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synthèse technologique
& GENNERE 6ème Séminaire synthèse technologique Grenoble décembre 2004
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SIMS-REIN Ben Saïd M, Richard JB, Le Mignot L,
Taupin P, Dufour E, Mugnier C, X Ferreira, JP Necker Toubiana* L, Jais JP, Landais P. EA222, hôpital Necker Université Paris 5 & *U444 INSERM
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SIMS-REIN Montée en charge Réseau humain Architecture du SI
Aspects techniques Aspects fonctionnels Contrôle de qualité Nouvelles fonctionnalités Évolution Communications
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SIMS-REIN Montée en charge Décembre 2004
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SIMS-REIN Novembre 2004 6 régions + la Pédiatrie Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre Provence Alpes-Côte-d’Azur Pédiatrie Ile-de-France jan. 2002 juin 2002 jan. 2003 jan. 2004 nov. 2004
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9080 patients SIMS-REIN décembre 2004 8858 3022 Limousin
Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre PACA Pédiatrie Ile-de-France 3022 Grenoble 21 déc 2004 2284 COS 23 Nov 2004 385 COS Oct 2003 22 Déc 2000 Client-léger Avril 2001 e-bordereau 21 jan 2002 Limousin – SIMS-REIN Juin 2002 Languedoc Jan 2003 Champagne Ardenne Jan 2004 Centre – PACA – Pédiatrie - IDF
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État Décembre 2004 9080 dossiers de patients dialysés 7576 dossiers de patients vivants
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État déc. 2004 : 7576 patients vivants
Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre Provence Alpes Côte d’Azur Pédiatrie Ile de France greffés hors région 353 1406 697 1233 3039 61 77 634 76
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SIMS-REIN : Outil - Flux & trajectoires des patients en IRTT
Total des transferts d’une unité de dialyse vers la dialyse:dans une même région (1654) dans une autre région (111) vers la transplantation de la transplantation vers la dialyse 2404 1756 628 20
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SIMS-REIN : Recueil des informations longitudinales - recueil du suivi annuel
Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne 215/ 195/ 800/ 674/ 360/
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Démarrage d’une nouvelle région (1)
Identification des acteurs : - Médecin régional, - médecin de santé publique , - attaché de recherche Clinique Identification des structures de soins de la région et des utilisateurs (profils) Dossier des préconisations SIMS et accompagnement des utilisateurs et des ARCs
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Démarrage d’une nouvelle région (2) Intégration dans SIMS-REIN
des données existantes Enquête CNAM-DHOS 2003 Bases locales - patients incidents à partir de juin 2003
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Intégration dans SIMS-REIN
des données de l’enquête CNAM-DHOS 2003 Gestion des données nominatives absentes de la base de l’enquête CNAM-DHOS 2003 Gestion des données incomplètes, des doublons, du codage médical Gestion de l’affectation des patients dans les unités de soins
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intégration dans SIMS-REIN des données de l’enquête CNAM
État nov : intégration dans SIMS-REIN des données de l’enquête CNAM 3800 dossiers de patient : 1200 région CENTRE, en PACA Complément et contrôle de qualité des données par les ARCs - Restent près de 1000 dossiers à vérifier dont plus de 900 en PACA
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intégration dans SIMS-REIN des données de l’enquête CNAM
État 20 déc : intégration dans SIMS-REIN des données de l’enquête CNAM 3800 dossiers de patient : Restent 6 dossiers à vérifier en PACA Contrôle de qualité des données de 2 à 5 mois après l’intégration des données de la région PACA et la région Centre dans SIMS-REIN
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Démarrage d’une nouvelle région (3)
Montée en charge en 2005 : Ile de France (2 ARCs +/- 1 ARC) Midi- Pyrénées (1 ARC) Basse Normandie (1 ARC) Bourgogne (?) Pays de Loire (?)
