Licence B.B. Biochimie - Biologie Responsable = MN. Sylvestre

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Licence B.B. Biochimie - Biologie Responsable = MN. Sylvestre Email = mnsylves@univ-ag.fr Licence BB - 2010-2013

Finalités de la formation Objectif général Formation en Biochimie, Biologie moléculaire et Génétique, Biologie cellulaire, Chimie organique, Biomathématiques, Réglementation-assurance-qualité Orientation en cours ou en fin de cursus Master des Sciences de la vie, de la santé, de l’alimentation (recherche ou professionnel)  Master Biologie-Santé-Alimentation (pôle Guadeloupe) Formations complémentaires professionalisantes : IUP, IUFM, Ecole d’ingénieures, CAPET

Finalités de la formation Objectif Biochimie Sciences de la Santé Approfondissement en Physiologie humaine, Microbiologie générale, Biotechnologie générale Ouverture sur l’Etude des cancers et des maladies tropicales Objectif Biochimie Sciences de l’Aliment Approfondissement en Biochimie des aliments, Microbiologie alimentaire, Biotechnologie alimentaire Découverte du secteur agroalimentaire et des industries agroalimentaires Ouverture sur l’Analyse sensorielle

Points Forts Orientation très progressive Prise en charge des étudiants en difficultés et des étudiants désirant changer d’orientation Mise en place de contrôles continus Interventions de professionnels Stage en L3 : première approche de la recherche (laboratoire), de l’industrie agroalimntaire (professionnel) et la demande scientifique (bibliographique) Des étudiants impliqués dans la vie de la licence

BB -> Des Métiers Recherche / Enseignement supérieur Universités CNRS ; INSERM ; INRA ; CIRAD ; INSTITUT PASTEUR ; … Ingénieur d’études et de recherche Biologiste police scientifique Technicien biochimiste Technicien de laboratoire …

BB -> Des Métiers Professionnel / Métiers de l’agroalimentaire Consultant en analyse sensorielle Technicien de laboratoire IAA (qualité) Analyste sanitaire des aliments Chercheur-Développeur en génie alimentaire Responsable laboratoire de contrôle Technicien en génie alimentaire Technicien de laboratoire et R&D Chef d’équipe agroalimentaire Auditeur qualité ; …

LICENCES DE SCIENCES NATURELLES DU POLE GUADELOUPE 2010-2011 Faculté des Sciences Exactes et Naturelles (UFR SEN - Campus de Fouillole) LICENCES DE SCIENCES NATURELLES DU POLE GUADELOUPE 2010-2011 Biologie, Biochimie (BB) Biologie Environnement et Sciences de la Terre (BEST) S1 Tronc commun aux Lic BEST et BB S2 Tronc commun aux Lic BEST et BB L1 (1ère année) Dir. des études : J. Guerlotté S3 - BB Tronc commun Lic BB S4 - BB TC + (BSS ou BSA) (BB) Resp : P. Merciris L2 (2ème année) S3 - BEST Tronc commun Lic BEST S4 - BEST TC + (BOE - BGSTU – GEOS) (BEST) Resp : J.F. Lebrun S5-BB TC (BSS ou BSA) S6-BB TC (BSS ou BSA) (BB) Resp : MN. Sylvestre L3 (3ème année) S5 – BEST (BOE - BGSTU – GEOS) S6 – BEST (BOE - BGSTU – GEOS) (BEST) Resp : J.F. Lebrun

