Un point sur le WP 10 Tests WP6/WP7 en cours délaboration Yannick LEGRÉ – DataGrid France – Lyon 19 juillet 2001

Activités actuelles du WP10 Révision du cahier des charges dune grille biologique (deliverable 10.1) –Élaboration du cahier des charges avec le concours de biologistes (E.B.I., Karolinska, BBE Lyon, …) –Discussion avec lATF et les groupes middleware Déploiement de tests de génomique comparative –Exemple : SwissProt vs SwissProt –Support dun outil de démonstration –DataMining Yannick LEGRÉ – DataGrid France – Lyon 19 juillet 2001

But des tests… Étudier la « parallélisation » dun algorithme de bio-informatique (BLAST) Trouver les goulots détranglement dans le lancement simultané de plusieurs centaines, voire milliers, de jobs Monitorer les réseaux Envisager des scénarii de multi-casting Yannick LEGRÉ – DataGrid France – Lyon 19 juillet 2001

État des sites disponibles pour les tests WP10 CC IN2P3 (cluster 380 processeurs) Marseille ( 2 – 4 processeurs) Lyon RESAM (cluster 10 processeurs) E.B.I. (cluster) R.A.L. (cluster 300 processeurs) Lund (cluster 10 processeurs) Uppsala (2 processeurs) Clermont-Ferrand (cluster 4 processeurs + 3 processeurs)

Déroulement des tests DB BLAST DB BLAST dedzedzdzedezdzecdscs dcscdssdcsdcdscbscdsbc bjbfvbfvbvfbvbvbhvbhs vbhdvbhfdbvfdbvdfvfdv hbdfvbhdbhvdsvbhvbhd vrefghefgdscgdfgcsdycg dkcsqkcqhdsqhfduhdhd hqedezhdhezldhezhfehfl ezfzeflehfhezfhehfezhfl ezhflhfhfelhfehflzlhfzdj azslzdhfhfdfezhfehfizhfl qfhduhsdslchlkchudcscs cdscdscdscsddzdze dedzedzd zedezdze cdscsdcsc dssdcsdc dscbscds bcbjbf RESULTAT dedzedzdzedezdzecdscsdcscdssdcsd cdscbscdsbcbjbfvbfvbvfbvbvbhvbh svbhdvbhfdbvfdbvdfvfdvhbdfvbhd bhvdsvbhvbhdvrefghefgdscgdfgcsd ycgdkcsqkcqhdsqhfduhdhdhqedezh dhezldhezhfehflezfzeflehfhezfhehf ezhflezhflhfhfelhfehflzlhfzdjazslzd hfhfdfezhfehfizhflqfhduhsdslchlkc hudcscscdscdscdscsddzdzeqvnvqvn q! Vqlvkndlkvnldwdfbwdfbdbd wdfbfbndblnblkdnblkdbdfbwfdbfn dedzedzd zedezdze cdscsdcsc dssdcsdc dscbscds bcbjbf Yannick LEGRÉ – DataGrid France – Lyon 19 juillet 2001