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SIMS-REIN le réseau humain Décembre 2004
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Les néphrologues et SIMS-REIN
170 codes d’accès à l’application pour 337 unités de soins Le réseau n’a pu se développer qu’avec la contribution de l’ensemble des acteurs
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Les médecins coordinateurs
Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre PACA Pédiatrie Ile-de-France J-C. Aldigier F. de Cornelissen H. Maheut S. Baudin, F. Von Ey P. Brunet, R. Sambuc MH. Saïd, P. Niaudet G. Bobrie
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Les Attachés de Recherche Clinique et SIMS REIN
Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre PACA Ile-de-France Florence Glaudet Françoise Lebeau Y Duny Marie-Dominique Lorenzi Claudette Berquez Anne-Claire Durand Pierre Taupin Patricia Chaignot
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Structures d’Appui Épidémiologique
Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre PACA Pédiatrie Ile-de-France A. Vergnenègre J-P. Daurès F. Vitry J-M. Halimi J-C. Delaroziere P. Landais
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Aspects techniques et fonctionnels
SIMS-REIN Aspects techniques et fonctionnels Décembre 2004
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SIMS-REIN Serveur d’identité Décembre 2004
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Serveurs d’évènements
SIMS : une architecture n-tier clients universels serveur web dynamique Fonctions métiers Interface Web JSP Servlets Serveurs d’évènements alimentation Serveurs d’identités intégrateur données Base d’évènements Base d’identité Datamart REIN
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Dossier CNIL (Annexes n° 5, 7, 8, 12, 13 & 14)
Mise en œuvre de l’application « Système d’Information Multi-Sources du Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie »
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Architecture du SI interface gestion des droits création synchro batch
modification lecture reconnais- sance identité algorithme comparaison BDD apprentissage synchro batch
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Découplage identité et données médicales Client Serveur d’identité
N° Patient Etat civil Interface web Données médicales N° Patient Données médicales
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Création d’une base d’identifiant dédoublonnage à la source
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notes techniques et fonctionnelles
SIMS-REIN notes techniques et fonctionnelles Décembre 2004
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SIMS-REIN aspects techniques et fonctionnels : Environnement
Transactions Exports Transferts
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Environnement : migration
Java Mysql Tomcat 1.4 4.0 5.0 XML, logging, assertions robustesse, performances, transactions performances, gestion mémoire
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Migration à venir Java 5.0 metadata, templates, ... Mysql 4.1
Tomcat 5.0 4.1 5.5 metadata, templates, ... - requêtes imbriquées, - procédures stockées, - contraintes d’intégrité, -fonctionnalités OpenGIS
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Transactions (1) Au niveau de l’application :
Encapsulation des traitements dans une servlet générique => gestion des connections, erreurs et rollbacks, systématisée
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Transactions (2) Écriture Filtre connexion affichage résultat
traitement erreur Écriture Filtre récupération exception
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Transactions (3) Au niveau des données :
moteur MyIsam -> InnoDB , compatible ACID Atomicity Consistency Isolation Durability
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Exports (1) Évolution des exports
les exports sont structurés pour faciliter leur utilisation : analyse épidémiologique et demande de soins analyse de l’offre de soins analyse annuelle analyse longitudinale
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Exports (2)
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SIMS-REIN Transferts Décembre 2004
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SIMS-REIN Typologie des problèmes
transferts et reconstitution des trajectoires dates aspects fonctionnels : mise à jour annuelle
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Transfert vers la greffe (1)
Création des unités de greffe : les transferts de greffe se feront dorénavant dans les unités de greffes et non plus vers l’administrateur SIMS REIN
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Unité de greffe – écriture non autorisée(1)
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Unité de greffe – écriture non autorisée(2)
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Transfert vers la greffe (4)
Administrateur SIMS-REIN CHU Reims CHU La Conception - Marseille CHU Nice CHU Tours CHU Montpellier Ile de France Autres 448 52 45 34 17 11 10 15
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Autres transferts Le retour à domicile et le départ définitif vers un autre pays restent déclarés à l’administrateur SIMS REIN
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SIMS-REIN nouveaux bordereaux Décembre 2004
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Nouveaux bordereaux Évolution vers le bordereau 2005
préconisations du Guide du REIN modifications mineures dans SIMS REIN : numéro EfG qualification des comorbidités modalités des lieux de traitement voie d’abord vasculaire
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SIMS-REIN Sécurité Décembre 2004
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Composants de la sécurité
Intégrité du système Contre les attaques extérieures Contre les pannes logicielles ou matérielles Gestion des accès Authentification Autorisation Accounting (Journalisation)
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Organisation du système
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Principe général La zone production ne communique pas directement avec les autres zones Elle n’est accessible que via le mandataire (proxy)
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Rôle du pare-feu Routage et filtrage des flux entre les différents segments au niveau des adresses IP et des protocoles (ports) Protocoles http (port 80) et https (port 443) autorisés en flux entrant sur la zone proxy, interdits vers les autres zones Translation des adresses locales (adressage privé) en adresses publiques légales sur Internet Accounting des règles de filtrage
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Rôle du mandataire inverse (reverse proxy)
Réécriture des URL publiques en URL privées -> Filtrage au niveau applicatif (filtrage des URL) Accounting du proxy (Apache mod_proxy) Gestion de SSL (mod_SSL)
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Détection d’intrusion
Carte réseau dédiée sans adresse IP pour l’analyse du trafic Recherche de signatures d’attaques (SNORT) Accounting
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Pannes logicielles et matérielles
Configuration RAID des serveurs Serveur de sauvegarde dédié dans la zone production
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Gestion des accès Utilisation du protocole SSL-TLS Authentification
Cryptage Approche mini-PKI Certificats serveur Certificats clients -> distribution des certificats clients ?
