de la publication scientifique

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1 de la publication scientifique
Les dessous de la publication scientifique B. Gobert IRD - Brest 22° Mois de la science de Brest "La communication" – avril 2008

2 Introduction : la communication des savants
Les dessous de la publication scientifique Introduction Introduction : la communication des savants La communication, au cœur du processus de recherche construction collective d'un savoir transmission, partage et débat Des modes de communication variés écrit / oral formel / informel avec / sans validation La publication d'aujourd'hui, aboutissement d'une longue histoire correspondance privée (-> XVIII° siècle) premières revues scientifiques (1665) ouvrages modèle dominant actuellement, au moins dans les "sciences dures" ~24000 revues scientifiques, 2,5 millions d'articles/an La "publi", miroir de la communauté scientifique d'autres enjeux derrière la communication s.s. un modèle d'évaluation théoriquement idéal science désintéressée et puissances d'argent

3 Plan 1. La publication, vecteur de transmission de résultats
Les dessous de la publication scientifique Plan 1. La publication, vecteur de transmission de résultats 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective 3. La publication, modèle économique en pleine transition 4. La publication du 21° siècle Conclusion : la troisième révolution

4 La publication, vecteur de transmission de résultats
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication, vecteur de transmission de résultats

5 Publication scientifique et théorie de la communication
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication comme vecteur de transmission de résultats Publication scientifique et théorie de la communication Auteur(s) Lecteurs Contenu scientifique Revue Emetteur Récepteur Canal Message Langage Canal Emetteur Anatomie d'un article : Message Langage Récepteur

6 Emetteurs et récepteurs
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication, vecteur de transmission de résultats Emetteurs et récepteurs Emetteurs : les auteurs nombre statut et affiliation rôle dans le travail publié ordre d'apparition Photo Ifremer- BLP Récepteurs : la communauté scientifique communauté scientifique (s.l.) accès au document (papier ou électronique) très peu de lecteurs par article

7 Le langage : langue, style et jargon
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication, vecteur de transmission de résultats Le langage : langue, style et jargon Langue Style Jargon spécialisé "Nous avons appliqué ces vecteurs à la délivrance d'oligonucléotides antisens et de siRNA in vitro, respectivement dans un modèle de correction de l'épissage alternatif contenant l'intro aberrant de la B-thalassémie et dans un modèle de cancer du sein." "C'est l'organisation d'une application à la question du sol de la conceptualisation en terme de production et de consommation d'un bien commun qui a permis de mettre à jour ce lien entre choix d'un modèle de développement régional et amélioration difficile de la qualité de l'environnement urbain."

8 Le message : élaboration du contenu scientifique
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication, vecteur de transmission de résultats Le message : élaboration du contenu scientifique Principes fondamentaux originalité : non publiés ni soumis ailleurs rigueur : démonstration ou citation validation du contenu par les pairs Structure imposée par la plupart des revues

9 Le message : validation du contenu scientifique
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication, vecteur de transmission de résultats Le message : validation du contenu scientifique Principes de l'évaluation des manuscrits évaluation par les pairs ("peer-review") : pas de notion de hiérarchie référés : chercheurs sollicités par l’éditeur selon leur domaine de compétence référés bénévoles et anonymes (inconnus des auteurs) 2) Réponse de l'éditeur rejet possible si instructions aux auteurs pas respectées sujet hors du domaine de la revue étude d'intérêt très local, etc. 4) Avis synthétique de l'éditeur synthèse de l'éditeur avis des référés manuscrits annotés 4) Version révisée par l'auteur réponse point par point argumentation possible 1) Soumission du manuscrit auteur éditeur référés 2) Sollicitation des référés choix par l'éditeur envoi du manuscrit grille d'évaluation 3) Réponse des référés acceptation révision mineure révision majeure rejet argumentation détaillée Délai de publication quelques mois (quelques jours à plus d’un an) Taux d'acceptation très variable selon les revues et les domaines 5% (articles biomédicaux dans Nature), le plus souvent entre 30 et 50 % soumission d'articles rejetés à d'autres revues