Responsable J. GUERLOTTE 1ère ANNEE Responsable J. GUERLOTTE

Unités d'Enseignements Enseignements Constitutifs Semestre 1 – T ronc Commun au Domaine STS (300 h) Dir. des études J. Guerlotté Unités d'Enseignements (UE) Enseignements Constitutifs (EC) ECTS Total CM TD TP Coeff UEO1.1 Culture et Pratiques scientifiques 1.1.1- Consolidation des bases mathématiques 3,5 26 3 1.1.2-Informatique : Applications usuelles simples 12 14 1.1.3-La chimie dans la vie (choix recommandé pour Lic BB) V.Jeanne-Rose 1.1.4- La Physique par les grandes découvertes 1.1.5 - Monde du vivant et ses applications (choix recommandé pour Lic BB et Lic BEST) MN.Sylvestre 20 6 1.1.6 - Vie et Paysages terrestre (choix recommandé pour Lic BB et Lic BEST) A.Rousteau 18 8 1.1.7 - Introduction à l’Economie 1.1.8 – Introduction à l’ingénierie informatique UEO1.2.1 (Sciences Exactes) UEO1.2.2 –Sciences Naturelles 1.2.2.1 - Mathématiques – Informatique des Sciences Naturelles 58 38 + 10 10 1.2.2.2- Physique – Chimie des Sciences Naturelles (C.Onésipe) 30 + 28 1.2.2.3 - Biologie – Géologie (Guerlotté) 72 24+24 12+12 UEC1 - Disciplines transversales 1.3.1-OIM-LS1 1 1,5 1.3.2-LVE-LS1 2 24 1.3.3-MET-LS1-Méthodologie Documentaire (2 EC au choix) 7 ECTS

Unités d'Enseignements Enseignements Constitutifs Semestre 2 – Tronc Commun Lic BEST et BB (300 h – 30 ECTS) Dir. des études J. Guerlotté Unités d'Enseignements (UE) Enseignements Constitutifs (EC) ECTS Total CM TD TP Coeff SVT UEO 2.1 2.1.1- Biologie cellulaire, Biochimie et Génétique (J.Guerlotté) 8 72 50 16 6 3 2.1.2- Astronomie 24 12 UEO 2.2 Sciences Exactes 2.2.1- Probabilités Statistiques 2 2.2.2- Physique / Chimie (TP = Onésipe ; Intervenant = M.Sylvestre) 4 48 18 UEP 2.3 Pluridisciplinaire 2.3.1- Histologie (O.Gros) (choix recommandé pour Lic BB et BEST) 30 1 2.3.2.1- Biologie de la santé (MN.Sylvestre) (choix recommandé pour Lic BB) 14 10 2.3.2.2- Ecologie (choix recommandé pour Lic BEST, Parcours BOE) 2.3.2.3- Tectonique des plaques (choix recommandé pour Lic BEST, (BGSTU et GEOS) UEC 2.4 Disciplines transversales LS2 2.4.1-OIM2c2i LS2 2.4.2-LVE LS2 2.4.3- Projet personnel, Techniques de laboratoire, Terrain (Lemoine ou Marcaillou?) prendre l'EC à 4 ECTS et un EC à 3 ECTS

Responsable P. MERCIRIS 2ème ANNEE Responsable P. MERCIRIS

Semestre 3 : TC COMMUN – LICENCE BB CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF BB-UEO 3.1 Outils scientifiques 3.1.1-Optique 1 15 8 7 3.1.2-Chimie organique - Statistiques 3 39 12 - 8 12 - 7 3.2 Biochimie 3.2.1-Biochimie structurale - Enzymologie 6 46 24 22 2 BB-UEP 3.3 Bioch/Physio/Anat 3.3.1-Physiologie animale 5 38 30 3.3.2-TP Biochimie, Physiologie, Anatomie 66 (34) (20) (12) 3.3.3-Anatomie Humaine 4 28 20 BB- UEC 3.4 Disciplines transversales 3.4.1-OIM3 12 LVE LS3 3.4.3-MET3 : Insertion professionnelle-Expression Scientifique

DETAIL ENSEIGNEMENT SEMESTRE 3 CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BB- UEO 3.1 Outils scientifiques (M.SYLVESTRE) 3.1.1-Optique - Analyse des phénomènes optiques - Compréhension du fonctionnement de spectre UV/Visible, fluorescent 3.1.2-Chimie organique (M.Sylvestre) 3.1.2-Statistiques - Isomérie et stéréo-isomérie - Cinétique et thermodynamique des réactions - Alcanes et substitutions radicalaires - Halogénoalcanes - Alcènes et addition électrophile - Substitution électrophile sur le noyau aromatique - Probabilités et statistiques BB-UEO 3.2 Biochimie (N. LAURENT) 3.2.1-Biochimie structurale – Enzymologie (N.Laurent) - Structure et propriétés des biomolécules - Techniques d’étude - Enzymologie (cinétique et effecteurs)

CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BB-UEP 3.3 Bioch/Physio/Anat (S.GUSTAVE DIT DUFLO) 3.3.1-Physiologie animale (P.Merciris) - Les grands systèmes de communication au sein de l’organisme : neuronale, hormonale, sensorielle 3.3.2-TP BiocPhyAnat (S.Gustave Dit Duflo) Biochimie Physiologie Anatomie - Extraction et dosage colorimétrique, Gel filtration et dosage colorimétrique des protéines, CCM, Electrophorèse sur papier, Dosage enzymatique et cinétique - Electrophysiologie du neurone, Glycémie, Illusion sensorielle - Expérimentation assistée par ordinateur, Schématisation des systèmes anatomiques, analyse d’articles et exposés sur les systèmes anatomiques 3.3.3-Anatomie humaine (MN.Sylvestre) - Introduction à l’anatomie descriptive, topographique et fonctionnelle - Anatomie des systèmes et appareils : locomoteur, circulatoire, respiratoire, digestif, nerveux, endocrinien, uro-génital masculin et féminin, organes des sens, système tégumentaire

CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BB-UEC 3.4 Disciplines transversales LS3 3.4.1-OIM3 (J.Guerlotté) - Logiciels étudiés sur données expérimentales de Biologie et de Géologie : * Excels, Power-point, Word LVE LS3 - Anglais, Espagnol 3.4.3-MET3 : Insertion professionnelle-Expression Scientifique (T.Forrissier?-IUFM) - Recevoir les principales règles de rédaction de textes scientifiques - Apprendre à synthétiser sa pensée en sciences - Apprendre à structurer ses écrits, ses discours scientifiques - Pratique de l’expression devant un auditoire de scientifiques

Semestre 4 : UE COMMUNES ENTRE BSS et BSA CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF BB-UEO 4.1 Biochimie 4.1.1-Métabolisme-Cycles métaboliques 6 54 30 24 2 BB-UEO 4.2 Biologie 4.2.1-Physiologie animale 3 20 4 4.2.2-Biologie moléculaire 28 8 66 4.2.3-Immunologie S4 22 BB-UEC 4.5 Enseigne-ment complé-mentaire 4.5.1-OIM4 (Multimédia en SVT) 1 12 LVE LS4 LS4 ECL

SEPARATION PARCOURS BSS et BSA Semestre 4 : SEPARATION PARCOURS BSS et BSA CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF UEP 4.X PARCOURS BSS BSS-UEP 4.4 SANTE 4.4.1-Physiologie de la Santé 5 48 38 10 3 4.4.2-TP.Physio.Santé 24 4.3.3-BB-TPImmuno 2 PARCOURS BSA BSA-UEP 4.3 ALIMENTATION 4.3.1-Bioch.Alim.Agro 30 18 4.3.2-TP.Bioch.Alim

DETAIL ENSEIGNEMENT SEMESTRE 4 CODE NOM EC BB-UEO 4.1 Biochimie (N. LAURENT) 4.1.1-Métabolisme (N.Laurent) 4.1.1-Cycles métabo-liques (N.Laurent) - Bioénergétique-Coenzyme - Approfondissement des voies métaboliques - Principales voies métaboliques de l’anabolisme et du catabolisme BB-UEO 4.2 Biologie (MN.SYLVESTRE) 4.2.1-Physiologie animale S4 (S.Gustave Dit Duflo) - Appareil cardiovasculaire - Physiologie de la digestion 4.2.2-Biologie moléculaire (MN.Sylvestre) - Acides nucléiques, Réplication, Transcription, Traduction, code génétique, Régulation des gènes procaryotes et eucaryotes 4.2.3-Immunologie S4 (J.Guerlotté) - Système immunitaire inné, Immunité adaptative, Antigène, Anticorps - Anticorps monoclonaux, Récepteurs - Techniques immuno-diffusion -électrophorèse

CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BB-UEC 4.5 Enseigne-ment complé-mentaire 4.5.1-OIM4 (Multimédia en SVT) (J.Guerlotté) Biophysique (dichroïsme circulaire), Imagerie médicale (IRM, radioactivité), Analyse d’images (gel, blot, microscopie fluorescence-confocal-électronique), EXAO 3 groupes = (R.H.Petit = Biophysique ; O.Gros : microscopie ; Physique ; IUFM ; Guerlotté) CC LVE LS4 - Anglais, Espagnol LS4 ECL - Choix arrêté par le CEVU chaque année

PARCOURS BSS PARCOURS BSA CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT UEP 4.X (MN. SYLVESTRE) PARCOURS BSS BSS-UEP 4.4 SANTE 4.4.1-Physiologie de la Santé (P.Merciris) - Physiologie et grandes pathologies humaines : respiratoire, cérébrale, tissu adipeux 4.4.2-TP.Physio.Santé (S.Gustave Dit Duflo) - Dissection anatomique, fréquence cardiaque, épilepsie, stress, digestion 4.3.3-BB-TPImmuno (J.Guerlotté) - Techniques d’immuno-diffusion-électrophorèse PARCOURS BSA BSA-UEP 4.3 ALIMENTA-TION 4.3.1-Bioch.Alim.Agro (MN.Sylvestre) - Classification, Propriétés fonctionnelles et utilisation en biochimie alimentaire de l’eau, des glucides, des protéines et des lipides - Filières : Lait et produits laitiers, Viande-poisson-œuf, Fruits et légumes, Matières grasses, Boissons - Propriétés, transformation, conservation des aliments 4.3.2-TP.Bioch.Alim - Méthodes de dosage des aliments et Contrôle en industries agro-alimentaires

Responsable MN. SYLVESTRE 3ème ANNEE Responsable MN. SYLVESTRE

Semestre 5 : UE COMMUNES ENTRE BSS et BSA CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF BB-UEO 5.1 Biochimie 5.1.1-Biochimie des protéines 6 48 20 28 3 5.1.2-TPBiocGen 4 40 BB-UEO 5.2 Chim/ BioMath 5.2.1-Chimie Organique 5 12 16 2 5.2.2-Biomathématiques 14 BB-UEC 5.5 Enseignement complémen-taire 5.5.1-OIM5 (Bio-Informatique) 1 LVE LS5 24 LS5 ECL

SEPARATION PARCOURS BSS et BSA Semestre 5 SEPARATION PARCOURS BSS et BSA CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF UEP 5.X PARCOURS BSS BSS-UEP 5.4 DISCIPLINAIRE 5.3.1-Génétique des populations 2 22 5.3.2-Signalisation cellulaire 5.4.3-Régulation métabolique 4 32 24 8 PARCOURS BSA BSA-UEP 5.3 5.3.3-Biochimie de la nutrition

DETAIL ENSEIGNEMENT SEMESTRE 5 CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BB-UEO 5.1 Biochimie (Th.MARIANNE-PEPIN) 5.1.1-Biochimie des protéines (Th.Marianne-Pépin) - Morphogénèse et structure des protéines - Liaisons et interactions des protéines : enzymes à 2 substrats, allostérie - Mécanisme de régulation de l’activité enzymatique 5.1.2-TPBiocGen (MN.Sylvestre) - BIOCHIMIE = Extraction et purification d’une protéine active - GENETIQUE = Techniques de biologie moléculaire BB-UEO 5.2 Chim/ BioMath (M.SYLVESTRE) 5.2.1-Chimie Organique (M.Sylvestre) - Alcools et Thiols, Amines, Dérivés carbonylés, Acides carboxyliques et dérivés, Réactivité des bio-molécules, Huiles essentielles - Préparation du cyclohexène et chlorure de tertiobuytle, Réactivité du groupement carbonyle, Oxydo-réduction, - Préparation d’un organomagnésien et réaction sur un ester 5.2.2-Biomathématiques (A.Arconte) - Outils de modélisation : ,initiation aux calculs matriciels et équations différentielles, régression simple, anova à un facteur, pratique de modélisation

CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BB-UEC 5.5 Enseigne-ment complé-mentaire (J.Guerlotté) 5.5.1-OIM5 (Outil informatique et multimédia-Bio-Informatique) - Les bases de données en Génie Génétique, NCBI, Pubmed : * banques de motifs nucléaires, GenBank, EMBL * banques de motifs protéiques, prosite * banques de régions protéiques, Swissprot - Outils de comparaison, alignement de séquences, domaines : BLAST, FASTA, EST, … LVE LS5 - Anglais, Espagnol LS5 ECL - Choix sur liste arrêtée par le CEVU chaque année

PARCOURS BSS CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BSS-UEP 5.4 DISCIPLINAIRE (P.MERCIRIS) 5.3.1-Génétique des populations (D.Monti) - Variabilité génétique dans les populations naturelles - Structure génétique d’une population idéale - Systèmes de croisement non panmictiques Variation de la fréquence des gènes dans les populations Evolution et classification phylogénétiques des végétaux 5.3.2-Signalisation cellulaire (J.Guerlotté) - Communication intercellulaire et signalisation intracellulaire - Origine des métazoaires - Molécules ‘signal’; Récepteurs ; Transducteurs ; Effecteurs ; Voies de signalisation intracellulaires ; Intégration du signal au niveau du génome Réponses cellulaires et pathologies 5.4.3-Régulation métabolique (P.Merciris) - Intégration et régulation du métabolisme

PARCOURS BSA BSA-UEP 5.3 5.3.1-Génétique des populations (D.Monti) DISCIPLINAIRE (P.MERCIRIS) 5.3.1-Génétique des populations (D.Monti) - Variabilité génétique dans les populations naturelles - Structure génétique d’une population idéale - Systèmes de croisement non panmictiques - Variation de la fréquence des gènes dans les populations - Evolution et classification phylogénétiques des végétaux 5.3.2-Signalisation cellulaire (J.Guerlotté) - Communication intercellulaire et signalisation intracellulaire - Origine des métazoaires ; Molécules ‘signal’; Récepteurs ; Transducteurs ; Effecteurs ; Voies de signalisation intracellulaires ; Intégration du signal au niveau du génome - Réponses cellulaires et pathologies 5.3.3-Biochimie de la nutrition (Th.Marianne-Pépin) - Régulation de l’utilisation et du métabolisme des nutriments : état nourri / état à jeun

Semestre 6 : UE COMMUNES ENTRE BSS et BSA CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF BB-UEO 6.1 Bioc/ BioMath 6.1.1-Biochimie moléculaire 5 60 20 3 6.1.2-Biomathématiques S6 2 30 10 BB-UEO 6.2 Biotec/Mic 6.2.1-Biotechnologie générale et/ou alimentaire 4 6.2.2-Microbiologie générale et/ou alimentaire 21 9 6.2.3-Règlementation/ Assurance/Qualité 24 BB-UEP 6.5 STAGE S6 12

SEPARATION PARCOURS BSS et BSA Semestre 6 SEPARATION PARCOURS BSS et BSA CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF UEP 6.X PARCOURS BSS BSS-UEP 6.4 SANTE 6.4.1-CancerMaladie 4 32 22 10 1 6.3.2-ImmunoGen 2 24 20 6.3.3-DévAnimal PARCOURS BSA BSA-UEP 6.3 ALIMENTA-TION 6.3.1-Analyse Senso

