Segmentation des têtes d’enfants en IRM 3D

Présentation au sujet: "Segmentation des têtes d’enfants en IRM 3D"— Transcription de la présentation:

1 Segmentation des têtes d’enfants en IRM 3D
Najib Gadi

2 Plan Images mises à disposition pour le projet ADONIS
Étude statistique de l’évolution de certains tissus par rapport à l’age Différentes structures à segmenter Résultats obtenus

3 Projet RNRT ADONIS www.tsi.enst.fr/adonis Partenaires
France Télécom R&D ENST Paris INERIS ENST Bretagne Ecole Supérieure d'Electricité Antennessa Bouygues Télécom SFR

4 ADONIS : Étude des effets nocifs des téléphones portables de 3e génération sur les têtes d’enfants
Projet ADONIS Évaluation de la quantité d'énergie absorbée par les organes internes des têtes d’enfants

5 Problèmes rencontrés => grande robustesse de la méthode exigée
Diversité des données (acquisitions provenant des différents scanneurs, variations morphologiques des sujets) => grande robustesse de la méthode exigée

6 Images fournies par Necker
-dx -dy -dz 1.2 -dx -dy -dz 1.2 Résolution: Age 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Nombre d’images récupérées 2 1

7 Images fournies par le CHU de Nîmes
-dx -dy -dz Résolution: Age 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Nombre d’images récupérées 1 2

8 Images fournies par Cochin
-dx -dy -dz Résolution: Age 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 Nombre d’images récupérées 1

9 Exemples de tissus à segmenter
Subcutis (couche de graisse sous la peau) Muscle Os externe Diploé Os interne Matière blanche Matière grise Sinus sagittal supérieur (artère) + AIR, sang, cornets, cartilage …

10 Cerveau, crâne, tête et corps calleux
Étude « statistique » de l’évolution de certains tissus par rapport à l’âge Cerveau, crâne, tête et corps calleux

11 Volume du cerveau vs l’âge

12 Corps calleux (CC) Aire du corps calleux vs âge
Localisation des quatre sous-régions (genue, tronc, ishtmus et splénium) M.S Keshavan et al, « Development of the corpus callosum in childhood, adolescence and early adulthood », Life Sciences (2002), Utilisation de la morphologie mathématique pour la segmentation du CC

13 Calcul de aire des sous régions du corps calleux

14 Aire des sous régions du CC
Conclusions Résultats sont en accord avec la bibliographie (Keshavan et al [2]), même si le papier analyse les ages 6 à 32 ans Le splénium semble avoir un taux de croissance plus élevé que le reste des sous-régions

15 Segmentation des images d’enfants

16 Morphologie Mathématique
Image discrète (f) : ensemble des points sur un maillage Z3 Image discrète f : Z3 -> Y (N, {0, 1}) Élément structurant G : X -> P(X) (tous les sous-ensembles de X) G dénote une boule centrée à l’origine Dilatation binaire : Érosion binaire e (complémentaire à d) : U G Î + = i x f ) ( d I G Î + = i x f ) ( e

17 Exemple: Extraction du cerveau
Seuillage X1={x, s1<f(x)<s2} Érosion X2=eX1 Sélection de la plus grande composante Connexe Reconstruction Remplissage des cavités coupe par coupe s1 =mcortex-scortex/2 s2=mgraisse-sgraisse K-moyennes