Laboratoire Commun de Microbiologie Laboratoire Commun de Microbiologie LCM-UCAD/IRD/ISRA, Centre de Recherche ISRA/IRD de Bel-Air, BP. 1386, CP. 18524 Dakar-Sénégal

Laboratoire Commun de Microbiologie Unité de Microbiologie: Créée en 2004 du laboratoire de biologie des sols de l’IRD Implantée au centre de recherche ISRA/IRD à Bel air Rattachée à l’UMR113/LSTM IRD-CIRAD-UM2-INRA Renforcée par l’UMR232/DIADE/IRD-UM2 en 2010 Regroupe des chercheurs et enseignants-chercheurs de l’UCAD, de l’IRD et de l’ISRA Structurée en une équipe de recherche

Objectifs scientifiques Objectif principal: Développer des recherches sur la diversité et le fonctionnement des symbioses fixatrices d’azote et mycorhiziennes en vue de leur utilisation pour améliorer la productivité végétale et la fertilité des sols. Objectifs spécifiques: Caractériser la diversité des microorganismes symbiotiques (rhizobiums et champignons mycorhiziens) Etudier les mécanismes d’adaptation des symbioses végétales aux contraintes édaphiques (salinité, sécheresse) Evaluer l’impact des communautés microbiennes symbiotiques sur la régénération naturelle des peuplements forestiers et sur la revégétalisation des sols salés Etudier l’impact des essences introduites sur la structure et les fonctions des communautés microbiennes natives Utiliser les symbioses pour améliorer la productivité végétale et la fertilité des sols.

Plantes étudiées: niébé, arachide, Acacia, Coccoloba, Casuarina, Eucalyptus, Gilbertiodendron, Jatropha, Graminées fourragères Ectomycorhizes Nodules Champignons Mycorhizes à arbuscules rhizobiums, Frankia

FORMATION ET VALORISATION AXES DE RECHERCHE Structure du sol Macro-éléments (N, P) Stress abiotiques Communautés non symbiotiques 3 2 Communautés symbiotiques 1 Caractéristiques physico-chimiques Microflore 4 5 Communautés végétales Mise en place et adaptation des symbioses Régénération, productivité et durabilité des écosystèmes naturels ou anthropisés Sol Végétation FORMATION ET VALORISATION Transfert de technologie (Producteur, PME champignons comestibles) Formation (Master, thèse) Production scientifique (Publication, brevet)

AXES DE RECHERCHE Axe 1: Analyse de la structure et de la diversité fonctionnelle des communautés de symbiotes microbiens Axe 2: Interactions entre flore non symbiotique et flore symbiotique du sol Axe 3: Interactions entre les caractéristiques physico-chimiques du sol et les communautés de symbiotes fongiques et bactériens Axe 4: Interactions entre la couverture végétale et la structure et la diversité fonctionnelle des communautés mycorhiziennes et rhizobiennes des sols Axe 5: Impact de la diversité des symbiotes fongiques et bactériens sur l’adaptation des plantes aux stress abiotiques, la productivité et la durabilité des écosystèmes naturels ou anthropisés

OUTILS Microbiologie (hottes, étuves etc.) Plateforme en microscopie (optique, loupe bino…) Biologie moléculaire (amplificateur ADN, électrophorèse, lecteur de gel...) Conservation de souches (congélateurs -20°C, -80°C) Chambres de culture, serres, dispositifs expérimentaux en milieu paysan, en forêt

FORMATION Forte implication du LCM dans les formations de l’UCAD: Coordination du Master Biotechnologies végétale et microbienne, et de la Licence Professionnelle en Agronomie Enseignements dans les Masters Biotechnologies végétale et microbienne, Ecologie et Agroforesterie, Biomathématique-Bioinformatique, Phytopharmacie et protection des végétaux, Master International de Biotechnologies tropicales Laboratoire d’accueil (Master 2 et thèse) de l’école doctorale « Sciences de la Vie, de la Santé et de l’Environnement » De nouveaux modules d’enseignement en génomique dans le Master Modélisation des Plantes et Bio-informatique et en écophysiologie végétale dans le Master Ecologie et Agroforesterie

