Diversité du VIH Surveillance dans le cadre de la DO F Barin Inserm ERI 19 - CNR VIH CHU Bretonneau - Université F Rabelais Tours
Diversité du VIH HIV-1 HIV-2 HIV-1O HIV-1M HIV-1N A C virus mosaïques B D E G H I J F CRF01-AE > 30 CRFs CRF04-cpx K
Diversité du VIH HIV-1 HIV-1O HIV-1M HIV-1N A C virus mosaïques B D E G H I J F CRF01-AE > 30 CRFs CRF04-cpx K
Distribution géographique
Résultats (mars 2003 – décembre 2005) 11 190 nouveaux diagnostics 18 HIV-1/2 (0.2%) 131 HIV-2 (1.4%) 10 874 HIV-1 10 892 543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O 2 HIV-1M/O 3 428 non-B** (45.9%) 414 NT(M) 4 039 B* (54.1%) * dont 2 co-infections HIV-2 ** dont 16 co-infections HIV-2 2 457 non disponibles 167 inconnus
HIV-2 Côte d’Ivoire (n=54) France (n=15) Portugal (n=2) Mali (n=17) Senegal (n=9) Guinea (n=7) Guinea-Bissau, Ghana, Mauritania (n=3) Cape-verde (n=2) Burkina, Gambia, (n=1) Cameroon (n=1) Congo (n=1) Madagascar (n=1) Algérie, Peru, Colombie (n=1) Unknown (n=26)
HIV-2 HIV-1 group O France (n=2) Côte d’Ivoire (n=54) Cameroon (n=8) Portugal (n=2) Côte d’Ivoire (n=54) Mali (n=17) Senegal (n=9) Guinea (n=7) Guinea-Bissau, Ghana, Mauritania (n=3) Cape-verde (n=2) Burkina, Gambia, (n=1) Cameroon (n=1) Congo (n=1) Madagascar (n=1) Algérie, Peru, Colombie (n=1) Unknown (n=26) HIV-1 group O France (n=2) Cameroon (n=8) Chad (n=1)
Résultats (mars 2003 – décembre 2005) 11 190 nouveaux diagnostics 18 HIV-1/2 (0.2%) 131 HIV-2 (1.4%) 10 874 HIV-1 10 892 543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O 2 HIV-1M/O 3 428 non-B** (45.9%) 414 NT(M) 4 039 B* (54.1%) * dont 2 co-infections HIV-2 ** dont 16 co-infections HIV-2 2 457 non disponibles 167 inconnus
Résultats: B vs non-B (mars 2003 - décembre 2005) p N % (IC 95 %) Sexe Hommes 1 406 32.8 (31.4 - 34.2) < 0.0001 Femmes 2 006 63.5 (61.9 - 65.2) Mode de contamination Rapports homosexuels 197 12.0 (10.4 - 13.6) Rapports hétérosexuels 2 489 58.4 (56.9 - 59.9) Injection de drogues 27 15.8 (10.3 - 21.3) Autres/Inconnu 699 50.8 (48.1 - 53.4) 3 412 / 7 449 (45.8%)
Résultats: B vs non-B (mars 2003 - décembre 2005) p N % (IC 95 %) Nationalité France 666 21.4 (20.0 - 22.9) < 0.0001 Europe (hors France) 45 30.4 (23.0 - 37.8) Afrique subsaharienne 2 096 78.6 (77.0 - 80.1) Afrique du Nord 57 37.5 (29.8 - 45.2) Autres/Inconnu 548 39.9 (37.3 - 42.5)
B vs non-B / infections récentes (mars 2003 - décembre 2005) Homo-bisexuels Nationalité France (795) 369 63 363 Europe (hors France) (26) 11 1 14 Afrique sub-saharienne (7) 3 4 - Afrique du Nord (4) 2 Autres/Inconnu (118) 45 9 64 Total (950) 430 77 443 (46.6%) 77/507 (15.2 %) 63/432 (14.6 %)
B vs non-B / infections récentes (mars 2003 - décembre 2005) Rapports hétérosexuels Nationalité France (422) 158 96 264 Europe (hors France) (8) 4 3 1 Afrique subsaharienne (229) 42 127 60 Afrique du Nord (21) 7 5 9 Autres/Inconnu (133) 55 41 37 Total (813) 266 272 275 (33.8%) 272/538 (50.6%) F: 96/254 (37.8%) non-B Af S-S: 42/169 (24.9%) B
Résultats (mars 2003 – décembre 2005) 11 190 nouveaux diagnostics 18 HIV-1/2 (0.2%) 131 HIV-2 (1.4%) 10 874 HIV-1 10 892 543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O 2 HIV-1M/O 3 428 non-B** (45.9%) 414 NT(M) 4 039 B* (54.1%) * dont 2 co-infections HIV-2 ** dont 16 co-infections HIV-2 2 457 non disponibles 167 inconnus NT: infections récentes pour la plupart
Analyse phylogénétique Génotypage sur DSS RNA extraction RT-PCR (env) JC Plantier et al., AIDS 2005 - 460 bp Séquençage Analyse phylogénétique 302 échantillons sélectionnées: 100 M 168 NT Plupart récents. M et NT consécutifs (< 20 janvier 2005) 22 B 12 NB
Résultats: génotypage B Non-B Non-amplifiés Sérotypage B (22) 12 1 9 Non-B (12) - 6 M (100) 38 53 Non-typables (168) 75 28 65 Total (302) 125 44 133 CRF02_AG: 20 A: 7 G: 4 CRF01_AE: 2 D: 2 F: 2 Autres: 7
Résultats: génotypage (facteurs de risques) Hommes Femmes B Non-B NT Total Homo-Bis. 80 13* 47 140 - UDI 2 1 3 Hétérosex. 20 5 23 48 17 46 Inconnu 6 4 12 22 9 106 82 210 19 51 92 * Dont 9 français nés en France