Le dépôt des données Le dépôt des données

Le dépôt des données Répondre aux exigences des financeurs Augmenter la visibilité des travaux Valider – réutiliser – collaborer

Répondre aux exigences des financeurs Le contexte politique est en faveur de l'ouverture des données de la recherche. Les agences de financement recommandent le dépôt des données. L'UE agit en tant qu'agence de financement dans le cadre du programme Horizon 2020. A ce jour, les projets de recherche H2020 doivent déposer leurs données dans un entrepôt, dans la mesure où celles-ci peuvent être partagées.

Augmenter la visibilité de vos recherches Déposer et publier vos articles permet à vos travaux d'être vus.

Augmenter la visibilité de vos recherches Déposer et publier vos articles permet à vos travaux d'être vus. Déposer et publier vos données les font exister indépendamment de vos articles.

Augmenter la visibilité de vos recherches Déposer et publier vos articles permet à vos travaux d'être vus. Vos travaux peuvent donc être vus à travers vos articles et/ou vos données, augmentant par là même vos chances d’être cité. Déposer et publier vos données les font exister indépendamment de vos articles. « … »

Valider – réutiliser – collaborer Le dépôt des données a un impact sur les questions d'évaluation et validation des travaux, sur la réutilisation des données et sur la collaboration avec d'autres chercheurs. Lorsque votre article et vos données sont prêts, vous pouvez déposer vos données dans un entrepôt avant de soumettre votre article au comité de lecture.

Valider – réutiliser – collaborer Le dépôt des données a un impact sur les questions d'évaluation et validation des travaux, sur la réutilisation des données et sur la collaboration avec d'autres chercheurs. L'article et les données liées sont soumis à évaluation et validation par le comité de lecture de la revue Lorsque votre article et vos données sont prêts, vous pouvez déposer vos données dans un entrepôt avant de soumettre votre article au comité de lecture.

Valider – réutiliser – collaborer Le dépôt des données a un impact sur les questions d'évaluation et validation des travaux, sur la réutilisation des données et sur la collaboration avec d'autres chercheurs. Une fois validé, l'article est publié dans la revue. Un data paper fournissant le lien vers les données déposées dans l'entrepôt peut aussi être publié. Lorsque votre article et vos données sont prêts, vous pouvez déposer vos données dans un entrepôt avant de soumettre votre article au comité de lecture. L'article et les données liées sont soumis à évaluation et validation par le comité de lecture de la revue

Valider – réutiliser – collaborer Le dépôt des données a un impact sur les questions d'évaluation et validation des travaux, sur la réutilisation des données et sur la collaboration avec d'autres chercheurs. Le data paper informe les autres chercheurs de la disponibilité de vos données. Ils peuvent les retrouver aisément sur l'entrepôt grâce au lien unique, et les réutiliser. Une fois validé, l'article est publié dans la revue. Un data paper fournissant le lien vers les données déposées dans l'entrepôt peut aussi être publié. Lorsque votre article et vos données sont prêts, vous pouvez déposer vos données dans un entrepôt avant de soumettre votre article au comité de lecture. L'article et les données liées sont soumis à évaluation et validation par le comité de lecture de la revue

Valider – réutiliser – collaborer Le dépôt des données a un impact sur les questions d'évaluation et validation des travaux, sur la réutilisation des données et sur la collaboration avec d'autres chercheurs. ! En s'appuyant sur vos données, ils peuvent lancer de nouvelles recherches. Ils peuvent aussi déceler un problème et invalider votre travail. Le data paper informe les autres chercheurs de la disponibilité de vos données. Ils peuvent les retrouver aisément sur l'entrepôt grâce au lien unique, et les réutiliser. L'article et les données liées sont soumis à évaluation et validation par le comité de lecture de la revue Lorsque votre article et vos données sont prêts, vous pouvez déposer vos données dans un entrepôt avant de soumettre votre article au comité de lecture. Une fois validé, l'article est publié dans la revue. Un data paper fournissant le lien vers les données déposées dans l'entrepôt peut aussi être publié.

Valider – réutiliser – collaborer Le dépôt des données a un impact sur les questions d'évaluation et validation des travaux, sur la réutilisation des données et sur la collaboration avec d'autres chercheurs. ! Ils peuvent aussi facilement vous identifier, ce qui favorise de potentielles collaborations. En s'appuyant sur vos données, ils peuvent lancer de nouvelles recherches. Ils peuvent aussi déceler un problème et invalider votre travail. Une fois validé, l'article est publié dans la revue. Un data paper fournissant le lien vers les données déposées dans l'entrepôt peut aussi être publié. Lorsque votre article et vos données sont prêts, vous pouvez déposer vos données dans un entrepôt avant de soumettre votre article au comité de lecture. L'article et les données liées sont soumis à évaluation et validation par le comité de lecture de la revue Le data paper informe les autres chercheurs de la disponibilité de vos données. Ils peuvent les retrouver aisément sur l'entrepôt grâce au lien unique, et les réutiliser.

