Marie-Noelle BESSAGNET WORK PACKAGE 1: MODELS AND TOOLS ALLOWING TO SPECIFY AND TO BUILD SEARCH ENGINES DEDICATED TO GEOGRAPHIC INFORMATION (SPATIAL, TEMPORAL ET THEMATIC FACETS) Equipe T2I Laboratoire LIUPPA, UPPA Equipe IC3 Laboratoire IRIT, UPS MOANO 16/12/ 2010 BnF Marie-Noelle BESSAGNET MOANO 16 Décembre 2010

Expertise LIUPPA MOANO

Information extraction/Information retrieval MOANO

Spatial Temporel Thématique Fonds Documentaire Chaîne de Traitement sémantique Index Niveau 1 Recherche d’Information Scénarios d’Usages Interpréter Valider Extraire Spatial Interpréter Valider Extraire Temporel Chaîne de Traitement sémantique et statistique Interpréter Valider Extraire Thématique

Expertise IRIT MOANO

Ontologies, textes et web sémantique Corpus de textes Ontologies à composante terminologique Construction d’ontologie Extraction d’information Recherche en botanique Perspectives Aide à la décision Ontologies Dynamiques Extraction de relations Construction et évolution Terminae, ANR Dafoe et Dynamo, 1 thèse SMAC Représentation des connaissances Autodiag, 1 thèse Outils d’extraction de relations Exploiter le langage : patrons lexico-syntaxique Exploiter la structure XML et la mise en forme (projet GEONTO) Relations sur plusieurs phrases : résolution d’anaphores MOANO

Expertise BnF Ressources Expertise indexation documentaire Thésaurus RAMEAU Documents sur la botanique Expertise indexation documentaire MOANO

Les membres IRIT Nathalie AUSSENAC-GILLES, Mouna KAMEL BnF LIUPPA Marie-Noelle BESSAGNET, Christian SALLABERRY IRIT Nathalie AUSSENAC-GILLES, Mouna KAMEL BnF Michel MINGAM MOANO

Découpage du WP1 WP 1.0 – Preliminary study of corpus features, end-users requirements and existing botanical ontologies Preliminary work should focus on identifying the ontologies available in botany to encourage their reuse to accelerate the construction of a new ontology WP 1.1: Development of methods and tools to extract concepts and relationships Preliminary study of corpora and reusable ontology to be used for botanical document annotation MOANO

Découpage du WP1 WP 1.2: Development of a thematic process to index text documents based on the produced ontology Tools for ontology-based indexing of botanical text MOANO

Découpage du WP1 WP 1.3 Development of a platform supporting the creation of descriptive notices (LIUPPA, BNF) ? Evolution de ce WP : outils d’aide à la validation de concepts par les ontologues MOANO

Place dans le projet : interactions MOANO

Ontologie Pour faire simple, considérons l'exemple de la figure ci-dessus. On y voit une certaine « scène du monde ». La description de cette scène demande deux choses : (1) un vocabulaire non ambigu, aussi appelé vocabulaire conceptuel ou ontologie ; (2) une énonciation des faits de la scène, reposant sur l'utilisation du vocabulaire de l'ontologie. D'un point de vue pratique, une ontologie informatique permet, en particulier grâce aux travaux de l'intelligence artificielle symbolique sur les systèmes à base de connaissances et les moteurs d'inférence, d'implanter des mécanismes de raisonnement déductif, de classification automatique, de recherche d'information, et d'assurer l'interopérabilité entre plusieurs systèmes de ce type. Un exemple schématique d'ontologie : l'incontournable exemple des cubes. Source : http://interstices.info/jcms/c_17672/ontologies-informatiques MOANO

Etape 1 : création de l’ontologie Une ontologie pour quoi faire? favoriser l'indexation conceptuelle automatique et la recherche de documents textuels sur la botanique (e.g., comptes rendus botaniques) ; faciliter la compréhension de la botanique (objectif pédagogique). Une ontologie de domaine : botanique Un préalable : Phase d'identification des ressources disponibles décrivent, respectivement, le vocabulaire lié à un domaine générique Elles donnent une représentation formelle des concepts du domaine étudié ainsi que des différentes relations qui lient ces derniers. Les ontologies sont surtout utilisées pour la représentation de connaissance et l’application de raisonnements sur ces connaissances MOANO

Etape 2 : un système de RI basé sur l’ontologie Une ontologie pour quoi faire? Améliorer la requête de l’utilisateur; Aide à la décision MOANO

