L’identification des micro-organismes par spectrométrie de masse type « MALDI-TOF »
Matrix Time Assisted Of Laser Flight Desorption Ionization Séparation différentielle d’ions en fonction de leur rapport m/z Obtention d’un spectre spécifique de l’échantillon analysé
Les appareils disponibles sur le marché…
Mode opératoire du dépôt…
La matrice… c’est quoi… ? UNE MOLECULE ACIDE ELLE CEDE UN PROTON
Que se passe-t-il dans l’appareil…?
Que se passe-t-il dans l’appareil…?
L’acquisition du résultat sous forme de spectre
Comparaison aux collections de spectres… détermination du score < 1,7 : absence d’identification 1,7<score<2 : identification au genre ou plusieurs espèces possibles Analyses supplémentaires. 2 : identification de l’espèce.
Identification d’une souche pathogène…
Les avantages… RAPIDITE EVIDENTE GAIN DE PLUSIEURS HEURES A PARTIR DE LA CULTURE SUR GELOSE réduction d’un facteur 55 ! Remarque: levures, moisissures, mycobactéries… protocole spécifique à cause de la composition pariétale : délai légèrement plus long à partir de la culture.
Les avantages… COÛT REDUIT ! Réduction d’un facteur 5 à 10 pour les coûts par rapport aux analyses biochimiques conventionnelles, et d’un facteur 90 par rapport aux analyses de biologie moléculaire.
Des difficultés d’identifications peuvent apparaître en cas : Quelques inconvénients… Des difficultés d’identifications peuvent apparaître en cas : MAIS AUSSI…
D’où la bonne qualité d’un geste technique simple…
Quelques inconvénients…
Les résultats de niveau de confiance moyen… Expérience du technicien: contexte clinique (urine, selle?), caractère biochimique simple… (Shigella lac - / E.coli lac +)
Les résultats de « pathogènes critiques »… Expérience du technicien: sérotypage obligatoire… technique de base qui doit être maîtrisée !