Génétique et évolution La variabilité interespèces Outils pour la construction “à haut débit“ d’arbres phylogénétiques Réflexion sur les espèces situées.

Slides:



Advertisements
Présentations similaires
Stabilité et Variabilité des génomes et Evolution
Advertisements

Un aperçu de la bioinformatique moléculaire
Sandrine Marchand- Académie de Grenoble
Cytogénétique.
La génétique bactérienne cours 5
Cours du 5 novembre 2012 (3 séries de diapos) Pr E. Tournier-Lasserve
Variabilité nucléotidique du gène de l'acétyl coenzyme A carboxylase et Signature de sélection par un herbicide chez la plante Alopecurus myosuroides (Huds.)
Les décisions Pourquoi faut-il prendre des décisions?
Pressions de sélection des variétés résistantes sur les populations de bioagresseurs, Recherche de critères pour la sélection de variétés à résistance.
Les empreintes génomiques
Génomique des Plantes Spécificités des plantes Pourquoi les étudier
X et Y et les conséquences pour la santé
Génétique adaptative des pathogènes
CHAP III Un regard scientifique sur l'évolution de l'Homme (2s)
Eileeen Foy, Kui Li, Chunfu Wang, Rhea Sumpter Jr
Boudouma Nedjma et Hoarau Ludovic
Thème 1-A-3 De la diversification des êtres vivants à l’évolution de la biodiversité Cf TP 9.
Chapitre 4.
TP 5 Du génome au protéome
Groupe formateur SVT-David Bard Stage TS 2013 Académie de Lyon
Correction exercices thème 1 : du génotype au phénotype, applications biotechnologiques Exercice 3 page 65 1) La molécule de Mét-enképhaline est composée.
Travail de génétique STROMBONI Muriel SCLIPTEUX Virginie
Diversification du Vivant
Chapitre 4 : Un regard sur l’évolution de l’Homme
Département Génétique et Génomique Evolutives
Axe Transversal Interactions Durables (ID)
Recombination and the Nature of Bacterial Speciation
The origin and evolution of synapses
Fançois-Aymeric Brethenoux Catherine Bovens Marc-Hervé Bozet
Pattern Matcher ancel_a, creuso_a, chanio_f 1. Le jeux Une plaine qui contient de lherbe, des moutons et des loups. Un système daction en tour par tour.
Évolution: L’évidence
BILAN ÉNERGÉTIQUE NUTRIMENTS TISSU ADIPEUX TG TISSUS (Métab.cellul.)
Explaining the explosion: modelling hybrid invasions Hall et al 2006.
Coordinated by Sven Bergmann
Prédiction d’interactions protéine-protéine
Mécanique ventilatoire
L’adaptation et la variation
l'élement porteur de l'information génétique
Unité 4: La Reproduction
Guide de formation sur les ressources génétiques forestières Stratégies de conservation des espèces Leucaena salvadorensis: variation génétique et conservation.
Thème 1 LA TERRE DANS L’UNIVERS, LA VIE ET L’EVOLUTION DU VIVANT
DYSTROPHIE MUSCULAIRE DE DUCHENNE
Réunion réseau Aquisep 2014
Test -révision thèmeIA chap2-chap3
CHAPITRE 3: LA REALITE DE L’EVOLUTION
La théorie génétique de l'évolution
Pattern Matcher ancel_a, creuso_a, chanio_f 1. Sommaire  Rappel du projet  Présentation du réseau de neurone initial  Présentation de l’implémentation.
Les roches sédimentaires, archives géologiques, montrent que, depuis plus de 3 milliards d’années, des groupes d’organismes vivants sont apparus, se sont.
Familles de gènes Nadia El-Mabrouk.
Les Mutations Section 4.2.
1 Étudiants: Professeur: Salamin Nicolas Assistante: Maryam Zaheri.
Résistance aux antibiotiques
Déterminisme génétique de la sensibilité à la photopériode chez l’orge
Construction d’arbres de parenté ou arbres phylogénétiques.
Biodiversité génétique
Chapitre 4 : Un regard sur l'évolution de l'homme
L’ADN et les technologies de reproduction
L’établissement des relations phylogénétiques
Un segment peut contenir plusieurs gènes les gènes sont nombreux et/ou en interaction leurs effets sont inégaux et instables les mutations se fixent séquentiellement.
« Ecologie et dynamique des populations » Unité de Pathologie Végétale
Par: Bousso Biologie 12 M. Wilson
Évolution de second ordre dans un algorithme évolutionnaire V. Lefort
Le vivant. A partir du XIXème siècle.. Lamarck les espèces les plus complexes viennent des développements différents des espèces les plus simples. Diversification.
Evaluation Exercice 1 Choisissez LES bonnes réponses.
Thème 5.4 La cladistique Idée Essentielle: l’ascendance de groupes d’espèces peut être déduite en comparant leurs séquences de bases ou d’acides aminés.
Stabilité et Variabilité des génomes et Evolution
Chapitre I: Introduction a la Physiologie Respiratoire
La mutation.
Projet IRIS : Impact des Radiations IonisanteS sur l’évolution des bactéries E.coli LPC, UMR 6533 CNRS- IN2P3, Université Blaise Pascal Marianne Coulon,
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive CEFE - UMR 5175 Réunion CAQSIS avril 2016.
Transcription de la présentation:

Génétique et évolution La variabilité interespèces Outils pour la construction “à haut débit“ d’arbres phylogénétiques Réflexion sur les espèces situées à des carrefours évolutifs

Tumor necrosis factor family Phylogenetic tree : Orthologs identification Trends in Immunology (July 2003) Atherosclerotic plaque formation ALPS - LPR/GLD Lymphoproliferative syndrome

Détermination de la pression de sélection d’un gène Le rapport Ka/Ks –Ka represente les mutations non synonymes (asynonymous) –Ks represente les mutations synonymes –Ce rapport est communément utilisé pour déterminer le pas de temps de la sélection (“pace of protein evolution” ; Li,1997) Ka/Ks>1 positive selection Ka/Ks=1 neutral evolution Ka/Ks<1 purifying selection

Indicatif d’une évolution adaptative ? Un rapport Ka/Ks élevé suggère une évolution adaptative MAIS Peut aussi résulter d’un relachement des contraintes fonctionnelles

Rapport Ka/Ks de différents gènes

Rapport Ka/Ks inversement proportionnel au nombre de tissus où le gène s’exprime

Evolution de l’interleukin2 chez les ruminants : un rôle particulier dans le système immunitaire ?

Evolution de la taille du cerveau

Evolution du gène ASPM chez les primates

Quels outils pour SIGENAE ? Comment ? Qui ?

Génétique et évolution La variabilité interespèces Outils pour la construction “à haut débit“ d’arbres phylogénétiques Réflexion sur les espèces situées à des carrefours évolutifs

Lézard : formation de l’épididyme Salamandre : cellules souches Marsupiaux : mise en place de l’empreinte génétique

Comment mener à bien cette réflexion ?