Cours de Bactériologie Faculté de Médecine de Fès

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1 Cours de Bactériologie Faculté de Médecine de Fès
Dr. Sylvestre Tigaud Laboratoire de Bactériologie Centre de Biologie Nord Hôpital de la Croix-Rousse CHU de LYON

2 Hôpital de la Croix-Rousse
Mycobactéries Dr. Sylvestre Tigaud Tel : Fax : Hôpital de la Croix-Rousse

3 Mycobacteries 1) Classification
Genre Mycobacterium : Bacilles paroi complexe proche des Gram+ acido-alcoolo-résistants : BAAR coloration de Ziehl-Neelsen Espèces : Plus de 50 espèces espèces pathogènes spécifiques espèces pathogènes opportunistes

4 Bacilles de Hansen

5 Mycobacteries 1) Classification
Espèces pathogènes spécifiques Complexe de la Tuberculose : M. tuberculosis : tuberculose humaine +/- animaux domestiques M. bovis : tuberculose bovine +/- homme M. africanum : en Afrique de l’Ouest et Centrale Le BCG : M. leprae : lèpre (humain) Espèces pathogènes oportunistes Mycobactéries « atypiques » : commensales, infection chez ID, gestes chirurgicaux, anciens tuberculeux, etc...

6 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Ecologie M. tuberculosis : homme et primates et occasionnellement les animaux familiers pathogènes stricts les plus résistantes des bactéries non sporulées mais tuées par alcool à 70°

7 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Bactériologie Bacille immobile (pas de capsule, pas de spore), aérobie Coloré en rose par la coloration de ZIEHL-NEELSEN milieux spéciaux : LOWENSTEIN-JENSEN (pomme de terre + oeuf), MIDDELBROOK tp de génération 20 heures  apparition des colonies verruqueuses beiges en 4-8 semaines Il faut toujours demander spécifiquement la recherche de M. tuberculosis au laboratoire

8 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
identification d'espèce/autres mycobactéries: Traditionnellement : vitesse de croissance, aspect des colonies, tests biochimiques, rapport avec la lumière. Actuellement : Hybridation génique facteurs de pathogénicité mal identifiés (pas de production de toxine) M. tuberculosis = intracellulaire facultatif, inhibe la fusion phago-lysosomiale

9 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Physiopathologie contamination: voie aérienne, M. tuberculosis (M. bovis) (rôle gouttelettes de mucus et des malades avec lésions pulmonaires cavitaires) digestive, M. bovis, lait contaminé Pénétration dans polynucléaires et macrophage, multiplication et réaction immunitaire cellulaire  granulome Puis nécrose centrale et passage dans la circulation lymphatique et/ou sang

10 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Participation de l’immunité et de l’allergie réaction immunitaire cellulaire: LT stimulé  MAF macrophages activés  blocage de la multiplication bactérienne  quiescence + virage de l'IDR (hypersensibilité retardée) Réactivation : à l'occasion d'une baisse des défenses cellulaires  multiplication et dissémination

11 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Epidémiologie : 1/3 de la population mondiale OMS en 1990 : 1,7 milliards de porteurs de BK 20 millions de maladies actives 8 millions de nouveaux cas / an 3 millions de décès par an (1ère cause de décès dus à un agent infectieux) chaque jour plus de personnes contracte une tuberculose et en meurent ! (OMS 2003)

12 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
L’épidémie mondiale croit de 3% par an (un patient atteint de tuberculose active infecte 10 à 15 personnes / jour) FES = 500 à 600 cas / trimestre Facteurs de risque dénutrition alcoolisme immuno-dépression (maladie (SIDA), traitement,) contact répétés avec un tuberculeux séjours en forte endémie

13 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
La tuberculose Contamination à partir d ’un sujet bacillifère (présence de bacilles dans l’air expiré)  inhalation et atteinte des alvéole pulmonaire  90% des cas : arrêt rapide de la multiplication des bacilles : guérison apparente  10% des cas : maladie tuberculeuse Incubation longue et silencieuse