VALORISATION Transfert de la technique de l’inoculation auprès des producteurs Publications et brevets Projet sur la production de champignons comestibles

RESSOURCES FINANCIERES Frais structurels pris en charge par l’IRD Parts chercheurs UMR LSTM et UMR DIADE Projets en cours: SOLAO ANR (2008-2012), Chaire Croisée IRD/UCAD (2010-2013), 2 FIRST (2010-2012), AUF (2011-2013), FIRST (2012-2014), IFS (2012-2014) Projets soumis : CORAF Projets en préparation : LMI, UA, PPR-FTH, FNRAA

PARTENARIAT Collaborations nationales : ITA, ISE, ANCAR, CNCR, CERAAS, ENSA, ROPPA, Départements de Biologie Végétale, Biologie Animale, Chimie et Biochimie ; Ecole Supérieure Polytechnique, Faculté de Médecine, Université Gaston Berger, Université de Ziguinchor, Université de Thiès, Ministère de l’Enseignement Supérieur et la Recherche Scientifique, Ministère de l’Agriculture, Ministère de l’Environnement et de la Protection de la Nature. Collaborations internationales et régionales : Université des Antilles et de la Guyane, Université Montpellier 2, Michigan State University, Université Laval, Université d’Oran, Université Mohamed V, Université Mohamed Premier Oujda MAROC, Université Abdou Moumouni de NIAMEY (NIGER), Université d'Abomey Calavi au Bénin, Université de Bamako, Université de Nouakchott, INERA (Burkina Faso), Université de Cotonou, de Nouackchott, Université d’Alger, Université de Tananarivo, Université Cadi Ayyad (Faculté des Sciences Semlalia), KEFRI (Kenya), TSBF (Kenya), AUF, CIRAD INRA, INERA, IRAG, CILSS, UNESCO, FAO, UEMOA, AIEA (Autriche), LMI-Maroc, UMRDIA-PC, SupAgro/UM2/INRA/IRD, UMR LSTM IRD/CIRAD/SupAgro/UM2/INRA, UR SeqBio IRD, UMR CBGP INRA/IRD, Montpellier SupAgro, INRA de Dijon et INRA de Bordeaux.

CONSEIL DE LABORATOIRE ASSEMBLEE DE LABORATOIRE CONSEIL DE GESTION B.S. Toguebaye (UCAD), S. Fall (ISRA), G. De Noni (IRD) CONSEIL DE LABORATOIRE ASSEMBLEE DE LABORATOIRE DIRECTEUR A. Bâ SECRETARIAT A. Konté GESTION & LOGISTIQUE F. do Rego RESPONSABLES QUALITES M. Cissoko, M. Da Sylva CHERCHEURS PERMANENTS (14) UCAD : A. Diédhiou, T. Diop, D. Diouf, A. Kane, I. Ndoye, M. Thiao, R. Samba, S. Sylla, A. Diouf IRD: A. Champion, L. Laplaze, A. Bâ ISRA: S. Fall, D. Fall CHERCHEURS CONTRACTUELS (3) IRD: A. Thomas (postdoc), T. Wade, N. Diagne REPRESENTANT PERSONNEL (1) ET ETUDIANT (1) INGENIEURS & TECHNICIENS (9) IRD: J. Bakhoum, M. Cissoko, F. Do Rego, M. Faye, C. Ndiaye, P. Tendeng, A. Crabos ISRA: M. Da Sylva, O. Touré DOCTORANTS (12) N. Bakhoum, A. Dieng, M. Ngning, F. Ndoye, G. Sène, S. Sène, A. Soumaré, M. Ebenye, F. Diouf, C. Ouattara, I. Diop, F. Fall, H. Prodjinoto, I. Diedhiou

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