Imagerie de diffusion Bases physiques et acquisition Stéphane Lehéricy Cours IHU – WP6 Paris, mai 2013 ICM / Centre de NeuroImagerie de Recherche – CENIR.

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1 Imagerie de diffusion Bases physiques et acquisition Stéphane Lehéricy Cours IHU – WP6 Paris, mai 2013 ICM / Centre de NeuroImagerie de Recherche – CENIR Université Pierre et Marie Curie – Paris 6 Hôpital Pitié-Salpêtrière

2 Aujourd’hui S Lehericy Bases physiques, acquisition/prétraitements L Marrakchi-Kacem Modèles de diffusion et mesures dérivées 21 mai (salle 1/2) Michel Thiebaut de Schotten Tractographie : notions de base, méthodes logiciels Pièges astuces et analyses de groupes Plan des cours de diffusion

3 Plan Principes de base L’origine de l’anisotropie Les artefacts en diffusion Votre séquence : quels paramètres ?

4 Diffusion Diffusion = mouvements aléatoires (browniens) des molécules qui résultent de l’énergie thermique portée par ces molécules. Obéit à une loi statistique établie par Einstein en 1905 Sur une dimension = 2DT d = variance du déplacement moléculaire D= coefficient de diffusion T d = temps de diffusion Déplacement moléculaire Temps 1/2 T d 1/2 A la température du cerveau ADC libre = 3 x 10 -9 m² / s

5 Diffusion et IRM Déplacement moléculaire Temps 1/2 T d 1/2 Dans l’eau libre  En 50 à 100 ms, les molécules d’eau ont bougé dans une sphère de 1-15 µm 15 µm 100 ms Le temps d’acquisition d’une image echo planar ~ 50-100 ms Taille du voxel en diffusion ~2 mm (2000µm)  diffusion = mouvement intravoxel En IRM : mesure de la diffusion de l’eau (H 2 O) libre Décrite par Denis Le Bihan en 1986

6 Dans les tissus biologiques, la diffusion est restreinte on parle de coefficient de diffusion apparent (ADC = Apparent Diffusion Coefficient) La diffusion est restreinte espace clos obstacles au déplacement extra-cellulaire membranes Le Bihan et al. Nature Reviews Neuroscience 2003 Diffusion et IRM

7 01000 Log signal b b=1000 s/mm 2 (DWI) b=0 s/mm 2 (T2) Application d’un gradient de champ magnétique (gradient de diffusion) Protons immobiles : le signal IRM n’est pas modifié par le gradient Protons qui diffusent : il existe une baisse du signal Diffusion et IRM: Comment procède-t-on ?

8 GG    G = amplitude du gradient de diffusion  = durée d’application du gradient  = délai entre les deux gradients de diffusion  = rapport gyromagnétique (42,6 MHz / T) Equation de Stejskal-Tanner b=  2 G 2  2 (  -  /3) b s’exprime en s/mm² souvent 1000 => 10.000 La séquence de diffusion t = 0t = TE/2t = TE 180° 90° Echo Spin écho

9 Si spin immobile :déphasage = rephasage Pas d’atténuation du signal avec le gradient de diffusion t = TE/2 180° t = 0 90° t = TE Echo Cas d’un spin immobile (pas de diffusion)

10 t = TE/2 180° t = 0 90° t = TE Echo Cas d’un spin mobile (= diffusion) Si spin diffuse :mauvais rephasage Atténuation du signal (SA)

11 Imagerie pondérée en diffusion DWI (Diffusion weighted imaging) : imagerie pondérée en diffusion Acquisition de 3 images avec des gradients de diffusion en X, Y et Z

12 Image pondérée en diffusion Gradients de diffusion dans les 3 directions de l’espace X, Y et Z Moyenne des images de diffusion => image pondérée en diffusion Donne des informations sur l’importance de la diffusion Noir : diffusion forte, blanc : diffusion faible ZXY Moyenne = Image pondérée en diffusion