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SIMS-REIN Contrôle de qualité Décembre 2004
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SIMS-REIN : Contrôle de qualité
Procédures mises en place avec les ARC contrôle de l’exhaustivité et de la qualité des données
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Vérification d’identité
Contrôle exhaustivité et qualité Datamart REIN consolidation Base d’évènements Saisie brouillon validation Base d’identité Vérification d’identité clients universels serveur web dynamique données
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Patients traités hors région les centres de dialyses
Contrôle Exhaustivité : Limousin (1) Patients traités hors région Centre Lourd Association Listing secrétariat Contact avec les centres de dialyses PMSI Code de Dialyse Z491 Complément de la base SIMS REIN
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Monitoring du suivi : Limousin (2)
SUIVI MENSUEL Listing de chaque centre Listing de la base SIMS REIN SUIVI ANNUEL Patients absents de SIMS REIN Patients de SIMS REIN absents du listing des unités Edition du listing A l’aide de l’outil Mise à Jour dans SIMS REIN Nouveaux patients Identification de la sortie de liste Préparation de la fiche GREFFE DECES TRANSFERT Identification du médecin référent et envoi des fiches SAISIE SIMS REIN
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Contrôle Qualité : Languedoc Roussillon (1)
contrôle exhaustif : à partir de la liste SIMS REIN vérification exhaustive des 10 items de base contrôle par sondage: Tirage au sort dans la liste SIMS REIN Prise en compte de la taille des échantillons.
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comparées aux données des dossiers patients
Contrôle Qualité : Languedoc Roussillon (2) Données SIMS REIN comparées aux données des dossiers patients Variables quantitatives: Coefficient de correlation intra-classe (ICC). Variables qualitatives: Coefficient Kappa de Cohen Classification sur l’échelle de Landis et Koch Test de Mac Némar
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Rubrique Infos/outils
SIMS-REIN : Contrôle de qualité Rubrique Infos/outils Outils de monitoring . listes de requêtes ciblées, . module d’extractions de données, . suivi des mises à jour annuelles
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Etat suivi « brouillon » ou « validé »
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Etat suivi « consolidé » - unité de dialyse
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Etat suivi « consolidé » - région
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État suivi « exporté » au data warehouse
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2005 : deux objectifs ciblés
Stabiliser la cohorte Compléter la montée en charge … et préparer le futur
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SIMS-REIN Évolutions du SIMS Décembre 2004
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SIMS – Évolutions 1/ développer les outils de reporting 2/ stabiliser l’entrepôt de données 3/ finaliser le SIGNe : Système d’Information Géographique 4/ développer la modélisation spatio-temporelle
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Le reporting clients données universels SIG Interface Web
Base d’évènements Base d’identité Datamart REIN VUES DWH Outils tableaux de bord Analyses statistiques SIG Interface Web Fonctions métiers serveur web dynamique
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JP Jais, M Ben Saïd, L Le Mignot,
Identifiabilité JP Jais, M Ben Saïd, L Le Mignot, X Ferreira, JP Necker Être identifiable, être identifié Créer un site SIMS commun Mise à disposition des informations
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Standardiser et automatiser la présentation des grands axes d’analyse
Incidence selon l’âge Pourcentages de cas Taux / 106
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Développer le SIGNe Programme STIC SANTE INSERM-CNRS
L. Toubiana, J.-B. Richard, P. Landais Programme de recherche adapter l’approche spatio-temporelle aux besoins d'évaluation et de décision simulations et scénarios d’optimisation du couple demande/offre de soins
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Le Système d’Information Géographique
SIGNe
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Le Système d’Information Géographique
SIGNe
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SIGNe : développer la modélisation
spatio-temporelle
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SIMS-REIN contractualiser Décembre 2004
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Faire fructifier les partenariats GENNERE
Michel Simonet, Didier Guillon, Paul Landais Programme GENNERE adapter l’approche SIMS aux besoins d'évaluation et de décision en matière d’IRT pour la Chine, ville de Shanghai généricité du modèle SIMS appliqué à une autre affection chronique : la polyarthrite rhumatoïde
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GENNERE septembre 2004 Contrat Europe – ASIE
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SIMS-REIN Communiquer Décembre 2004
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communiquer
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Rapport DGS INSERM 1997 "l’évaluation des besoins de prise en charge des insuffisants rénaux chroniques au stade terminal : étude de faisabilité de différents scénarios de recueil d’informations pour répondre aux besoins prioritaires de l’Administration de la Santé, des cliniciens et des chercheurs". B. Stengel, P. Landais
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Néphrologie JOURNAL DE LA SOCIÉTÉ DE NÉPHROLOGIE
Vol. 20 N°
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2 février 2002 / 31 / n°4 - pp B. Kouchner : Insuffisance rénale chronique : vers une politique de santé publique J. Chanard : L’insuffisance rénale terminale en France La situation de l’insuffisance rénale chronique en France P. Landais : Épidémiologie de la demande de soins P. Landais : Offre de soins et prévention
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Comptes rendus Biologies Académie Sciences 2002 ISSN : Volume Numéro 4 - pp: : un système d'information multi-sources pour l'insuffisance rénale terminale Paul Landais, Ana Simonet, Didier Guillon, Christian Jacquelinet, Mohamed Ben Saïd, Claude Mugnier, Michel Simonet.
