Bilan d’activités PHYTOCOT 2012

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Transcription de la présentation:

Bilan d’activités PHYTOCOT 2012 Natacha Guiselin (CDD-IR)

Base de données Base de données postgreSQL (D. Dessailly ) Conversion carbone Base de données postgreSQL (D. Dessailly )

Exploitation et valorisation données de cytométrie en flux Base de données BdD Cyto2 postgreSQL (D. Dessailly et X. Mériaux ) BdD terrain2 Exploitation et valorisation données de cytométrie en flux

Alternative cytométrie en flux Base de données Matchups Seawifs 200 analyses pigmentaires 5000 analyses taxons (CPR) Alternative cytométrie en flux

Cytomètre « classique » Apports de la cytométrie en flux (CytoSense) Ex: Beckman Coulter Epics XL Flow Cytometer Cytomètre Cytosense Cytomètre « classique » Analyse automatisable in situ Analyse en laboratoire Jusqu’à 5 mL < 1 mL De 1 à > 1000 µm 0.5 - 30 µm Profils optiques (pulse-shape cytometry) Intégration de pics

Informations supplémentaires sur les IOPs Apports de la cytométrie en flux (CytoSense) Température Salinité Informations supplémentaires sur les IOPs Variabilité liée à la composition phytoplanctonique, à la physiologie en relation avec les conditions environnementales

Relation biovolume-FWS Apports de la cytométrie en flux (CytoSense) Estimation biomasse Fluorescence rouge = proxy chla (coll. M. Thyssen) Diffusion avant (FWS) = proxy biovolume Relation biovolume-FWS Cultures phytoplanctoniques

Aide à la labellisation pour la méthode PHYSAT (coll. Thyssen) Apports de la cytométrie en flux (CytoSense) Aide à la labellisation pour la méthode PHYSAT (coll. Thyssen) Expertise et connaissances sur les populations phytoplanctoniques locales par cytométrie

Exercice de calibration Détection et fonction de poids Etudes optiques et expériences Conversion des mesures de diffusion par cytométrie (FWS et SWS) (coll. L. Duforêt) Exercices de calibration et simulations théoriques (théorie de Mie, T-matrix...) Θ DETECTOR PARTICLE ΔΩ Exercice de calibration Billes d'indice de réfraction et taille connus Détection et fonction de poids Particularités instrumentales

Activité de cultures et dispositif expérimental (microcosme) Etudes optiques et expériences Activité de cultures et dispositif expérimental (microcosme) Aspects pratiques, mesures en laboratoire, acquisition de données

Guiselin Natacha, Duforêt-Gaurier Lucile and Alvain Séverine Guiselin Natacha, Duforêt-Gaurier Lucile and Alvain Séverine. CytoSense potential use in a remote sensing context. Poster Ocean Optics XXI, Glasgow, 08-12 October 2012