10 Le message : regard critique sur l’évaluation
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication, vecteur de transmission de résultats Le message : regard critique sur l’évaluation Un garde-fou indispensable mais pas parfait n'importe qui ne peut pas publier n'importe quoi mais erreurs possibles : rejeter ce qui devrait être accepté accepter ce qui devrait être rejeté Théorie et pratique de l'évaluation par les pairs temps consacré à une tâche bénévole et non reconnue mauvais choix de référés par l'éditeur partialité des référés attitude face à l'innovation Quelques exemples de dysfonctionnements fraudes (très rares mais parfois spectaculaires) plagiats et duplications "mauvais" articles un cas très particulier : "l'affaire Sokal" (1996) Conclusion dysfonctionnements rares surtout dans les domaines où la pression de publication est la plus forte révélateurs des faiblesses du système

11 Le canal : la revue scientifique
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication, vecteur de transmission de résultats Le canal : la revue scientifique L'auteur et la revue choix de la revue (domaine, périodicité, notoriété, spécialisation, pays,…) rapports d'argent : rémunération, prix/page Un nombre en augmentation continue première revue scientifique en 1665 plus de revues avec évaluation par les pairs hiérarchie dictée par le "facteur d'impact" Fonctions de la revue traditionnelle organiser l'évaluation mettre en forme pour publication imprimer et distribuer détenir le copyright La revue au cœur du débat aspects économiques papier / électronique

12 Les revues électroniques
Les dessous de la publication scientifique 1. La publication, vecteur de transmission de résultats Les revues électroniques Du papier à l'écran documents numériques accessibles par internet depuis ~10 ans Avantages certains liens entre articles par les citations données complémentaires pas de limites de contenu interactivité (référés, débats,…) facilité de stockage des documents Avantages hypothétiques publication plus rapide coûts moindres lecture à l'écran visibilité des articles Différentes modalités d'accès aux articles accès protégé (payant) : éditeurs traditionnels accès libre (gratuit) : avec ou sans but lucratif accès au choix de l'auteur : revues hybrides ("open choice")

13 La publication, outil d'évaluation individuelle et collective
Les dessous de la publication scientifique 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective

14 Fonctions de la publication
Les dessous de la publication scientifique 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective Fonctions de la publication Dès les débuts (1665) revendication de paternité diffusion des résultats reconnaissance personnelle Evolution récente importance décroissante : diffusion des résultats (internet, accès libre) importance croissante : reconnaissance personnelle (facteur d'impact) apparition d'une 4° fonction : évaluation de la production scientifique et de son impact Comment la revue a-t-elle acquis cette fonction ?

15 De la bibliographie à la bibliométrie…
Les dessous de la publication scientifique 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective De la bibliographie à la bibliométrie… L'impasse de l'après-guerre inflation de la production scientifique limites des bibliographies traditionnelles Eugene Garfield et le "Science Citation Index" utiliser les citations pour mesurer l'intérêt des articles sélectionner les revues les plus importantes de chaque domaine Au-delà du projet initial notion : "core science" (noyau dur) outils : bases de données de citations "Science Citation Index" (1963) : intérêt des articles "Journal Citation Index" (1978) : notoriété des revues

16 …puis à la "scientométrie"
Les dessous de la publication scientifique 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective …puis à la "scientométrie" "Mesurer la science" demande croissante de la société pour des indicateurs quantitatifs hypothèses de base : l'activité scientifique peut être mesurée par son résultat : la publication le taux de citation est un indicateur de qualité évaluation à toutes les échelles Des bases de données très complètes Une profusion d'indicateurs pour les revues : facteur d'impact immédiateté demi-vie des citations etc. pour les chercheurs : nombre d'articles nombre de citations facteur H