Déroulement des tests (2) DB BLAST dedzedzdzedezdzecdscs dcscdssdcsdcdscbscdsbc bjbfvbfvbvfbvbvbhvbhs vbhdvbhfdbvfdbvdfvfdv hbdfvbhdbhvdsvbhvbhd vrefghefgdscgdfgcsdycg dkcsqkcqhdsqhfduhdhd hqedezhdhezldhezhfehfl ezfzeflehfhezfhehfezhfl ezhflhfhfelhfehflzlhfzdj azslzdhfhfdfezhfehfizhfl qfhduhsdslchlkchudcscs cdscdscdscsddzdze Yannick LEGRÉ – DataGrid France – Lyon 19 juillet 2001 dedzedzd zedezdze cdscsdcsc dssdcsdc dscbscds bcbjbf dedzedzdzedezdzecd scsdcscdssdcsdcdscb scdsbcbjbfvbfvbvfb vbvbhvbhsvbhdvbhf dbvfdbvdfvfdvhbdfv bhdbhvdsvbhvbhdvr efghefgdscgdfgcsdy cgdkcsqkcqhdsqhfd uhdhdhqedezhdhezl dhezhfehflezfzeflehf hezfhehfezhflezhflhf hfelhfehflzlhfzdcdsc dscsddzdze dedzedzdzedezdzecd scsdcscdssdcsdcdscb scdsbcbjbfvbfvbvfb vbvbhvbhsvbhdvbhf dbvfdbvdfvfdvhbdf vbhdbhvdsvbhvbhd vrefghefgdscgdfgcs dycgdkcsqkcqhdsqh fduhdhdhqedezh dedzedzd zedezdze cdscsdcsc dssdcsdc dscbscds bcbjbf DB BLAST dedzedzdzedezdzecd scsdcscdssdcsdcdscb scdsbcbjbfvbfvbvfb vbvbhvbhsvbhdvbhf dbvfdbvdfvfdvhbdfv bhdbhvdsvbhvbhdvr efghefgdscgdfgcsdy cgdkcsqkcqhdsqhfd uhdhdhqedezhdhezl dhezhfehflezfzeflehf hezfhehfezhflezhflhf hfelhfehflzlhfzdcdsc dscsddzdze DB BLAST dedzedzdzedezdzec dscsdcscdssdcsdcds cbscdsbcbjbfvbfvb vfbvbvbhvbhsvbhd vbhfdbvfdbvdfvfd vhbdfvbhdbhvdsvb hvbhdvrefghefgdsc gdfgcsdycgdkcsqkc qhdsqhfduhdhdhq edezh DB BLAST dedzedzd zedezdze cdscsdcsc dssdcsdc dscbscds bcbjbf RESULTAT 1 dedzedzdzedezdzecdscsdcscdssdcsd cdscbscdsbcbjbfvbfvbvfbvbvbhvbh svbhdvbhfdbvfdbvdfvfdvhbdfvbhd bhvdsvbhvbhdvrefghefgdscgdfgcsd ycgdkcsqkcqhdsqhfduhdhdhqedezh dhezldhezhfehflezfzeflehfhezfhehf ezhflezhflhfhfelhfehflzlhfzdjazslzd hfhfdfezhfehfizhflqfhduhsdslchlkc hudcscscdscdscdscsddzdzeqvnvqvn q! Vqlvkndlkvnldwdfbwdfbdbd wdfbfbndblnblkdnblkdbdfbwfdbfn RESULTAT 2 dedzedzdzedezdzecdscsdcscdssdcsd cdscbscdsbcbjbfvbfvbvfbvbvbhvbh svbhdvbhfdbvfdbvdfvfdvhbdfvbhd bhvdsvbhvbhdvrefghefgdscgdfgcsd ycgdkcsqkcqhdsqhfduhdhdhqedezh dhezldhezhfehflezfzeflehfhezfhehf ezhflezhflhfhfelhfehflzlhfzdjazslzd hfhfdfezhfehfizhflqfhduhsdslchlkc hudcscscdscdscdscsddzdzeqvnvqvn q! Vqlvkndlkvnldwdfbwdfbdbd wdfbfbndblnblkdnblkdbdfbwfdbfn RESULTAT 3 dedzedzdzedezdzecdscsdcs cdssdcsdcdscbscdsbcbjbfv bfvbvfbvbvbhvbhsvbhdvb hfdbvfdbvdfvfdvhbdfvbh dbhvdsvbhvbhdvrefghefg dscgdfgcsdycgdkcs RESULTAT dedzedzdzedezdzecdscsdcscdssdcsd cdscbscdsbcbjbfvbfvbvfbvbvbhvbh svbhdvbhfdbvfdbvdfvfdvhbdfvbhd bhvdsvbhvbhdvrefghefgdscgdfgcsd ycgdkcsqkcqhdsqhfduhdhdhqedezh dhezldhezhfehflezfzeflehfhezfhehf ezhflezhflhfhfelhfehflzlhfzdjazslzd hfhfdfezhfehfizhflqfhduhsdslchlkc hudcscscdscdscdscsddzdzeqvnvqvn q! Vqlvkndlkvnldwdfbwdfbdbd wdfbfbndblnblkdnblkdbdfbwfdbfn

Multicasting Yannick LEGRÉ – DataGrid France – Lyon 19 juillet 2001