Worldwide Botanical Knowledge Base – Jean-Marc Vanel ● GNU-Linux systèmes d'exploitation WWBKB biologie ● XML: pas d'autre moyen! ● Comment ce projet est-il.

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1 Worldwide Botanical Knowledge Base – Jean-Marc Vanel ● GNU-Linux systèmes d'exploitation WWBKB biologie ● XML: pas d'autre moyen! ● Comment ce projet est-il venu? ● Depuis 15 ans je collectionne des plantes ● Expérimenté en informatique scientifique ● Un jour un collègue me dit: on peut trouver tout sur Internet ● Oui si on connait le nom

2 La Nature très menacée ● Des milliers d'espèces disparaissent pour toujours, ● Il faut une identification rapide des specimens de zones menacées, sans nécessiter de scientifiques; ● La connaissance est sur papier comme du temps de Linnaeus, ● ==> un inventaire (informatique) du patrimoine biologique de notre terre reste à faire.

3 La situation actuelle ● past efforts from biologists (e.g. Delta, Lucid) have been software first, data afterwards ● There is currently no other botanical project with this scope. Why ? ● funds go rather to biotechnologies than to descriptive biology, ● pluri-disciplinarity is not easy, ● laboratories are in a position of concurrence

4 Specifications ● rendre accessibles les données botaniques sur Internet : ● description des espèces, avec images 2D and 3D, ● identification assistée par ordinateur de specimens, ● Distribution géographique, ● Base de connaissances répartie (Web Sémantique), liens avec d'autres disciplines ● zoologie: pollinisation, disseminations, parasites, herbivores ● genetique/biochemie: e.g. corrélation entre molécules et taxonomie ● ecological - phytosociological, pedological, climatic: search of correlation, analyze of vicarious species ● agronomie, usages des plantes, ethnobotanie, paléontologie

5 Information libre / logiciel libre ● Personne ne possède la nature ● Un grand projet pour l'humanité, ● un projet informatique grandiose ● fédérer resources existantes et les hommes ● Flora of China Flora of China ● Flora of Australia ● Taxonomic Databases Working Group ● INRIA, Paris VI LIS, Museum,...

6 Vision: observations de terrain ● Vous avez un portable avec la base botanique, une camera, un GPS, et une connection Internet. Tout à coup rencontre d'une plante remarquable; vous la montrez à l'ordinateur, qui vous pose deux questions sur le nombre de carpelles, et les poils. ● l'ordinateur, indique que c'est un nouveau site pour Strasburgeria robusta, qu'on pensait exister seulement en Nouvelle Caledonia. ● Il propose d'envoyer des e-mails aux specialistes des Strasburgeriaceae, et de la region, et de recueillir un specimen d'herbier. Pendant ce temps, ce découverte, complète avec images et coordonnées géographiques, est envoyée au serveur concerné(s)