13 La cartographie ADC (coefficient de diffusion apparent) Ln Signal b SB contro AVC Atténuation du signal (SA) SA = exp [-b.ADC] SA = exp [-  2 G 2  2 (  -  /3)ADC] 01000 s/mm 2 Atténuation du signal (SA) SA = exp [-b.ADC] SA = exp [-  2 G 2  2 (  -  /3)ADC] ADC en mm²/s

14 Les images de la séquence de diffusion b=1000 s/mm 2 b=0 s/mm 2 (T2) ADC SA = e -b.ADC

15 La baisse de signal dépend de l’orientation du gradient de diffusion ZXY Anisotropie de la diffusion

16 Diffusion orientée dans la substance blanche : anisotropie courtesy Alberto Bizzi

17 Diffusion et anisotropie Variations de signal selon la direction du gradient de diffusion Diffusion ISOTROPEDiffusion ANISOTROPE (dépendante de la direction) ZXY

18 L’étude de l’anisotropie : le tenseur de diffusion

19 ≥ 6 directions x z y Mesurer l’orientation : le tenseur de diffusion Dxx DxyDxz DyyDyz Dzz Dyx DzxDzy Tenseur = objet mathématique qui s’exprime dans un espace vectoriel

20 Diagonalisation du tenseur de diffusion x z y e1e1 e2e2 1 2 e3e3 3 x’ y’ z’ D x’x’ D y’y’ D z’z’ D = SA  e(- bx’x’.Dx’x’ –by’y’.Dy’y’ –bz’z’.Dz’z’)

21 Mesurer l’orientation : le tenseur de diffusion e1e1 e2e2 1 2 e3e3 3 = valeur propre (eigenvalue) 1 = diffusivité longitudinale, axiale, parallèle 2/3 = diffusivité transversale, radiale, perpendiculaire e = vecteur propre (eigenvector)

22 Trace(D) = Dxx + Dyy + Dzz Diffusivité moyenne = (Dxx + Dyy + Dzz) / 3 FA Les variables de diffusion

23 L’origine de l’anisotropie

24 A quoi est due l’anisotropie ? La substance blanche est anisotrope (Beaulieu et al. NMR Biomed 2002). - Neurofilaments et microtubules - Membrane axonale - Myéline - Transport axonal - Différence de susceptibilité dans le nerf et la substance blanche

25 Anisotropie et myéline Beaulieu et al. NMR Biomed 2002 Nerf non myélinisé Nerf myélinisé oligodendrocytes La myéline ne serait pas le composant essentiel de l’anisotropie de la diffusion dans les fibres nerveuses Signal e1e1 e2e2 1 2 e3e3 3

26 Anisotropie, microtubules et transport axonal rapide Beaulieu et al. NMR Biomed 2002 Le rôle des microtubules et du transport axonal rapide a été évalué sur des nerfs excisés myélinisés ou non d’un poisson (garfish = orphie) traité avec de la vinblastine. La vinblastine dépolymérise les microtubules et inhibe transport axonal rapide. L’anisotropie est préservée => les microtubules et le transport axonal rapide ne sont pas les facteurs les plus déterminants de l’anisotropie. Les nerfs traités à la vinblastine montraient une baisse de l’ADC de 30–50% dans les directions parallèles et perpendiculaires. Les travaux soulignent en revanche le rôle de la membrane cellulaire.

27 Les artefacts en diffusion

28 Artefacts liés à l’acquisition EPI Artefacts liés aux gradients de diffusion Artefacts liés aux mouvements Artefacts liés à l’IRM (spike)

29 Les artefacts liés à l’acquisition EPI Artefacts spécifiques de l’acquisition EPI : le ghosting en “N/2” Mauvais réglage de la séquence EPI Liés à technique d’acquisition des données Plan de Fourier x y phase

30 Les artefacts liés à l’acquisition EPI Les distorsions liées aux effets de susceptibilité magnétique Dans l’axe de l’encodage de phase => Axial : antéro-post Coronal : supéro-inf Déphasage des protons proches des régions où le champ n’est pas homogène (sinus, rocher) - Temporal - Orbitofrontal - Tronc

