Université d’Ottawa - Bio 4518 - Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay 2015-05-08 16:44 1 Epistémologie, méthode scientifique et.

Slides:



Advertisements
Présentations similaires
Test statistique : principe
Advertisements

Les tests d’hypothèses (I)
Inférence statistique
Comparaison d'une distribution observée à une distribution théorique
Les Tests dhypothèses. 1)Définition Un test cest une méthode qui permet de prendre une décision à partir des résultats dun échantillon.
Module n°3 : Initiation au raisonnement déductif
Méthodes de Biostatistique
LES CONDITIONS DE LA GERMINATION
Paul-Marie Bernard Université Laval
L’inférence statistique
Pourquoi les statistiques ?
Objectifs du chapitre 12: Interprétation des résultats
POLI-D-208 Introduction à la recherche en sciences politiques Partie Exercices Titulaire: Jean-Benoit Pilet.
La puissance statistique
La puissance statistique
Université dOttawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :47 1 Concepts fondamentaux: statistiques et distributions.
Les modèles linéaires (Generalized Linear Models, GLM)
Analyse de variance à un critère de classification (ANOVA)
Corrélation Principe fondamental d’une analyse de corrélation
Comparaison de deux échantillons
ANOVA à critères multiples
Test de signification d’une ANOVA à deux critères de classification: sans réplication, modèle I, plan factoriel Tester CMeffet sur CMerreur... … mais,
ANOVA à critères multiples
Qu’est-ce que la science?
Les énoncés conditionnels
Méthodes de Biostatistique
Méthodes de Biostatistique
La démonstration en mathématiques
Cédric LAOUENAN 20/11/2008 Tests statistiques Cédric LAOUENAN 20/11/2008
Test d'hypothèse pour des proportions:
INTRODUCTION Définir les concepts de science et de méthode scientifique Faire le lien entre astronomie, physique et astrophysique.
Probabilités et Statistiques Année 2010/2011
Régression linéaire simple
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :35 1 Comparaisons multiples Ce qu’elles sont.
Concepts fondamentaux: statistiques et distributions
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :56 1 BIO 4518 Biostatistiques appliquées Antoine.
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :52 1 Comparaisons multiples Ce qu’elles sont.
Tests d’ajustement à une distribution théorique
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :51 1 Messages 1er décembre: date limite pour.
L’erreur standard et les principes fondamentaux du test de t
Analyse de variance à un critère de classification (ANOVA)
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :05 Asymétrie fluctuante.
Raisonnement et logiques
Méthodes de Biostatistique Chapitre 9 Tests Nonparamétriques.
Révision des concepts fondamentaux
1.  On souhaite comparer deux traitements dans le cadre d’un essai randomisé sur les lombosciatiques :  corticoïdes par infiltrations  placebo  Critère.
Test de signification d’une ANOVA à deux critères de classification: sans réplication, modèle I, plan factoriel Tester CMeffet sur CMerreur... … mais,
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :46 1 Régression logistique.
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :18 Bootstrap et permutations.
Quelques commentaires sur les tests statistiques
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :36 1 Tableaux de contingence et modèles log-
LA RECHERCHE B. GOUNAND F. GAILLARD.
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :19 1 BIO 4518 Biostatistiques appliquées Antoine.
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :34 1 Les modèles linéaires (Generalized Linear.
BIO 4518 Biostatistiques appliquées
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :15 1 GLM Exemples.
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :47 1 Comparaison de deux échantillons Principes.
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :37 1 Régression linéaire simple et corrélation.
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :46 1 Devoir 3 (aa) on vous demande de déterminer.
University of Ottawa - Bio 4118 – Applied Biostatistics © Antoine Morin and Scott Findlay 24/07/2015 2:29 PM Bootstrap et permutations.
Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :26 1 Programme Devoir 1 Proposition travail.
University of Ottawa - Bio 4118 – Applied Biostatistics © Antoine Morin and Scott Findlay 13/08/2015 6:59 PM Bootstrap et permutations.
Évolution et diversité du vivant (101-NYA-05)
La démonstration La démonstration est une forme de raisonnement qui passe par le discours sans avoir recours à l’expérience. C’est une suite logique de.
Chapitre 4 Concepts fondamentaux Les composantes d’un test statistique Les hypothèses nulles en statistiques Le sens de p Inférence: comment traduire p.
Académie européenne des patients sur l'innovation thérapeutique Rôle et notions élémentaires des statistiques dans les essais cliniques.
Chapitre 6 Les tests d ’ hypoth è se 1 – Comparer des moyennes ou des proportions.
Biostatistique pour le troisième cycle P. Leroy, F. Farnir 2013.
Jean Gaudart1 Détection de clusters spatiaux d'évènements Jean Gaudart Labo. Biostatistiques Faculté de Médecine de Marseille.
Transcription de la présentation:

