ARABIDOPSIS

Arabidopsis thaliana Classe : Angiospermes Eudicotylédones Ordre : Capparales Famille : Brassicaceae Genre : Arabidopsis Espèce: thaliana Nom commun: Arabette des dames

Arabidopsis thaliana Origine : Eurasie Port : Herbacée, 30-40cm Racine : Pivotante Feuille : Alterne, stipulée Inflorescence : Grappe Fleur : 4S+4P+(4+2)E+2C Pollen : Tricellulé Fruit : Silique ( 2 carpelles soudés ouvert avec un septum) Graine : 30-60 graines /silique :10000/plante

Avantages d’ Arabidopsis thaliana Cycle de croissance rapide Production de semences prolifique et culture facile dans un espace réduit Petit génome : 125.000 kb Cartes génetiques et physiques des 5 chromosomes et séquençage terminé Méthodes de transformation efficace utilisant Agrobacterium tumefaciens Grand nombre de lignées mutantes et de ressources genomiques

x4 X 20

TAIR ; http://arabidopsis.org Le site : The Arabidopsis Information Resource: TAIR ; http://arabidopsis.org donne un vue intégrée des données génomiques pour Arabidopsis thaliana. en 2002 etaient enregistrés à travers le monde 11000 chercheurs 4000 organismes

Brassicaceae Arabidopsis thaliana Brassica Raphanus Plus de 100 autres genres Arabidopsis thaliana Brassica Raphanus

Relations entre espèces du genre Arabidopsis

Stade de développement : Arabidopsis Germination Production feuilles Rosette Emergence inflorescence Floraison Maturité silique jours

germination

germination

cotylédons

Plante en rosette

Arabidopsis thaliana

Plante en floraison

Feuilles de la tige Entre-nœud Feuillesde la rosette racines

SILIQUE

Formation de la silique

Embryogenèse Arabidopsis

heterophyllie

Major Characteristics of A. Thaliana More than 30 000 genes representing about 11,000 gene families Useful in comparative genomics Much smaller genome than crop plants 800 genes unique to the plant kingdom involved in photosynthetic activities; evolved from cyanobacteria

Subtleties of A. Thaliana Fairly uniform gene density, expression levels, and repeat distribution Gene density about 1 gene per 4.4 kB The transcribed portions of plant genes average about 1.9 kb in size Therefore, transcribed genes account for about 40–45% of the DNA.

The volume of data resulting from Arabidopsis research has grown exponentially over the years, largely due to whole genome analyses. 400,000 nucleotide sequences, 200,000 mutant lines, 4,000 genetic markers, 90,000 polymorphisms, over14,000 publications available to the researchers.

5 Chromosomes d ’Arabidopsis

Chromosome 5 avec quelques mutants

Fleur d’Arabidopsis

Fleur d ’Arabidopsis et Ses MUTANTS

Méristème floral

Phenotypes de mutations florales chez Arabidopsis Wildtype Apetala-2(ap2) Pistillata(pi) Agamous(ag)

Expression des gènes floraux

Mutants floraux

Pétales + étamines Arabidopsis flower showing the expression of a AtOPT3-GUS (b-glucuronidase) fusion.

FWA LFY TFL1 FT AP1 AP2 CAL UFO SUP AG PI AP3 AP2 AP1 CFL HUA SEP1/2/3 HEN WUS CRC SPT sepal carpel stamen petal Modèle d ’interaction des gènes du développement floral

Arabidopsis : mutants de développement végétatif

sauvage Mutants de l ’embryogenèse

Méristème caulinaire

Mutants du méristème caulinaire

Méristème racinaire

Mutants racinaires

Mutant de la zone pilifére cpc wer wt 500 µ

inconvénients