Journées techniques ORE-PFC Système d’information NADINE HERRARD et FREDERIC MARCHAND / JUIN / 2013

.02 SOMMAIRE NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC / JUIN / 2013  Etat des lieux  Evolution vers un SI-ORE commun  Insertion dans le paysage national  Insertion dans le paysage international  Interopérabilité

Etat des lieux _ / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

.04 Etat des lieux Physico-chimie (1 base) 1285 campagnes, de 1999 à aujourd’hui. Depuis 2001, campagnes hebdomadaires et mensuelles. 22 secteurs de prélèvement sur l’Oir, 36 secteurs sur le Scorff et 13 sur la Nivelle Climat (1 base Oir et 1 base Scorff) Suivi des températures par capteurs. 868 campagnes, données journalières de 1968 à Depuis 2002 à aujourd’hui, données enregistrées toutes les heures 11 secteurs suivis sur l’ Oir et 1 secteur sur le Scorff. Turbidité (1 base) Suivi de la turbidité par capteurs. 162 campagnes, données depuis 2005 jusqu’à aujourd’hui. Enregistrement toutes les 10 minutes. 1 secteur sur l’OIR voir Scorff Hydrologie (1 base) Suivi du débit par capteurs. 78 campagnes, données journalières depuis mai 1986 (données DIREN). Depuis 2010 jusqu’à aujourd’hui, enregistrement toutes les 10 minutes. 2 secteurs suivis sur l’OIR Bases de données Access / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

.05 Etat des lieux Poissons Oir Piègeage et pêches : Données depuis 1983 Près de 8000 campagnes. Marquage pit tag depuis 1993 (environ pit) Depuis 1993 sur les juvéniles 0+ de truites du ruisseau de la de la Roche Depuis 1994 sur les juvéniles migrants de truites (sédentaires et marines) Depuis 1996 sur les adultes saumons truites et truites de mer Depuis 1999 sur les juvéniles 0+ de saumons du ruisseau de la de la Roche captures ( en piège et en pêche). 148 secteurs. Poissons Scorff Piégeage et pêches : Données depuis Marquage pit tag depuis 2007 sur les juvéniles 0+ de saumons captures (78000 en piège et en pêche). 92 secteurs. Bases de données Access / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

.06 Etat des lieux Antennes Oir Enregistreurs de Pit Tag Depuis 1996 sur le ruisseau de la Roche Environ enregistrements Bases de données Access / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

.07 Etat des lieux Collection Ecailles sachets écailles (pour Rennes) Analyse des besoins en collaboration avec U3E, CARTEL et ECOBIOP Evolution vers une base de données intégrant plusieurs types d’échantillons (écailles, otolithes, chair, etc.) Référentiel Sandre Développement d’une interface web de consultation Echéances Intégration des données : septembre 2013 Mise en production de l’interface de consultation : fin 2013 Accès sur internet ? En cours de développement : Bases de données Postgresql / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

.08 Etat des lieux GDo Gestion de tous types de documents (données, procédures,…) Possibilité d’associer les données aux protocoles, instructions,… Métadonnées (Norme Dublin Core pour GDo) Accès Internet et gestion des droits Serveur EFPA basé à l’EIC de Rennes, sauvegarde toutes les nuits Gestionnaire de documents GDo / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

Evolution vers un SI-ORE commun _ / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

.010 Evolution vers un SI-ORE commun Cellule ecoInformatique A l'initiative de la Direction Scientifique "Environnement" et des chefs de 3 départements scientifiques (EA, EFPA, SPE) Développement du noyau commun à tous les SI ORE Analyse et développement de certains SI ORE Comité d’utilisateur : personne(s) ressource dans les unités pour chaque ORE Solution web sécurisée Unité U3E, SI ORE-PFC Analyse et développement avec le soutien de la cellule Intégration des données de référence Développement des interfaces d’extraction Types de donnés : Physico-chimie, Climat-Hydrologie, Poissons / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

.011 Evolution vers un SI-ORE commun / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC Cellule ecoInformatique : développement du noyau

.012 Evolution vers un SI-ORE commun / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC U3E: développement SI-ORE-PFC : insertion des données

