Réunion annuelle du CNR Echinococcose Alvéolaire

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Transcription de la présentation:

Réunion annuelle du CNR Echinococcose Alvéolaire Projet CECURE (Contamination de l’environnement et circulation urbaine et rurale d’Echinococcus multilocularis) Jenny Knapp Vendredi 3 octobre 2014

Prévalence vulpine d’E. multilcularis Haute-Saône : 36% prévalence Em chez renards Seine-St-Denis : 17% - Essonne : 7% (Combes et al., 2012)

Objectifs de l’étude Estimation du risque de transmission du parasite par rapport à la densité de population humaine Caractériser le rôle des carnivores domestiques dans le risque de transmission du parasite Comparaison prévalence autopsie/copro-qPCR

Du terrain à l’analyse… ?? 4- Compilation des données du jour 1-Prévalence vulpine urbain/rural 2-choix du site d’étude urbain/rural 3- Echantillonnage et marquage GPS 7- Réalisation de cartes de présence du parasite 6- Recherche de l’ADN spécifique du parasite 5- Extraction de l’ADN total

qPCR en duplicat x2 Haute-Saône Seine-Saint-Denis 2 villages : 93 et 149 fèces Seine-Saint-Denis 4 parcs urbains : 10 à 60 fèces 1 positif : 1 qPCR/4  Fahy-les-Autrey renard PCR chien PCR chat PCR ? PCR 42 23 12 16 rrn pos 8 1 % pos 19% 0% 8,3% % conf morph 92,9% 82,6% 50% 56,3%   Aillevans 35 61 43 11 4 34,3% 1,6% 9,3% 9,1% 88,6% 91,8% 25,6% 36,4% 3 positifs en 2nd qPCR (à distance) 1 flottation chat (-) 7 positifs en 2nd qPCR (à distance) 2 flottations chat (+)

Aillevans (70): panel d’échantillons qPCR (+) renard chat ? chien

Fahy-les-Autrey (70): panel d’échantillons chat renard qPCR (+)

Jour 1 Semaine4~5 Survie des œufs d’Em à 4°C : 478 jours (Veit et al., 1995) D’après le « WHO/OIE Manual on Echinococcosis in Humans and Animals: a Public Health Problem of Global Concern », les stades de développement d’E. granulosus

Perspectives Rapport du projet CECURE en fin d’année Nouvelle campagne sites urbains/ruraux Etude du régime alimentaire pour échantillons positifs = déterminer l’hôte intermédiaire impliqué dans le cycle (métabarcoding)