27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 27 ème journée ISS France Caractérisation de milieux cellulaires partiellement observé par imagerie microscopique 3D David Legland - INRA TPV-URPOI Transformation des Produits Végétaux Unité de Recherche sur les Polysaccharides, leur Organisation et leurs interactions

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Plan Contexte Développements – Correction des défauts dacquisition – Amélioration de limage – Segmentation – Mesures et estimations Prolongements

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Contexte biologique Objectif : caractériser un matériau cellulaire végétal Paramètres physico- chimiques, mécaniques, sensoriels ou génétiques Analyse par imagerie

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Démarche générale Échantillonnage Prélèvements et acquisition images Segmentation Développement destimateurs Étude des différences entre variétés

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Choix et échantillonnage du matériau Étude du péricarpe de tomate Traversées le long du péricarpe Échantillonnage uniforme à la surface de la tomate

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Acquisition des images Pile dimages (512 x 512 x 30)

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Correction baisse de luminosité Image de référence Image à corriger Image corrigée Utilisation du « Matching » dhistogramme

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Amélioration des lignes Maximum de plusieurs filtres directionnels

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Segmentation : Ligne de partage des eaux Détection des marqueurs : minima étendus + filtrage morphologique Image amélioréeDétection des minima Ligne de partage des eaux Traitement morphologique

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Segmentation 2D

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Segmentation 3D

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Prolongements : Classification des différentes phases Développements destimateurs adaptés à la nature partielle des observations Cartographie des propriétés géométriques des espaces cellulaires et intercellulaires

27 ème journée ISS France - jeudi 5 février /13 Deux variétés de tomate : Cameron Quest