identifier les processus de sélection Dynamique des populations du réservoir/vectrices Traits d’histoire de vie des individus Modélisation dynamique Suivis à long terme de populations naturelles Analyses statistiques paramétrage

1 - Un modèle de maladie émergente: la néphropathie épidémique (NE) Ardennes (région étudiée) NE endémique Chletrionomys glareolus NE sporadique Hantavirus Puumala Pas de NE ? Quel est le mécanisme qui permet de comprendre la géographie de la propagation du virus ?

Circulation du virus Puumala chez les rongeurs et l’homme FORET campagnols Travailleurs forestiers, promeneurs Dépôts d’urine et de fecès Contamination de l’homme via poussières contaminées. Mais insuffisant / géographie Elément additionnel:  dynamique entre la zone d’endémie et la zone indemne Modélisation déterministe

Mécanisme d’émergence de la NE chez l’Homme sensibles infectés Zone d’endémie Zone indemne Dynamique de population du rongeur influence la propagation du virus Cas humains Sélection de souches capables de survivre hors de leur hôte

2 - Mode de transmission du VIF ■ verticalement (placenta, lait) ■ sexuellement (sperme) ■ par morsure (salive) mode de transmission naturel expérimentalement Petites populations (60-300 hôtes), prévalence VIF = 15 – 30% Mâles dominants = « core-group » pourquoi ce mode de transmission ? simple conséquence ou processus de sélection ? Modélisation stochastique

Patron de persistance du VIF en milieu rural Modèle stochastique SI en population fermée structurée par âge, sexe, comportement (dominant vs subordonnés) probabilité d’extinction  70% après 10 ans 1000 simulations du réseau de Petri sur 30 ans probabilité années prévalence

Patron de persistance du VIF en milieu rural très forte probabilité d’extinction du VIF en population close pas en adéquation avec les observations prise en compte de la structure en métapopulation Réintroduction fréquente du virus population B A Mâles dominants combats

Patron de persistance du VIF en milieu rural sans contact entre pop avec contacts entre pop probabilité prévalence années probabilité prévalence années 70% 12% Le mode de transmission par morsure maximise les chances de persistance du virus processus de sélection du mode de transmission du VIF

Perspectives Fonctionnement des populations hôtes Facteurs de sélection des pathogènes Pathocénoses et émergence des maladies transmissibles : un concept unificateur mis à l’épreuve sur des pathologies exemplaires (coord. D. Pontier) Programme Santé-environnement et Santé-travail Généralisation de l’approche à plusieurs parasites