Ressource ontologique et processus de recherche d’information Concept hierarchy, thesaurus, ontology, ... Document gathering Collection of documents Information need ---- --- -------- ----- ---- --- -------- ----- ----- -- --- ----- Indexing Analyse match In a U process of Information Retrieval, especially in the step of indexing documents and queries, external semantic resources could be used. They should be taxonomies, conceptual hierarchies or ontologies. They contain in general a shared and consensual vocabulary which could be used to enhance queries and documents representations. Documents representation Query representation ---- --- -------- ----- Retrieved documents Source Février 2006 - URFIST Web sémantique - 3 - N. Aussenac-Gilles

Un système de RI basé sur l’ontologie Fonds Documentaire Chaîne de Traitement sémantique Index Requête Spatial Interpréter Valider Extraire Temporel Interpréter Valider Extraire Résultats Thématique Interpréter Valider Extraire MOANO

La botanique Compte-rendu de sortie botanique Récit Corpus La botanique Compte-rendu de sortie botanique Récit Description de la flore vivant dans des biotopes à des périodes données « L’élément central est l’observation : c’est l’ensemble de données relatives à un ou plusieurs individus d’une même espèce observés sur un site à une certaine date par un observateur associé à un validateur / déterminateur, dans le cadre d’un ensemble d’observations appelé relevé. » MOANO

Extrait CR sortie botanique Espace Thème : taxon Thème MOANO

Extrait CR sortie botanique Espace : biotope Thème MOANO

Livres anciens « Le voyage de Tarbes, 1807 - Première grande traversée des Pyrénées", aux éditions Loubatières, de Augustin Pyramus de Candolle. » Comment donner accès à ce contenu scientifique? Augustin Pyramus de Candolle (1778-1841), botaniste. Muni d'un baromètre, il mesurait la hauteur des sommets qu'il gravissait ; mais il donne les hauteurs en toises, ce qui n'est pas vraiment pratique (1506 toises pour le Pic du Midi). MOANO

Livres anciens En 2007, un groupe de botanistes a refait cette traversée en 70 jours Evolution de la flore http://www.terranoos.org/fr/de-candolle/actualite.html MOANO

Extrait de leur récit Le val d'Esquierry Nous partons à 6H45 du refuge d'Espingo pour rallier les Granges d'astau et rejoindre le reste de l'équipe dont nous étions séparés suite aux péripétie de la veille au port d'OO. Dans la descente, sur une falaise humide, nous trouvons une station à Saxifrage de Cluse d'une dizaine de pieds. Plante assez rare, Gérard précise qu'une station aurait été détruite lors de l'élargissement du sentier. Heureusement, la nature semble avoir encore quelques ressources. 8H15, arrivée au bivouac, nous retrouvons l'équipe. Nous mettons rapidement les échantillons d'herbier récoltés depuis trois jours dans la grande presse. Nous repartons vers 10H00 pour le val d'Esquierry. La montée à travers la prairie et la hêtraie est  raide, mais assez courte. À la sortie, nous débouchons sur un immense vallon couvert de fleurs. Nous trouvons une prairie montagnarde pas encore pâturée. Nous relevons, comme de Candolle avant nous, le Millepertuis des montagnes, la Serratule fausse-centaurée, plante remarquable par la taille de son port et de son inflorescence et formant une population de quelques dizaines de pieds très localisée. taxon MOANO

Contexte : La botanique Ouvrir l’accès à la connaissance (grand public, étudiants, décideurs, ...) au travers d’interfaces de recherche/navigation en texte. Exploiter les connaissances des experts présentes au sein des descriptions textuelles L’image a une place prépondérante en botanique : de nombreux croquis…. MOANO

Des images et des croquis Le Millepertuis des montagnes, la Serratule fausse-centaurée, MOANO

Un concept : Le millepertuis plusieurs termes Noms communs : Millepertuis, herbe de la Saint-Jean. Nom botanique : Hypericum perforatum, famille des hypéricacées ou clusiacées. Noms anglais : St. John’s Wort, SJW. MOANO

Des outils pour classer, indexer et rechercher Thésaurus : RAMEAU Des référentiels taxonomiques pour la faune et la flore : http://www.sciena.org/serena/ : logiciel de gestion de bases de données naturalistes MOANO

Une taxonomie existante – Thésaurus Rameau Une première base Une taxonomie existante – Thésaurus Rameau MOANO

Des questions? pour votre attention MOANO 16 Décembre 2010