PPD-Orsay-08/2014 Structure des populations et influence de l’aquaculture sur un bivalve exploité, la coquille Saint-Jacques (Pecten maximus) R. Morvezen,

Présentation au sujet: "PPD-Orsay-08/2014 Structure des populations et influence de l’aquaculture sur un bivalve exploité, la coquille Saint-Jacques (Pecten maximus) R. Morvezen,"— Transcription de la présentation:

1 PPD-Orsay-08/2014 Structure des populations et influence de l’aquaculture sur un bivalve exploité, la coquille Saint-Jacques (Pecten maximus) R. Morvezen, G. Charrier, P. Boudry, L. Chauvaud, F. Breton, Ø. Strand, J. Laroche © Daniel Vaulot

2 Introduction La coquille Saint-Jacques, Pecten maximus
Caractéristiques principales -Mollusque bivalve -Benthique -Phase larvaire pélagique Larve de Pecten maximus Source : reproseed.eu Pecten maximus © Andy Pearson

3 Introduction La coquille Saint-Jacques, Pecten maximus
Caractéristiques principales -Mollusque bivalve -Benthique -Phase larvaire pélagique -Intérêt économique (60 000T pêchées en 2009) ->Repeuplement en Rade de Brest (sea-ranching) Source : écloserie du Tinduff Pecten maximus © Andy Pearson

4 Introduction Distribution de Pecten maximus Espèce (?) proche
Pecten jacobaeus Source : FAO

5 Introduction Etat de l’art en génétique des populations de P. maximus
Technique Reference Allozymes Beaumont & Beveridge 1984 Beaumont et al., 1993 Mitochondrial DNA Wilding et al., 1997 Heipel et al., 1999 Ridgway & Dahle, 2000 Patry, 2005 RAPDs Heipel et al., 1998 Microsatellites Watts et al., 2005 Charrier et al. 2012 Hold et al. 2012 Hold et al. 2012, PhD (unpublished) Morvezen et al. 2013

6 Introduction Etat de l’art en génétique des populations de P. maximus
Technique Reference Allozymes Beaumont & Beveridge 1984 Beaumont et al., 1993 Mitochondrial DNA Wilding et al., 1997 Heipel et al., 1999 Ridgway & Dahle, 2000 Patry, 2005 RAPDs Heipel et al., 1998 Microsatellites Watts et al., 2005 Charrier et al. 2012 Hold et al. 2012 Hold et al. 2012, PhD (unpublished) Morvezen et al. 2013

7 Introduction ADN mitochondrial Wilding et al. 1997 PCR-RFLP
Φst = Pas de différence significative entre les populations

8 Introduction ADN mitochondrial
Etude complétée par Ridgway & Dahle, (2000) : 2 Populations Norvégiennes : différence significative avec les données de Wilding et al.

9 Introduction Thèse de Nathalie Hold 12 Microsatellites tirés d’EST
Fst = (95% CI – 0.015) Différenciation de la population Norvégienne et de la Méditerranée

10 Introduction Thèse de Nathalie Hold 12 Microsatellites tirés d’EST
Fst = (95% CI – 0.015) Différenciation de la population Norvégienne et de la Méditerranée

11 Introduction Biologie des populations : Chauvaud et al. 2012 Plos ONE
Existence de deux stratégies de croissance

12 Introduction Biologie des populations : Chauvaud et al. 2012 Plos ONE
Existence de deux stratégies de croissance Discontinuité le long de l’aire de répartition

13 Echantillonnage Echantillonnage
IRL 15 populations, Effectif : 24 < N < 48

14 Diversité allélique Latitude Baisse de diversité avec la latitude

15 Structure des populations
Fst = 0.029*** MDS sur Fst linéarisé

16 Structure des populations
Atlantique Norvège Méditerranée Fst = 0.029*** MDS sur Fst linéarisé

17 Structure des populations
Echantillonnage - Barrière au flux de gènes en mer du Nord (fosse Norvégienne ?) IRL

18 Structure des populations
Echantillonnage - Barrière au flux de gènes en mer du Nord (fosse Norvégienne ?) -Isolement par la distance significatif en Norvège : trace de la colonisation + effet de la courantologie ? IRL

19 Structure des populations
Echantillonnage - Barrière au flux de gènes en mer du Nord (fosse Norvégienne ?) -Isolement par la distance significatif en Norvège : trace de la colonisation + effet de la courantologie ? -Un ou deux refuges glaciaires ? IRL

20 Structure des populations
Echantillonnage - Barrière au flux de gènes en mer du Nord (fosse Norvégienne ?) -Isolement par la distance significatif en Norvège : trace de la colonisation + effet de la courantologie ? -Un ou deux refuges glaciaires ? -Migration pas à pas entre les populations du groupe Atlantique ? IRL

21 Génétique vs phénotypes
Chauvaud et al Plos ONE IRL Bonne correspondance globale entre la génétique et les phénotypes Situation autour des îles britanniques à confirmer (Hold et al. 2012)

22 Influence du repeuplement
L’aquaculture de Pecten maximus Source : CLPMEM Débarquements de Coquille Saint-Jacques en rade de Brest 2/3 de la production de la rade est issue de l'écloserie (données 2007)

23 Influence du repeuplement
Nombre de juvéniles de P. maximus semés en Rade de Brest par an Source : écloserie du Tinduff Rade de Brest : seul site considéré comme pouvant être impacté par des activités aquacoles. (Beaumont & Gjedrem, 2006)

24 Influence du repeuplement
Latitude Pas de perte de diversité détectée en Rade de Brest -Bonnes pratiques d’écloserie ? -Flux de gènes ? -Faible contribution des semis à la reproduction par rapport à la population naturelle ? 24

25 Pecten jacobaeus -Diversité comparable aux populations
atlantiques de P. maximus -Pas de problème de transfert des marqueurs entre espèces Différenciation marquée mais du même ordre de grandeur que la différenciation des deux groupes de population de P. maximus Résultat conforme à la littérature : Wilding et al. 1999, Saavedra & Peña 2005, Hold et al. 2012,

26 Conclusions Structure des populations de P. maximus
-Confirmation de l’existence de deux groupes génétiques de populations Influence de l’aquaculture en rade de Brest -Pas d’impact détecté, mais étude plus approfondie nécessaire Pecten jacobaeus -Confortation de la non séparation en deux espèces

27 Merci de votre attention
© Daniel Vaulot Photo : Keith Hiscock,

28 Annexe Perspectives Perspectives Double anneau
Issue de la reproduction dans le milieu naturel Issue de la reproduction en écloserie

29 Annexe Perspectives Perspectives Perspectives Perspectives
Double anneau Issue de la reproduction dans le milieu naturel Issue de la reproduction en écloserie Partiellement confirmé par des méthodes génétiques

30 Annexe Ecloserie du Tinduff : géniteurs utilisés en 2007 (n = 49)
Carte : © Google maps Ecloserie du Tinduff : géniteurs utilisés en 2007 (n = 49) Roscanvel : Population naturelle (n = 94) Le Fret : Production de l’écloserie (n = 55) L’Auberlac’h : Production de l’écloserie (n = 88) 30

31 Annexe Frères Individus 31

32 Annexe Croissance journalière 32

33 Annexe Croissance journalière : Plymouth Chauvaud et al. 2012 Plos ONE
33

34 Annexe Chauvaud et al Plos ONE 34

35 Annexe Chauvaud et al Plos ONE 35