.013 Evolution vers un SI-ORE commun / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC U3E: développement SI-ORE-PFC : consultation des données

.014 Evolution vers un SI-ORE commun / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC U3E: développement SI-ORE-PFC : consultation des données

.015 Evolution vers un SI-ORE commun Etat d’avancement Type de données Physico-chimie Analyse (finie) Intégration de données de référence (en cours) Echéances Physico-Chimie : mise en production en 2014 Données Climat-Hydrologie Poissons Ecailles ? / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

Insertion dans le paysage national _ / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

.017 Insertion dans le paysage national / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC ONEMA, Système d’information sur l’eau STACOMI Station de contrôle des poissons migrateurs Intégration des données Oir et Scorff à partir de fichier Excel en cours Nivelle : Migradour

.018 Insertion dans le paysage national WAMA Base nationale sur pêches électriques Renseignée par les Fédérations, ONEMA, INRA et des bureaux d’études mandatés (WAMA 3, en cours de développement) Scorff : quelques données renseignées par BGM Oir : description des stations pêches renseignées mais pas les opérations GEO Mig Base nationale de répartition des migrateurs sur les cours d’eau En cours, cahier des charges rédigé, développement à venir (DSI ONEMA et Omar Diouach) GEO IF Base nationale sur la géolocalisation des inventaires frayères potentielles et observées, toutes espèces En projet, rapprochement avec GEO Mig / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC ONEMA, Système d’information sur l’eau

.019 Insertion dans le paysage national Plateforme de coordination nationale sur la biodiversité Renforcer la visibilité des dispositifs et l’accès aux données Mettre en cohérence les dispositifs et favoriser leur déploiement Promouvoir les synergies scientifiques entre les observatoires Développement d’une E_infrastructure Un portail national Une base de métadonnées Implication ORE-PFC Renseigner la base de métadonnées Alimentation de L'observatoire national de la biodiversité (ONB) Qui alimentera UE BON puis GEO BON Participation française à l’infrastructure Européenne LifeWatch / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC ECOSCOPE

Insertion dans le paysage international _ / JUIN / 2013

.021 Insertion dans le paysage international Le Conseil International pour l'Exploration de la Mer (CIEM) Rivières index avec la Bresle sur SAT. Nivelle anguille ? Données intégrées au niveau de l’atlantique Nord pour déterminer les procédures de gestion des stocks. EU BON ? The European Biodiversity Observation Network GEO BON ? The Group on Earth OpservationsBiodiversity Observation Network / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC

Interopérabilité _ / JUIN / 2013

.023 Données : Interopérabilité Définition « Trouver des moyens efficaces pour découvrir, accéder, intégrer, conserver et analyser d’importants volumes de données » Problèmes Seule une petite fraction des données collectées en écologie est facile à découvrir et accessible (moins de 1% des données écologiques est accessible après publication et résultats associés) Pas d’accès direct aux données: interprétations des données à travers des présentations et des publications / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC Source : Réseau Bases de Données, Eric Garnier, Marie-Claude Quidoz, Baptiste Laporte, CNRS, FRB

.024 Données : Interopérabilité Obstacles Techniques Dispersion des données: petits jeux de données et sujets abordés très différents Hétérogénéité syntaxique et sémantique des données Provenance des données: traçabilité, assurance qualité de collecte à la publication Sociologiques Peu d’incitation au partage Peu de protection contre les prédateurs Manque de reconnaissance pour la collecte des données Conditions Adoption de standards communs: métadonnées, vocabulaires contrôlés et ontologies Améliorer la protection de la propriété intellectuelle (charte) / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC Source : Réseau Bases de Données, Eric Garnier, Marie-Claude Quidoz, Baptiste Laporte, CNRS, FRB

.025 Données : Interopérabilité, accès et qualité Pistes de travail Sémantique, référentiels, dictionnaire de données, quels standards ? Darwing Core, ISO 19115, INSPIRE Accès aux données Confidentialités, droits, charte, etc. Qualification des données Politique de qualité, référentiel, documentation, métrologie … / JUIN / 2013 NADINE HERRARD, FREDERIC MARCHAND / SYSTÈME D’INFORMATION ORE-PFC