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 1 Epistémologie, méthode scientifique et statistiques Comprendre fondements logiques de l’inférence statistique Pouvoir distinguer la théorie (modèle ou hypothèse) de la prédiction Pouvoir distinguer l’induction de la déduction Pouvoir énoncer une hypothèse nulle correspondant à une hypothèse biologique

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay : °00' -45°05' D13 D8 D15 D1 D4 D3 D10 D5 D16 D9 D12 U17 Cornwall D11 D6 STP 74°45'74°30' 1: D2 STP Courtaulds Domtar GM Reynolds Moses-Saunders Dam Cornwall Island ALCOA D14 8 km Lac Saint-François Impact des effluents industriels sur la contamination en métaux lourds des invertébrés Sont-ils contaminés par les effluents industriels?

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 3 La méthode hypothetico-déductive Hypothèse Prédictions Observations Conclusions InductionDéduction Expérience Inférence Question Écologie Statistiques Logique Techniques écologiques Statistiques Logique Écologie

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 4 Hypothèse Invertébrés contaminés par les effluents locaux Distance [Métal] eau Zone d’impact

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 5 Déduction Si effluents locaux contaminent les invertébrés alors la concentration en métal des invertébrés sera plus haute dans la zone d’impact qu’ailleurs Distance [Métal] inv Zone d’impact

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 6 Prédiction Concentration des métaux dans les invertébrés est plus élevée dans la zone d’impact qu’en amont ou en aval. Distance [Métal] inv Zone d’impact

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 7 Expérience Mesurer la concentration des métaux dans les invertébrés récoltés en amont, dans et en aval de la zone d’impact.

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 8 Résultats Falsifiant l’hypothèse Concentrations dans la zone d’impact ne sont pas plus hautes Observations falsifient l’hypothèse

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 9 Resultats Supportant l’hypothèse Concentration plus élevée dans la zone d’impact Observations supportent l’hypothèse

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 10 Inférence et conclusion Si l’hypothèse est falsifiée elle doit être fausse Si l’hypothèse est supportée, elle peut être vraie (condition nécessaire mais non suffisante)

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 11 Hypothèse nulle Comme on ne peut prouver qu’une hypothèse est vraie… …mais qu’on peut démontrer qu’elle est fausse… … le truc est de prouver que le contraire de notre prédiction est faux! (tordu, non?) i.e: falsifier l’hypothese nulle

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 12 Hypothèse nulle (H 0 ) Prédiction –Concentration des métaux est plus élevée dans la zone d’impact. H 0 –Concentration est plus basse (ou égale) dans la zone d’impact qu’ailleurs.

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 13 Inférence statistique Tests statistiques (t, regression, chi-carré) ….. … donnent la « probabilité que l’hypothèse nulle soit vraie » p>0.05 accepter H 0 p<0.05 rejeter H 0 accepter H A

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 14 Sommaire Hypothèse –Invertébrés contaminés par sources locales. Déduction –Si les source locales sont importantes, alors les invertébrés dans la zone d’impact seront les plus contaminés Prédiction –Contamination plus élevée dans zone d’impact. H 0 –Contamination est plus faible ou égale dans la zone d’impact.

Université d’Ottawa - Bio Biostatistiques appliquées © Antoine Morin et Scott Findlay :44 15 Exercice Pour chaque situation, générer 3 hypotheses, deduire leurs predictions, and énoncer les hypothèses nulles correspondantes Cas de dermatite du baigneur en hausse au lac Philippe Concentration de coliformes fécaux est plus élevée près de la berge à la plage Brittania Pelouse est plus verte chez le voisin