Toutes les données Toutes les données sont susceptibles d'être déposées. Elles peuvent avoir un intérêt pour chaque utilisateur. ! Les données concernées par le dépôt dépendent de votre situation ! Les données personnelles, relevant de la propriété intellectuelle et industrielle doivent faire l'objet d'une attention particulière. Données recueillies, non organisées, non mises en forme. Peuvent convenir à un public susceptible de les traiter. Données brutes Données calculées, corrigées, réorganisées... Peuvent convenir à un public susceptible de les analyser. Données traitées Données telles qu'apparaissant dans les publications. Peuvent convenir à un public susceptible de les comprendre. Données analysées

Prévoir dès le début du projet Le moment du dépôt doit être prévu dès le début du projet. Suivant votre situation, le dépôt peut se faire à différents moments : Au fur et à mesure de l'acquisition des données Au moment de la publication de l'article Après un délai pour exploitation Prévoir le dépôt dès le début, en le planifiant dans le plan de gestion de données. Préparer les données pour le dépôt (format, métadonnées, licence attribuée, etc.) Déposer idéalement au moment de la publication de l'article. Les données sont accessibles et réutilisables selon les conditions prévues. Possibilité de déposer ses données au fur et à mesure que les jeux de données sont prêts.

Le dépôt des données Dans un entrepôt recommandé Dans un entrepôt correspondant à vos critères

Dans un entrepôt recommandé Un entrepôt peut vous être recommandé par une des parties prenantes du projet de recherche : Le financeur Le financeur de votre projet peut vous orienter vers un entrepôt. Par exemple, dans le cadre de projets financés par H2020, des entrepôts disciplinaires, institutionnels ou centralisés sont recommandés.

Dans un entrepôt recommandé Un entrepôt peut vous être recommandé par une des parties prenantes du projet de recherche : L’éditeur L'éditeur de votre publication peut vous orienter vers un entrepôt. PLOS ONE par exemple, recommande des entrepôts publics, disciplinaires ou multidisciplinaire, du moment que l'accès aux données et leur réutilisation sont libres.

Dans un entrepôt recommandé Un entrepôt peut vous être recommandé par une des parties prenantes du projet de recherche : Certains grands projets recommandent des entrepôts qui y sont associés. Par exemple, pour les recherches liées au projet IODP (International Ocean Discovery Programm), l'entrepôt Pangaea est recommandé. Le consortium

Dans un entrepôt recommandé Un entrepôt peut vous être recommandé par une des parties prenantes du projet de recherche : Quelques organismes de rattachement recommandent des entrepôts. L'institut Laue-Langevin par exemple a mis en place une politique de partage des données et dispose d'un portail où les chercheurs peuvent faire leur dépôt de données L’institution

Dans un entrepôt recommandé Un entrepôt peut vous être recommandé par une des parties prenantes du projet de recherche : Dans certains domaines scientifiques, l'ouverture des données est déjà fortement encouragée et certains entrepôts largement reconnus. En cristallographie par exemple, les chercheurs ont plusieurs archives de données, comme la Crystalography Open Database. La discipline

Dans un entrepôt correspondant à vos critères Si aucun entrepôt ne vous est recommandé, ou si vous devez faire un choix parmi plusieurs entrepôts, vous devez prendre en compte quelques critères. Ce sont des questions que vous devez vous poser et qui vous permettront de filtrer votre recherche, soit via un annuaire d'entrepôts, soit dans les pages de politique des entrepôts. Entrepôt disciplinaire ? Certifié ? Hébergé en France ? Préservation des données sur le long terme ? Y a-t-il un coût associé ? ... Types de données acceptés ? Sous quels formats ? Modification possible ? Attribution d'un identifiant pérenne ? Licence imposée ? ... Restriction d'accès possible ? Période d'embargo possible ? Statistiques d'utilisation des données (consultation, etc.) ? ...

Le dépôt des données Vérifiez vos données avant tout Remplissez le formulaire de dépôt

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les jeux de données à partager sont définis Les jeux de données à partager sont définis Vos données doivent être structurées et agrégées pour former des jeux de données cohérents, liés à une même activité de recherche. Il faut aussi sélectionner les jeux de données à déposer.

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les jeux de données à partager sont définis Les fichiers sont bien organisés et nommés Vérifiez avec un documentaliste et/ou un informaticien que vos données sont organisées correctement pour un traitement informatique ou une intégration dans une base de données. Nommez de façon claire et cohérente vos dossiers et fichiers. Les dénominations doivent avoir du sens et refléter le contenu. Les fichiers sont bien organisés et nommés

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les jeux de données à partager sont définis Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts Vous devez utiliser des formats de fichiers acceptés par l’entrepôt choisi. Dans tous les cas, il est préférable d’éviter les formats fermés et de privilégier les formats ouverts ou largement répandus, afin que vos données puissent être lues et réutilisées. Convertissez le format de vos fichiers si besoin, par exemple un format xls (format Excel fermé) vers un format csv (format ouvert). Les fichiers sont bien organisés et nommés Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les jeux de données à partager sont définis Les fichiers sont bien organisés et nommés Le volume de fichier ne dépasse pas la limite autorisée Le volume des fichiers est contraint par l’entrepôt. Il y a une taille maximale que vous ne pourrez pas dépasser. Cette taille limite dépend des entrepôts. Par exemple, l’entrepôt Zenodo limite la taille d’upload à 50GB par fichier, l’entrepôt Figshare à 5GB. Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts Le volume de fichier ne dépasse pas la limite autorisée