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A Multi-Source Information System for End-Stage Renal disease
E R A E D T A R e g i s t r y meeting A Multi-Source Information System for End-Stage Renal disease D. Guillon & P. Landais for the SIMS-REIN WG
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Stud Health Technol Inform.
2003;95: A dynamic Web application within an n-tier architecture: a Multi-Source Information System for end-stage renal disease. Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P.
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Systèmes d'information de santé
(Ingénierie des systèmes d'information-RSTI série ISI Vol.8 N° 1/2003) Un entrepôt de données pour l’aide à la décision sanitaire en néphrologie Simonet, M. Simonet, F. Gaspoz, M.Ben Saïd, D. Guillon, C. Jacquelinet, C. Mugnier, J-P. Jais, P. Landais
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Workshop on fundamental issues on geographic and spatial ontologies,
COSIT’03 Conference on Spatial Information Theory Ittingen, Switzerland 23 sept Ontology and Geographical Information System for End-Stage Renal Disease: the SIGNe Michel Simonet, Laurent Toubiana, Ana Simonet, Mohamed Ben Saïd, Paul Landais.
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Medinfo. 2004;2004(CD) PMID: [PubMed - in process] Avoiding doubles in distributed nominative medical databases: optimization of the needleman and wunsch algorithm. Mugnier C, Ben Said M, Le Mignot L, Jais J, Le Bihan C, Landais P.
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Journal of Epidemiology
& Community Health Vol 58 Supplement 1 August 2004 GIS INTEGRATION IN NEPHROLOGY: A SIGNE J. Richard, L. Toubiana, M. Ben Said, L. Mignot, JP. Jais, C. Mugnier, P. Landais. RELIABILITY OF PATIENT IDENTIFICATION IN A MULTISOURCE WEB DATABASE L. Le Mignot, C. Mugnier, M. Said, JP. Jais, J. Richard, C. Le Bihan, P. Landais. MULTI-SOURCES INFORMATION SYSTEM AND EPIDEMIOLOGICAL FOLLOW UP OF CHRONIC DISEASE M. Ben Said, C. Mugnier, L. Le Mignot, J. Richard, JP. Jais, P. Landais.
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Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie
Volume 52 No Hors-série 1 Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). Résultats du contrôle de qualité du réseau REIN en Languedoc-Roussillon Duny Y., Landais P., Ben Saïd M., De Cornelissen, F. Marty L., Daurès J.P. Contrôle d’exhaustivité et de qualité de l’enquête Épidémiologique REIN dans une des régions de l’étude : le Limousin Glaudet F., Aldigier J.C., Lebeau F., Preux P.M., Vergnenegre A.
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Projet SIGNe : Intégration d’un système d’information
Volume 52 No Hors-série 1 Projet SIGNe : Intégration d’un système d’information géographique pour la néphrologie Richard J.B., Toubiana L., Ben Said M., Le Mignot L., Jais J.P., Mugnier C., Landais P. Dédoublonnage d’identité dans des bases web-dynamiques multi-sources Le Mignot L., Mugnier C., Ben Said M., Jais J.P., Richard JB., Le Bihan C., Landais P. Système d’information multi-source et suivi épidémiologique des maladies chroniques Ben Saïd M., Mugnier C., Le Mignot L., Richard J.B., Jais J.P., Landais P.
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IDEAS'04-DH Beijing Sept, 1-3 2004
Workshop On Medical Information Systems The Digital Hospital Genericity of an Epidemiological Network for Nephrology and Rheumatology A Simonet, M Simonet, CG Bassolet, S Ferriol, C. Gueydan, R Patriarche, HJ Yu, P Hao, Y Liu, W Zhang, N Chen, M Forêt, P Gaudin, M. Ben Saïd, D Guillon, P Landais.
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SHANGHAI 8-12 novembre 2004 GENNERE: a Generic Epidemiological Network
for Nephrology and Rheumatology A Simonet, M Simonet, CG Bassolet, S Ferriol, C Gueydan, R Patriarche, H Yu, P Hao, Y Liu, W Zhang, N Chen, M Forêt, P Gaudin, G De Moor, G Thienpont, M Ben Saïd, P Landais, D Guillon.
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Geographical Information System For End‑Stage Renal Disease: SIGNe,
an Aid to Public Health Decision making. Toubiana L, Richard JB, Landais P.
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