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ARABIDOPSIS
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Arabidopsis thaliana Classe : Angiospermes Eudicotylédones
Ordre : Capparales Famille : Brassicaceae Genre : Arabidopsis Espèce: thaliana Nom commun: Arabette des dames
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Arabidopsis thaliana Origine : Eurasie Port : Herbacée, 30-40cm
Racine : Pivotante Feuille : Alterne, stipulée Inflorescence : Grappe Fleur : 4S+4P+(4+2)E+2C Pollen : Tricellulé Fruit : Silique ( 2 carpelles soudés ouvert avec un septum) Graine : graines /silique :10000/plante
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Avantages d’ Arabidopsis thaliana
Cycle de croissance rapide Production de semences prolifique et culture facile dans un espace réduit Petit génome : kb Cartes génetiques et physiques des 5 chromosomes et séquençage terminé Méthodes de transformation efficace utilisant Agrobacterium tumefaciens Grand nombre de lignées mutantes et de ressources genomiques
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x4 X 20
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TAIR ; http://arabidopsis.org
Le site : The Arabidopsis Information Resource: TAIR ; donne un vue intégrée des données génomiques pour Arabidopsis thaliana. en 2002 etaient enregistrés à travers le monde 11000 chercheurs 4000 organismes
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Brassicaceae Arabidopsis thaliana Brassica Raphanus Plus de 100 autres
genres Arabidopsis thaliana Brassica Raphanus
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Relations entre espèces du genre Arabidopsis
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Stade de développement : Arabidopsis
Germination Production feuilles Rosette Emergence inflorescence Floraison Maturité silique jours
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germination
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germination
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cotylédons
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Plante en rosette
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Arabidopsis thaliana
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Plante en floraison
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Feuilles de la tige Entre-nœud Feuillesde la rosette racines
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SILIQUE
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Formation de la silique
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Embryogenèse Arabidopsis
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heterophyllie
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Major Characteristics of A. Thaliana
More than genes representing about 11,000 gene families Useful in comparative genomics Much smaller genome than crop plants 800 genes unique to the plant kingdom involved in photosynthetic activities; evolved from cyanobacteria
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Subtleties of A. Thaliana
Fairly uniform gene density, expression levels, and repeat distribution Gene density about 1 gene per 4.4 kB The transcribed portions of plant genes average about 1.9 kb in size Therefore, transcribed genes account for about 40–45% of the DNA.
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The volume of data resulting from Arabidopsis research has grown exponentially over the years, largely due to whole genome analyses. 400,000 nucleotide sequences, 200,000 mutant lines, 4,000 genetic markers, 90,000 polymorphisms, over14,000 publications available to the researchers.
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5 Chromosomes d ’Arabidopsis
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Chromosome 5 avec quelques mutants
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Fleur d’Arabidopsis
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Fleur d ’Arabidopsis et
Ses MUTANTS
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Méristème floral
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Phenotypes de mutations florales chez Arabidopsis
Wildtype Apetala-2(ap2) Pistillata(pi) Agamous(ag)
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Expression des gènes floraux
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Mutants floraux
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Pétales + étamines Arabidopsis flower showing the expression of a AtOPT3-GUS (b-glucuronidase) fusion.
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FWA LFY TFL1 FT AP1 AP2 CAL UFO SUP AG PI AP3 AP2 AP1 CFL HUA SEP1/2/3 HEN WUS CRC SPT sepal carpel stamen petal Modèle d ’interaction des gènes du développement floral
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Arabidopsis : mutants de
développement végétatif
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sauvage Mutants de l ’embryogenèse
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Méristème caulinaire
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Mutants du méristème caulinaire
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Méristème racinaire
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Mutants racinaires
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Mutant de la zone pilifére
cpc wer wt 500 µ
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inconvénients
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