Étude des CHAMPIGNONS (Syn. MYCETES, FUNGI)

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1 Étude des CHAMPIGNONS (Syn. MYCETES, FUNGI)
MYCOLOGIE Étude des CHAMPIGNONS (Syn. MYCETES, FUNGI) YLF Photo Nexstar

2 Définitions Règne à part, celui des FUNGI Microorganismes
Munis d'une PAROI comme les bactéries et les végétaux Noyau de type EUCARYOTE à la différence des bactéries (procaryotes) Sans pigment assimilateur CHLOROPHYLLIEN à la différence des végétaux YLF

3 Organisation générale
Constitués Soit réseau de filaments (MYCELIUM) Soit sous forme dissociée faite d'éléments unicellulaires bourgeonnants (LEVURES) Reproduction par formation de SPORES Très utiles pour identifier les champignons YLF

4 Illustration levures, filaments, spores
LEVURES bourgeonnantes Photo CHU Rennes FILAMENTS mycéliens (hyphes) Photo M. Gari-Toussaint SPORES et filaments Illustration levures, filaments, spores YLF

5 La Cellule Fongique d'Eucaryote Polyosidique dont b glucanes
Colorable par PAS et Grocott Cible des Echinocandines Avec Ergostérol, Cible d'antifongiques AmphoB, Triazolés YLF

6 Culture Le milieu usuel est celui de SABOURAUD Colonies de
Ch.filamenteux Colonies de levures YLF

7 C. (Torulopsis) glabrata
CANDIDA et CANDIDOSES Candida albicans C. tropicalis C. parapsilosis C. krusei … C. (Torulopsis) glabrata YLF

8 Morphologie En culture Dans les lésions Milieu de Sabouraud: levures
Repiquage sur milieu R.A.T. ou P.C.B.: C. albicans: levures + pseudomycélium + chlamydospores Autres espèces: levures + pseudomycélium sauf C.g Dans les lésions Association levures + pseudofilaments C. (Torulopsis) glabrata: levures seulement YLF

9 Morphologie 2 Colonies de C. albicans Levures de C. albicans
sur milieu de Sabouraud Photo V. Lavarde Levures de C. albicans MEB Photo F. Odds YLF

10 Chlamydospores de C. albicans
Morphologie 3 Chlamydospores de C. albicans sur milieu R.A.T. Pseudomycelium de C.sp. Sur milieu R.A.T. Photo Pfizer YLF

11 Habitat naturel C. albicans hôte NORMAL du tube DIGESTIF Les autres:
Tous commensaux ou saprophytes C. albicans hôte NORMAL du tube DIGESTIF Les autres: tube digestif peau, mil. extérieur YLF

12 Conditions de pathogénicité
Facteurs iatrogéniques: Antibiotiques, corticoïdes, cytostatiques, immunodépresseurs, greffes, chirurgie digestive, réa. lourde, psychotropes, pilule… Facteurs d'irritation locale: Humidité, transpiration, obésité, brûlures, dentiers, cathéters… OPPORTUNISME États physiologiques: Ages extrêmes, grossesse États pathologiques: Diabète, cancer, SIDA, Immunodépression* * Déficit lymphocytaire: candidoses digestives +++ Granulopénie: candidoses systémiques +++ YLF

13 Candidoses cutanées: Plis
Photo D. Grigoriu Photo D. Grigoriu Photo M. Miégeville YLF

14 Candidoses Digestives
Photo D. Grigoriu Photo M. Feuilhade C. Lacroix Photo D. Grigoriu YLF

15 Candidoses Génitales YLF Photo D. Grigoriu Photo M. Deniau

16 Candidoses systémiques: Dissémination hématogène aux viscères
Porte d'entrée Foyer digestif Cathéter colonisé Tableau septicémique atypique Fièvre résistante aux antibactériens Localisations secondaires à rechercher: Reins et urines Peau Œil Candidose hépato-splénique … YLF

17 Candidoses systémiques: localisations secondaires
YLF Photo CHU Angers

18 Diagnostic des candidoses cutanéo-muqueuses
Prélèvements (par le biologiste) Grattage de lésions sèches, écouvillonnage de lésions humides, débris d'ongle, selles etc.. Examen direct Levures + pseudofilaments Appréciation semi-quantitative Culture Colonies en 48h sur Sabouraud Dénombrement U.F.C. Identification Antifongigramme YLF

19 Faisceau diagnostique des candidoses systémiques
Dur..Dur Surveillance mycologique Surveillance de la colonisation digestive et des urines. Hémocultures (positivité tardive et inconstante), biopsies des localisations secondaires accessibles (examen ana-path. ET mycologique) Surveillance sérologique (décevante) Cinétique des anticorps (ascension ou chute brutale) Recherche d'antigènes solubles Traitement présomptif Chez le malade à risque si fièvre résistante aux antibactériens plus de 48 – 72 H Pour demain: PCR ? YLF

20 Traitement des candidoses
Antifongiques topiques ou systémiques selon la forme clinique Cf."Antifongiques" Dans les candidoses systémiques le traitement doit être le plus précoce possible YLF

21 Cryptococcus et CRYPTOCOCCOSE
Cryptococcus neoformans (3 variétés: neoformans, gattii, grubii) Les autres espèces non pathogénes YLF

22 Morphologie En culture Dans les lésions
Milieu de Sabouraud: colonies muqueuses beiges, levures rondes. Milieu R.A.T. ou P.C.B.: levures seulement Dans les lésions Levures ENCAPSULEES YLF

23 Morphologie 2 Colonies de C. neoformans Levure de C. neoformans:
sur milieu de Sabouraud Levure de C. neoformans: Capsule (encre de Chine) YLF

24 Habitat naturel Eucalyptus Déjections de
Saprophytes dans le milieu extérieur Eucalyptus Déjections de Variété neoformans Variété gattii YLF

25 Conditions de pathogénicité
OPPORTUNISME Inhalation de poussières contaminées Primo-infection pulmonaire infraclinique Immunodépression: Hémopathies Corticoïdes SIDA +++ Dissémination hématogène Localisation Neuroméningée +++ YLF

26 Aspects cliniques de la cryptococcose
Les manifestations pulmonaires primitives passent inaperçues La méningite est l'expression la plus fréquente Tableau subaigu ou chronique dégradé trompeur PL = clé du diagnostic Liquide clair, 20 à 1OO éléments (lymphocytes), albuminorachie , glycorachie , levures encapsulées Autres localisations plus inhabituelles (sauf dans le cadre du SIDA où la mycose est souvent généralisée): Peau, encéphale, poumon, os, prostate, septicémie… YLF

27 Cryptococcose cutanée
YLF

28 Diagnostic biologique des cryptococcoses
Prélèvements LCR, LBA, hémocultures, urines, biopsies Examen direct: Encre de Chine Levures encapsulées Culture Colonies en 48-72h sur Sabouraud (sans actidione) Identification, Antifongigramme Sérologie: antigène capsulaire soluble Test au latex sur sérum ou LCR YLF

29 Traitement des cryptococcoses
Antifongiques systémiques Cf. cours "Antifongiques" YLF

30 Autres levuroses rares
En cas d'immunodépression sévère d'autres genres peuvent être impliqués: Trichosporon et Geotrichum, Saccharomyces, Rhodotorula… Malassezia est un commensal, potentiellement pathogène au niveau de la peau (cf. cours suivant), il est exceptionnellement responsable de septicémie dans le cadre d'hyperalimentation lipidique parentérale YLF