Les archives dans le domaine biomédical HAL (SDV) HAL-Inserm HAL-Pasteur … archives institutionnelles archive disciplinaire.

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1 Les archives dans le domaine biomédical HAL (SDV) HAL-Inserm HAL-Pasteur … archives institutionnelles archive disciplinaire

2 1 - Économique Le pouvoir des revues (5000 revues dans PubMed) Une production importante : 700 à 800 000 articles/an dans PubMed Rôle primordial de l’accès à l’information via les revues - Technologique Nécessité d’un accès pérenne Le contexte dans le biomédical

3 1999 - Mise en place de l’archive PubMed Central

4 1.Archive de revues depuis 2000 – 314 titres

5 2.Auto-archivage des articles des chercheurs du NIH depuis 2005 6025 dépôts

6 2001 lancement d’une pétition par Harold Varmus

7 6 Au niveau de l ’Inserm et du CNRS/SDV : deux stratégies complémentaires (BOAI) 1.Auto- archivage 2000 et 2003 : organisation de colloques internationaux pour sensibiliser les chercheurs Octobre 2003 : signature de la déclaration de Berlin, engagement collectif des institutions publiques européennes lancement de plusieurs projets pilote d’archives institutionnelles

8 7 2.Revues en accès libre 1992 : Projet Inserm pour les Comptes rendus de l’Académie des Sciences (CRAS), série III depuis 2002 - soutien à la publication dans des revues «open access» BioMedCentral mars 2006 : lancement d’Orphanet Journal of Rare Diseases (BMC)

9 8 Un constat mondial Les institutions publiques ne peuvent avoir accès à l’ensemble des connaissances qu’elles financent. La diffusion des connaissances est entravée. Toutes les institutions réagissent NIH, Max Planck, MRC, Wellcome Trust,MIT,CERN …. par la mise en place d’ «archives ouvertes»

10 9 Dans le domaine biomédical l’article = élément incontournable (évaluation, financement, promotion…) un point d’entrée incontournable : PubMed une archive en sciences de la vie : PubMedCentral des éditeurs « frileux » –15 sur 34 éditeurs classés « white » Sherpa/Romeo dont Endocrine Society, Lippincott, APS

11 10 Les institutions internationales s’organisent Mais, dans le domaine biomédical - en respectant le système du « peer reviewing » - en négociant les droits avec les éditeurs Les archives ouvertes représentent un autre système de communication et de diffusion des connaissances, parallèlement à l’édition

12 11 Rôle des interfaces de dépôt Politique des organismes Spécificités des domaines Modérations spécifiques

13 12 Politique actuelle de l’ Inserm Outil de communication et de diffusion des connaissances politique similaire à celle des NIH un dépôt incité non obligatoire… pour l’instant version «auteur» de l’article accepté dans des revues à comité de lecture des contrôles indispensables pour –valider les informations –faciliter les dépôts –lutter contre la «réticence des auteurs »

14 13 Spécificités HAL SDV Ajout de metadonnées –PMID –MH –Accepté dans –Auteur collectif

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16 15 Spécificités HAL SDV Ajout de métadonnées –PMID –MH –Accepté dans –Auteur collectif Référentiel journaux : liste PubMed Référentiel domaines Hal-Inserm

17 HAL SDV 25 domaines 75 sous-domaines

18 Référentiel à un seul niveau : 18 domaines 18 sous-domaines regroupés sous médecine humaine HAL-Inserm

19 18 Spécificités Hal-Inserm : contrôles 1.vérification des metadata biblio par import PubMed

20 Importation and validation via PubMed ID

21 20 Spécificités Hal-Inserm : contrôles 1.vérification des metadata biblio par import PubMed 2.vérification association auteurs/adresse une seule obligatoire 3.vérification des droits par rapport aux éditeurs

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23 22

24 23 Recommandation des NIH Notwithstanding any of the other provisions of this agreement, the journal acknowledges that the researcher will be entitled to deposit an electronic copy of the final, peer-reviewed manuscript into PubMedCentral. Manuscripts deposited with PMC may be made freely available to the public, via the Internet, within 6 months of the official date of final publication in the journal.

25 Consultation Embargo Mise en ligne Notice biblio visible sur internet Texte intégral Visible sur internet Contrôles Vérification technique du PDF Contrôle biblio : PMID Vérification droits Sherpa/Romeo article accepté http://www.sherpa.ac.uk/romeo.php Dépôt

26 25 Spécificités HAL-Inserm : consultation lien PubMed pour –bénéficier du linkout vers bases factuelles (gènes, protéines, substances chimiques…)

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28 Liens

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30 29 Mars 2007 : une première ! Reversement des dépôts Hal dans PubMed Central une visibilité internationale accrue un taux de citation augmenté

31 Interrogation PubMed Free in PMC

32 31 Lien au texte intégral déposé dans PMC

33 32 Manuscrit déposé dans HAL Inserm

34 Une visibilité internationale Mais des contraintes techniques et des contrôles nombreux

35 34 Intérêt de déposer des articles publiés 1.Préservation de la production scientifique par un dépôt unique 2.Visibilité accrue au niveau international impact plus important donc augmentation du taux de citation. –Free online availability substantially increases a paper’s impact. Lawrence S. Nature 2001 ; 411 : 521. –Open access, impact, and demand. Suber, P. BMJ 2005;330:1097-1098. –Citation Advantage of Open Access Articles. Gunther Eysenbach. PLos Biology 2006 May 4(5) –The Impact Factor Game. It is time to find a better way to assess the scientific literature. PLoS Med. 2006 Jun 6;3(6): e291 3.Possibilité de dépôts de données complémentaires (Image, video...)

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37 36 Situation Inserm Implication forte de la direction (lettre aux chercheurs, éditoriaux, présentations aux directeurs d’unités, contacts internationaux…) Actions d’information/sensibilisation sur sites pour motiver les chercheurs –des objectifs à faire partager –des habitudes à prendre (actuellement difficile recueil des versions « auteur »)