Compte rendu réunion PPA 30 octobre 2018, INRA

Contexte Emergence de la PPA en Europe. Au départ : initiative interne INRA du département SA pour identifier les équipes mobilisables sur le sujet, les fronts de sciences et les thématiques sur lesquelles des équipes du dpt SA pourraient démarrer des projets avec l’aide de financements ciblés et incitatifs Prochain Era-Net Internationnal Collaborative Research Animal Disease (volet PPA annoncé) : se préparer à répondre à cet appel à projet. Contexte élargi aux acteurs de la recherche française en SA (ANSES, CIRAD, INRA et ENV) Contexte élargi aux autres acteurs de la SA (RFSA)

Objectif de la journée Faire un point avec les acteurs nationaux et internationaux sur la situation au 30 Octobre et sur les mesures mises en place: Didier Calavas (Coordinateur de la plateforme ESA) Anne Bronner (BSA de la DGAL) Lina Awada (OIE) Point sur les recherches menées par les équipes travaillant sur le sujet en France, positionnement/international et leur point de vue sur les fronts de sciences Marie Frédérique Pottier et Nicolas Rose (Anses) Ferran Jori (CIRAD) Identification de thématiques et fronts de science à explorer en fonction des forces présentes en recherche en France

Les participants à la journée 41 participants (INRA, ANSES, CIRAD, ENVT, VetAgroSup, ENVA, ONIRIS, IRD, Institut Pasteur, DGAl, OIE, RFSA) Les équipes de recherches déjà engagées sur PPA en France: 1 Equipe ANSES-Ploufragan (Marie-Frédérique Potier et Nicolas Rose) UMR CIRAD-INRA ASTRE Montpellier (Ferran Jori)

Les principaux freins aux recherches sur PPA Virus: virus ADN contenant 150-165 gènes / seul membre des asfviridae Niveau de confinement L3 Culture in vitro difficile Réponse immunitaire Reste beaucoup d’inconnus (mode de transmission, peu de données génomiques, facteurs de virulence?).

Les thématiques à explorer (1er atelier) Surveillance et contrôle en cas d’introduction Transmission/Epidémiologie Physiopathologie (interactions Hôtes/Pathogènes) Vaccination (très compétitif au niveau européen)

Surveillance/contrôle (2ieme atelier) Diversité et évolution du virus (phylodynamique): compréhension de la propagation du virus + conséquences en terme de diagnostic (EX: en Chine multi-introduction? Évènements indépendants? Détection des carcasses: estimer la probabilité de détection des carcasses, de détection des foyers et des délais de déclaration Améliorer la surveillance (le contrôle): caractériser les acteurs en ien avec filières porcines, leurs perceptions et leurs interactions: Affiner la typologie des acteurs Description des interactions entre les acteurs Estimation de l’impact socio-économique des mesures de surveillance en fonction des acteurs et de leurs interactions.

Transmission / Epidémiologie (2ieme atelier) Transmission du virus en Europe de Fane sauvage vers animaux domestiques: rôle de vecteurs arthopodes potentiels (tabanidés, stomox, etc…); asticots (écologie de la carcasse et risque de transmission via les caracasses)? Canibalisme? Contact Faune sauvage/ Faune domestique (Ex quelles relations entre le niveau de contact FS et FD et dynamique régionale?) Rôle des animaux asymptomatiques Epidémiologie Facteurs de risques et voies de transmission selon les contexte: Via épidémio analytique sur les données EU (y compris génomiques) Impact des conduites d’élevage sur dynamique épidémiologique (comparaison de zones contrastées: porcs de basse cours, plein air, élevage semi-indusctriel, etc…) Quels risques associés à uneévolution de la conduite plein air? Comment minimiser risque le risque de transmission par gestion de la FS

Physiopathologie (interaction virus/hôtes) Voies d’entrée du virus –tropisme cellulaire (susceptibilité des sous populations cellulaires de la sphère oro-pharyngée).Localisation virale en système in vivo (virus fluo) Réponse immunitaire de l’hôte vis à vis du virus: Cinétique de la réponse immunitaire en fonction de souches plus ou moins virulentes, de l’origine des souches. Screening de la réponse antivirale pour identifier les partenaires cellulaires essentiels dans la réponse immunitaire précoce. Mécanismes de virulence, de pathogénicité, de franchissement de barrière d’espèce: Approches protéomiques/double hybride pour identifier les interactions entre protéines virales et de l’hôte.

Vaccination (2ième atelier) Beaucoup d’équipes déjà engagées CD8+T cells: cellule clé pour le contrôle du virus (leur présence corrèle avec bas niveau de virémie) - Vaccins ADN ?

Quelles forces mobilisables pour la recherche sur PPA en France? Epidémiologie: UMR INRA-CIRAD ASTRE, UMR INRA-ONIRIS BIOEPAR, Unité Anses Ploufragan, ONCFS Epidémiologie moléculaire: UMR INRA-VetAgroSup EPIA, UMR INRA-CIRAD ASTRE. Physio-Path: UMR INRA-Uni Tours ISP, USC INRA PAVAL, UMR INRA-ENVA- Anses VIRO, Unité ANSES de Ploufragan. Transmission vectorielle: UMR INRA-CIRAD ASTRE Sciences Humaines et Sociales: UMR INRA ENVT IHAP; Unité LRDE INRA Labo L3 (INRA, ANSES, ENV), Installation expérimentales pour expé in vivo (Infrastructure Nationale Emerg’in).

Priorités de recherches PPA (STAR-Idaz) – Prochain ERA-NET Pathogen biology e.g. characterization and evolution of currently circulating isolates in Europe and Africa including full genome sequencing, genes related to host protection, biological and molecular aspects; Natural host e.g. host factors that determine the different clinical forms, genome markers related to the virulence of ASFV isolates’ geographical distribution of Ornithodoros ticks; Epidemiology e.g. role of host, vector and environment under different conditions of epidemiological scenarios, role of wild boars in transmission, maintenance and dissemination, the role of other reservoirs in the transmission of the disease, transmission studies between pigs and wild boars, seasonal cycle of Ornithodoros ticks; Host immunology e.g. role of viral proteins in inducing effective immune mechanisms in surviving animals; mechanisms of viral persistence in the host, interaction between ASFV, macrophages and other cells in the host; Diagnosis and Vaccines e.g. non-invasive sampling methodologies for wild boars, cell lines for replacing primary cell cultures, new vaccine and vaccine strategies, studies on existing live attenuated vaccine candidates need further investigation on side effects, virus persistence, doses and other parameters of safety, knowledge on mechanisms to evade immune response, to induce protection and reduce pathogenicity. Surveillance: how to improve surveillance (more then diagnostic)

Quelles suites à donner? Aide au montage de projets européens (réseau) (ERA-Net ICRAD) Projets incitatifs via les instituts de recherches (Département SA: crédits dès 2019 pour projets incitatifs – environ 10 000 Euros/projet) RFSA? Sur quelles thématiques? Quelles modalités? A DISCUTER