31 Les artefacts liés à l’acquisition EPI Correction des distorsions liées aux effets de susceptibilité magnétique sans iPAT avec iPAT Mais … baisse du rapport signal sur bruit de V facteur d’accélération Utilisation de l’imagerie parallèle Séquences particulières : Propeller, Resolve Meilleurs gradients => Prisma (80 mT/m au lieu de 40 mT/m Trio)

32 Les artefacts liés à l’acquisition EPI Correction des distorsions avec des cartes de champs Correction à l’aide de cartes de champ Jezzard, Balaban MRM 1995 Carte de champ (Field map) : image de l’intensité du champ magnétique dans l’espace Séquence GE double écho

33 Les artefacts liés à l’acquisition EPI Correction des distorsions par acquisition de deux images avec des gradients de phase Y inversés Reconstruction d’une image non distordue Morgan et al. JMRI 2004

34 Les artefacts liés aux gradients de diffusion Les distorsions liées aux courants de Foucault Ne touche que les images pondérées en diffusion pas la b0 Correction - Post-processing (Poupon et al. NI 2000) - Amélioration des gradients de l’IRM (preemphasis) G diff

35 Les artefacts liés aux mouvements Correction de mouvement des images de diffusion avant le calcul des cartes de FA et ADC Correction à l’acquisition : écho navigateur

36 Les artefacts liés l’IRM Spikes : étincelles électriques (ampoule cassée dans la salle IRM, faux contacts, électricité statique…) Correction : 1) réparer l’IRM ! 2) éliminer ou recalculer les images artefactées, 3) rescanner

37 Corriger les images artefactées 1)Éliminer les images artefactées 2)Recalculer les images artefactées Interpolation des données manquantes avec les données voisines Sharman et al. JMRI 2012

38 Les artefacts : conclusion Regardez vos images natives Détectez les acquisitions artefactées Faites tourner les routines de détection et correction (Restore, Romain®…) Évaluez l’intérêt de la correction ou du rescan

39 Votre séquence de DTI : quels paramètres ?

40 Les paramètres de la séquence de tenseur de diffusion Champ de vue : - Couvrir tout le cerveau Taille des voxels : - Préférer les voxels isotropes (cubiques) - Utiliser une taille de voxel inférieure ou égale à 3 x 3 x 3 mm 3 Acquérir plusieurs images b0 : - Au mieux une image b0 toute les 8 images de diffusion (Jones DK et al. MRM 1999) 8 images b1000 1 image b0 Smith S et al. Nature Protocol 2007

41 Gating ? Le gating cardiaque Avantage : - Réduit les artefacts liés aux pulsations cardiaques (tronc, cervelet, régions proches du LCS - Réduit la distorsion des images - Améliore le calcul des paramètres de diffusion Inconvénients : - Allongement de la séquence

42 Quelle valeur de b ? Pour évaluer l’anisotropie et faire de la tractographie b > 1000 s/mm² Le plus souvent, une valeur de 1000 s/mm² est utilisée pour le tenseur de diffusion Quand utiliser une valeur > 1000 s/mm² ? b = 2-3000 s/mm² est utilisé dans l’imagerie HARDI Inconvénient : faible rapport signal / bruit : 3T > 1.5T Importance des gradients de l’IRM +++

43 Combien de directions ? Augmenter le nombre de directions permet de réduire l’erreur de mesure sur le calcul des variables de diffusion - Direction principale de la diffusion - Diffusivité moyenne - FA Jones DK et al. MRM 2004 Calcul de la FA Nombre de directions Diffusivité moyenne > 30 directions FA > 20 directions 6 10 14 18 22 26 30 34 38 42 46 50 54 58 FA=0.9 FA=0.8 FA=0.7 FA=0.6 FA=0.5 FA=0.4 Direction principale de la diffusion / diffusivité

44 Combien de directions ? Mieux vaut 36 directions avec 1 répétition que 12 directions avec 3 répétitions pour un même temps d’acquisition Ne pas moyenner les répétitions sur la console (ne permet pas une correction du mouvement) Quel intérêt à augmenter le nombre de directions (≥ 60) ?  Imagerie HARDI High angular resolution diffusion imaging Permet de visualiser les croisements de fibres au sein d’un voxel

45 Fin