Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Le Réseau Tela Botanica, ses principes Un réseau coopératif… où la libre contribution de chacun profite à

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1 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Le Réseau Tela Botanica, ses principes Un réseau coopératif… où la libre contribution de chacun profite à tous La langue française et la botanique comme dénominateur commun Internet, un outil de communication et déchange privilégié… au service des personnes, des associations et des institutions Réseau Tela Botanica Présentation : Jean-Pascal Milcent

2 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Constat Les membres du réseau Tela Botanica possédant des données botaniques : Ils veulent les mettre en commun Ils souhaitent en faire profiter les autres Ils nont pas doutils collectifs pour les gérer

3 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Problématique à résoudre Comment collecter et interconnecter les données botaniques des membres du réseau Tela Botanica ? Comment faciliter la consultation et la gestion de ces données via le Web ?

4 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Solution : le projet eFlore Une base de données unique Une interface de consultation en libre accès pour permettre à tous daccéder à linformation via Internet Des outils pour collecter linformation en retour provenant du réseau D es possibilités dexportation en masse des données Une interface dadministration pour gérer linterconnexion des données Des logiciels « libres » pour travailler en commun

5 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Le projet eFlore, ses outils : Un forum de discussion propre au projet et des forums thématiques (nomenclature, noms vernaculaires…) Des outils pour le travail collaboratif via le Web : outils de gestion de projets espace pour déposer et télécharger des fichiers éditeur collaboratif en ligne (Wikini) Projet eFlore

6 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Types de données intégrées dans eFlore Données nomenclaturales Données taxinomiques (plusieurs projets) Données sur les auteurs (commun avec base herbiers) Noms vernaculaires (7 langues) Chorologie départementale Photos et illustrations Description des taxons et clés de détermination

7 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Couverture géographique du projet La flore métropolitaine (Kerguélen, Bock…) Ile de la Réunion (CBN Mascarin) Guyane (IRD) Antilles (Jacques Fournet) Autres ? Couverture systématique : Embryophytes Bryophytes Lichens ?

8 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Modèle eFlore Les bases du modèle deFlore : Euro+Med Modèles de Berendsohn (Muséum de Berlin) Les standards respectés par eFlore : Code International de Nomenclature Botanique TDWG (pour chorologie, zones géo) ISO (pour langues, pays) INSEE (pour communes, départements, régions)

9 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Modèle eFlore Les solutions techniques deFlore : Conception du modèle : Dia et TeDia2SQL Base de données : MySQL ou PostgreSQL Intégration des données : Perl Interface de consultation : - en php, html et css (le minimum de Javascript) - abstraction des bases de données (PEAR) - export des données (Text, XML…) Interface dadministration : 1er solution : idem interface consultation 2eme solution : XUL (XML)

10 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Modèle eFlore Le cœur du modèle : - Gestion des relations entre les noms des taxons : référentiel nomenclatural - Gestion des relations entre taxons relatifs à un projet : référentiels taxonomiques - Attribution des noms et de leurs statuts aux taxons relatifs à un projet Un référentiel nomenclatural, mais des référentiels taxonomiques…

11 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Modèle eFlore Aperçu des relations entre modules du modèle NomenclaturePublications Sélection des noms Taxons relatifs Projets Botanistes Relations entre noms Relations entre taxons PersonnesDroits Chorologie Zones géo Protections Noms vernaculairesLangues cœur Textes et images

12 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore État davancement du projet 1 : Définir les objectifs et besoins 2 : Analyser et référencer lexistant 3 : Réaliser le modèle et sa documentation 4 : Intégrer les données 5 : Développer une interface de consultation 6 : Développer une interface de gestion

13 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Autres bases Tela Botanica Base sur les herbiers de France : métadonnées, dans le cadre du projet BioCASE (MNHN) Base bibliographique : Articles des revues botaniques (22 000 références) Livres et médias (avec la Garance Voyageuse) Fichier dadresses : organismes, associations, etc.

14 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Pour participez au projet eFlore, les liens utiles Documentation en ligne : http://wiki.tela-botanica.org/eflore Fichiers : http://www.tela-botanica.org/projets puis «Flore électronique» Forum : http://fr.groups.yahoo.com/group/tb-eflore

15 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Organisation Coordinateurs du projet nomenclature Membres du projet eFlore Coordinateurs du projet phytosociologie Aide à la mise en base de données Administration de la base Développement des interfaces Données nomenclaturalesDonnées phytosociologiques Utilisateurs Consultent et proposent des améliorations Coordinateurs du projet X … Autres projets… Coordinateurs du projet eFlore Assurent le suivi et la cohérence

16 Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Projet eFlore Qualification des données Référentiel nomenclatural Données objectives extraites de la littérature Validation par lusage grâce aux retours des utilisateurs Référentiels taxinomiques Pas de validation globale a priori : trop lourd, aspects subjectifs Validations ponctuelles de certaines familles par des spécialistes Qualification dans le cadre de projets : REFTAX (MNHN), « flore de France », etc. Autres référentiels Validation par lusage grâce au réseau Dans tous les cas : une gestion rigoureuse des versions