DETAIL ENSEIGNEMENT SEMESTRE 6 CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BB-UEO 6.1 Bioc/ BioMath (MARIANNE-PEPIN) 6.1.1-Biochimie moléculaire (Th.Marianne-Pépin) - Expression et régulation des gènes eucaryotes - Outils et méthodes utilisés en biologie moléculaire - Application de la biologie moléculaire, Bioéthique - Utilisation des enzymes de restriction, amplification des gènes, électrophorèse ADN 6.1.2-Biomathémati-ques S6 (A.Arconte) - Traitements d’enquêtes et analyses multi-variées - Utilisation de logiciels (Statistica, Sphinx) BB-UEO 6.2 Biotec/Mic (MN. SYLVESTRE) 6.2.1-Biotechnologie générale et/ou alimentaire - Biotechnologie alimentaire et générale modernes, santé et développement : exemples concrets 6.2.2-Microbiologie générale et/ou alimentaire (O.Gros) - Bactériologie générale - Initiation à la virologie - Application dans l’agroalimentaire 6.2.3-Règlementa-tion/Assurance/Qualité (MN.Sylvestre) - Qualité des produits alimentaires, - Sécurité et impact sur la santé du consommateur - Assurance qualité dans les entreprises agroalimen-taires (normes françaises et européennes - Risques et toxi-infections alimentaires

CODE NOM EC PROGRAMME SUCCINT BB-UEP 6.5 STAGE S6 (MN.SYLVESTRE) - Immersion en laboratoire (recherche) ou en industries agroalimentaires (professionnel) Ou - Simulation d’une démarche de recherche intégrant la recherche bibliographique, l’expérimentation ainsi que la rédaction d’un manuscrit sur le modèle d’une publication scientifique

PARCOURS BSS UEP 6.X CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF SANTE (J.GUERLOTTE) 6.4.1-CancerMaladie (J.Guerlotté) - Cancérogénèse ; action du système immunitaire ; Immunothérapie ; Oncogènes ; Gènes suppresseurs de tumeurs ; Immortalisation et transformation ; Thérapies ; Epidémiologies et prévention (registre du cancer) 6.3.2-ImmunoGen -IMMUNOLOGIE = Cytokines ; Migration des leucocytes et réactions inflammatoires ; Tolérance immunitaire ; réaction d’hypersensibilité ; Vaccinations ; Rôle du système immunitaire dans la santé (VIH, maladies auto-immunes, greffes) - GENETIQUE = Rappels, cartographie des chromosomes humains ; Transposons ; Rétrovirus ; Mutation ; Mécanisme (délétion, insertion, mécanisme de réparation de l’ADN) 6.3.3-DévAnimal (D.Monti) - Caractères généraux des développements embryonnaires : fécondation, segmentation, induction du mésoderme chez les triploblastiques, gastrulation, neurulation, organogénèse

PARCOURS BSA UEP16 CODE NOM EC ECTS TOTAL HEURES CM TD TP COEF ALIMENTATION (J.GUERLOTTE) 6.3.1-Analyse Senso (MN.Sylvestre) - Bases neurophysiologiques de la perception sensorielle ; - Organisation pratique de la démarche sensorielle - Epreuves sensorielles - Tests organoleptiques sur produits tropicaux et traitements statistiques de données 6.3.2-ImmunoGen (J.Guerlotté) -IMMUNOLOGIE = Cytokines ; Migration des leucocytes et réactions inflammatoires ; Tolérance immunitaire ; réaction d’hypersensibilité ; Vaccinations ; Rôle du système immunitaire dans la santé (VIH, maladies auto-immunes, greffes) - GENETIQUE = Rappels, cartographie des chromosomes humains ; Transposons ; Rétrovirus ; Mutation ; Mécanisme (délétion, insertion, mécanisme de réparation de l’ADN) 6.3.3-DévAnimal (D.Monti) - Caractères généraux des développements embryonnaires : fécondation, segmentation, induction du mésoderme chez les triploblastiques, gastrulation, neurulation, organogénèse

Disponibles ultérieurement sur site internet Modèles de fiches pédagogiques et tableaux des équivalences entre ancienne maquette BGS et nouvelle maquette BB Disponibles ultérieurement sur site internet