Virus à ARN + : stratégie de réplication Caractéristiques spécifiques polyprotéine protéase protéines non-structurales
Virus à ARN - : Organisation du génome Rage Rougeole Oreillons Virus de la stomatide vésiculaire (VSV) Ebola Marburg Nucléocapside (N, NC, NP) Enzymes structurales P,L Nucléocapside Matrice Enveloppe glycoprotéine Polymérase - Polymérase 3’ N P M G L 5’ + 5’ 3’ Transcription discontinue ARNm sous-génomiques
Virus à ARN - : stratégie de la réplication Membrane cellulaire traduction 1°) dissociation de N de ARN - 2°) transcription discontinue ARNm 3°) traduction modification post-traductionelle 4°) réplication : ARN+ réplication: ARN- Modification de la fonction de la réplicase ARN- traduction 5°) traduction (massive) morphogenèse morphogenèse
Virus à ARN - : stratégie de la réplication Caractéristiques spécifiques enzymes structurales (polymérases) transcription discontinue protéine N
Rétrovirus : Organisation du génome HIV MLV RSV Protéase Intégrase M C NC Transcriptase inverse ARNm (+) Virus à ARN - Enzymes structurales Virus à ARN + Polyprotéine & Protéase Transcription : épissage alternatif RNAm sous-génomiques Gag-Pol Vif Vpr Vpu, Env Tat Tev Rev, Nef Nef
Rétrovirus : stratégie de la réplication Membrane cellulaire 1°) rétrotranscription 7°) morphogenèse Maturation de la polyprotéine ADN (-) 6°) modification post-traductionnelle Transcriptase inverse Tat Rev Nef Env Gag-Pol Gag Protéase 5°) changement du cadre de lecture Membrane nucléaire ARNm multiépissés ARNm monoépissés ARNm non-épissés 4°) épissage alternatif 2°) intégration Intégrase ARN polymérase II 3°) transcription
Rétrovirus : stratégie de réplication Caractéristiques spécifiques enzymes structurales Transcriptase inverse Intégrase Protéase intégration dans le génome de l’hôte épissage alternatif (3 cadres de lecture) polyprotéine changement du cadre de lecture
Familles de virus à ARN humains et animaux
La virus de la grippe est un virus à ARN- avec un génome segmenté Enzymes structurales : Polymérases PA, PB1, PB2 Protéine « N » (=NP) (Neuraminidase) (Hémagglutinine)
L’acide sialique est le récepteur du virus de la grippe Tropisme viral au niveau de l’entrée HA Liaison 2’-6’ : trachée de l’homme Liaison 2’-3’ : les oiseaux Liaison 2’-3’ & 2’-6’ : cochon Membrane cellulaire Tropisme du virus de la grippe Souches humaines : préférence de hémagglutinine : 2’-6’ Souches aviaires (H5) : préférence de hémagglutinine : 2’-3’