14 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Evolution de la primo-infection : complexe,dépend de l’importance et de la virulence de la bactérie et du terrain de l’hôte (Age, avec risque particulier du jeune adulte) Maladie respiratoire 9/10 : poumon, plèvre, ganglions médiastinaux lésion principale : caverne tuberculose pulmonaire cavitaire : forme contagieuse de la maladie Localisations extra-pulmonaires 1/10 : ganglions, méningée, ostéo-articulaire, génito-urinaire

15 Chest x ray film showing evidence of pulmonary tuberculosis
Red areas in the upper lobe of the right lung

16 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
VI - Mycobacteries 2) M. tuberculosis Diagnostic biologique direct Prélèvements (répétés, crachats, tubages gastriques, LBA, urines, biopsies tissulaires, LCR, etc... Concentration et décontamination du crachat (soude 2% + agent mucolytique) Examen microscopique Ziehl-Neelsen ou autre coloration présence de BAAR

17 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Culture Lowenstein-Jensen à 37°C en aérobiose 4 à 8 semaines antibiogramme: indispensable Identification biochimique ou actuellement par une sonde à ADN Technique de PCR+++ indirect : recherche d'une HSR à la tuberculine : IDR à 10U, lecture à72h. Recherche d ’une induration Témoigne d'un contact préalable avec M.tuberculosis ou M. bovis (primoinfection) ou BCG ?

18 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Traitement Objectif : Stérilisation complète des lésions tuberculeuses en agissant sur les bacilles intra et extra-cellulaires Principes Association d'antibiotiques pour éviter la sélection de résistance (3 ou 4 atb au début avant le résultat de l'antibiogramme) Longue durée 6, 9 mois ou plus

19 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
Molécules Isoniazide (hépatotoxique) Rifampicine (risque hépatique) Pyrazinamide (risque hépatique) Ethambutol (risque de névrite optique) Modalités Traitement de 6 mois : 2 mois avec I, R, P, E et 4 mois avec I, R Traitement de 9 mois : 2 mois avec I, R, P, E et 7 mois avec I, R ou plus si tuberculose extra-pulmonaire

20 Mycobacteries 2) M. tuberculosis
VIII - Vaccin : le BCG souche vivante de M. bovis dont la virulence est atténuée (bacille de Calmette et Guerin) âge : dès la naissance dans un groupe à risque dès l’entrée dans une collectivité (crèche) ou à 6 ans injection intradermique au sujet IDR négative  lésion qui persiste 1 à 3 mois efficacité du vaccin : Très bonne protection contre les tuberculoses graves Bonne protection contre les tuberculoses pulmonaires

21 Mycobacteries 3) Mycobacterium bovis
Infecte le bétail mais aussi l’homme ; Pathogène strict Contamination de l’homme : Voie aérienne au contact des animaux malades Absorption de lait de vache contaminée Diagnostic biologique BAAR avec des caractères culturaux et biochimiques différents de M. tuberculosis Prévention Pasteurisation du lait Abatage des bovidés réagissant positivement à la tuberculine

22 Mycobacteries 4) Mycobactéries "atypiques"
Bactéries de l'environnement, pathogènes opportunistes infections opportunistes localisées chez l'immuno-compétent infections généralisées chez l‘immuno-déprimés 4 groupes M. xansasii: infections pulmonaires M. avium-intracellulare: infections généralisées lors du sida M. xenopi: infections pulmonaires M. fortuitum, M. chelonei: à croissance rapide, abcès chez les drogués IV

23 Mycobacteries 4) Mycobactéries "atypiques"
Diagnostic BAAR culture en 1 à 8 semaines identifie caractères biochimiques et/ou sondes Traitement problème multirésistance

24 Mycobacteries 4) Mycobacterium leprae
LEPRE = maladie de HANSEN BAAR non cultivable Atteinte des nerfs et de la peau Encore un problème de Santé Public dans environ 24 pays (zone intertropicale) Pas de vaccin, pas de traitement préventif (mais le BCG protégerait partiellement ?) Éradication : campagne de dépistage et traitement précoce