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les jeux de données à partager sont définis Les fichiers sont bien organisés et nommés Un identifiant pérenne et unique est attribué L’entrepôt attribue généralement un identifiant pérenne ou un accession number. Il se peut aussi qu’un identifiant ait déjà été attribué à votre jeu de données (par votre institution par exemple). Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts Le volume de fichier ne dépasse pas la limite autorisée Un identifiant pérenne et unique est attribué

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les jeux de données à partager sont définis Une licence appropriée est attribuée Une licence de diffusion est indispensable pour définir les conditions de réutilisation des données. Pour favoriser le partage, il est souhaitable de choisir une licence la plus ouverte possible, permettant une utilisation libre et sans restriction. L'entrepôt peut vous proposer plusieurs licences au choix. Une licence précise peut également vous être imposée. Les fichiers sont bien organisés et nommés Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts Le volume de fichier ne dépasse pas la limite autorisée Un identifiant pérenne et unique est attribué Une licence appropriée est attribuée

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les jeux de données à partager sont définis Les modalités d’accès sont définies Suivant l’entrepôt, il vous sera possible de choisir : Un accès ouvert Un accès restreint (à une communauté scientifique par exemple) Vous pourrez également déposer vos données mais les rendre accessibles plus tard en décidant d’un embargo. La période d’embargo est à définir, toutefois vous pouvez être limité par ce que propose l’entrepôt. Les fichiers sont bien organisés et nommés Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts Le volume de fichier ne dépasse pas la limite autorisée Un identifiant pérenne et unique est attribué Une licence appropriée est attribuée Les modalités d’accès sont définies

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les droits de diffusion des données sont obtenus Il vous faut la permission d’autres chercheurs / collaborateurs de diffuser les données dans le cadre d’un projet particulier. Vous pouvez vous référer à l’accord de consortium, vos droits peuvent y être précisés. Certaines données peuvent faire l'objet d'une interdiction de diffusion – Données collectées dans le cadre d’un contrat de prestation de services exécuté ou pour le compte d’une ou plusieurs personnes déterminées (non publiques) ; – Données relatives à la sécurité publique ou au secret défense ; – Données relatives aux secrets professionnels. Les jeux de données à partager sont définis Les fichiers sont bien organisés et nommés Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts Le volume de fichier ne dépasse pas la limite autorisée Un identifiant pérenne et unique est attribué Une licence appropriée est attribuée Les modalités d’accès sont définies Les droits de diffusion des données sont obtenus

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les principes éthiques sont respectés Vous devez être particulièrement vigilant sur les données à caractère personnel, c’est-à-dire les informations qui permettent d’identifier directement ou indirectement une personne physique (nom, prénom, numéro de téléphone, de sécurité sociale, etc.) selon l’article 2 de la loi « Informatique et libertés ». Dans ce cas, référez-vous à la CNIL ou au CIL (Correspondant informatique et libertés) de votre organisme. Les jeux de données à partager sont définis Les fichiers sont bien organisés et nommés Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts Le volume de fichier ne dépasse pas la limite autorisée Un identifiant pérenne et unique est attribué Une licence appropriée est attribuée Les modalités d’accès sont définies Les droits de diffusion des données sont obtenus Les principes éthiques sont respectés

Vérifiez vos données avant tout Vos données doivent être préparées pour pouvoir être déposées dans l'entrepôt choisi. Vérifiez ces quelques points essentiels : Les données sont décrites et documentées La description des données doit être suffisante pour assurer leur validation, reproductibilité, réutilisation. Vos données doivent donc être bien décrites : titre explicite, description, technologie, organisme, mots clés, etc. Pour cela, il est recommandé d’utiliser les standards / terminologies de votre domaine. Il est également nécessaire de fournir la documentation qui permet la réutilisation de vos données. Un document (par exemple, un fichier Readme) expliquant le contexte, la méthodologie, les outils / logiciels utilisés et toutes les informations indispensables à la réutilisation de vos données peut être demandé. Les jeux de données à partager sont définis Les fichiers sont bien organisés et nommés Les fichiers sont dans des formats pérennes et ouverts Le volume de fichier ne dépasse pas la limite autorisée Un identifiant pérenne et unique est attribué Une licence appropriée est attribuée Les modalités d’accès sont définies Les droits de diffusion des données sont obtenus Les principes éthiques sont respectés Les données sont décrites et documentées

Remplissez le formulaire de dépôt Une fois vos données vérifiées, il ne reste plus qu'à aller sur le site de l'entrepôt que vous avez choisi et de remplir le formulaire de dépôt. Remplir le formulaire est plus ou moins simple selon les entrepôts. Certains proposent des aides, comme Nakala. Un tutoriel pour Zenodo a aussi été réalisé dans le cadre de Doranum.