17 Evaluation des revues : le facteur d'impact
Les dessous de la publication scientifique 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective Evaluation des revues : le facteur d'impact FI (année n) = nombre de citations l'année (n) d'articles publiés en (n-1) et (n-2) dans la revue nombre d'articles publiés en (n-1) et (n-2) dans la revue En 2008 : 6166 revues évaluées 1 : Cancer Journal for Clinicians (FI : 63,342) 6123 ex-aequo : 44 revues (FI : 0,000 ) Les 200 premières revues Science (9) Nature (15) Sciences biomédicales (médecine, génétique, biotechnologies,..) Autres disciplines Ecologie Halieutique Aquaculture Biologie marine et aquatique Océanographie Cancer Journal for clinicians (1) Facteur d’impact 2006 Source : ISI Web of Knowledge

18 Regard critique sur le facteur d'impact
Les dessous de la publication scientifique 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective Regard critique sur le facteur d'impact Un indice à manipuler avec prudence nombreux critères d'appréciation : pratiques de citation d'une discipline à l'autre rythme du cycle de recherche périodicité de la revue durée du processus de publication part des articles de synthèse (reviews) communautés spécialisées => pas de valeur universelle ! Articles Citations 15 % 50 % 90 % 100 % Qualité scientifique ou marque de prestige ? le facteur d'impact qualifie une revue, pas un article les citations sont concentrées sur un petit nombre d'articles Articles publiés entre 1989 et 1993 : % d'articles jamais cités (étude publiée en 1996) Cell (facteur d'impact : 29,2) 9 % Proceedings of the National Academy of Sciences 16 % Experimental Physiology (facteur d'impact : 2,3) 43 % European Journal of Pharmacology (facteur d'impact : 2,5) 52 % Source : Manoury, CNRS, 1996

19 Indices pour l'évaluation des auteurs
Les dessous de la publication scientifique 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective Indices pour l'évaluation des auteurs Base de données de l'ISI Web of Science Nombre de publications parfois avec le facteur d'impact : faux ! Nombre total de citations Indice de Hirsch mesure de la production scientifique et de son utilisation h Nombre de citations Publications par ordre décroissant de citation Indice de Hirsch environ h articles ont été cités au moins h fois Recherche d'indices plus pertinents critique des indices existants nombreux travaux en cours (indice M, indice y,…) pondérations diverses,…

20 La tyrannie des indicateurs scientométriques
Les dessous de la publication scientifique 2. La publication, outil d'évaluation individuelle et collective La tyrannie des indicateurs scientométriques Conséquences pour les auteurs : publier toujours plus ! "publish or perish" rôle croissant de la revue comme "label" de prestige stratégies et tactiques (soumission d'articles, citations, tentations d'infraction) décalage croissant entre l'écriture et la lecture de la science Conséquences pour les organismes : politiques scientifique et documentaires confusion entre excellence et élitisme, qualité et prestige interprétation abusive du facteur d'impact pilotage "au compteur" politiques d'abonnement des bibliothèques sélection par l'argent (pays/organismes) Conséquences pour les éditeurs : la "course au facteur d'impact" légitimité des "core journals" renforcée a posteriori création d’un marché générateur de profits stratégies éditoriales (fuite du risque, recherche du scoop) encouragement voire pression à l'auto-citation des revues menaces sur le système de peer-review

21 La publication, modèle économique
Les dessous de la publication scientifique 3. La publication, modèle économique en pleine transition

22 L'économie de la publication : quelques chiffres
Les dessous de la publication scientifique 3. La publication, modèle économique en pleine transition L'économie de la publication : quelques chiffres Chiffre d'affaires mondial des revues (2002) : 3,5 milliards de $ Prix des abonnements très variable d'un titre à l'autre de quelques centaines à plus de € Structure des coûts revues papier : prédominance des coûts fixes électronique : absence des coûts variables Sources : Springer, Elsevier Traitement des articles scientifiques Traitement des autres textes Support éditorial Distribution Impression Coûts fixes Coûts variables Source : Pignard-Cheynel, 2004

23 Un modèle économique très particulier
Les dessous de la publication scientifique 3. La publication, modèle économique en pleine transition Un modèle économique très particulier Revue Abonné (bibliothèque) Lecteur Auteur Référés Editeur scientifique Valeur ajoutée manuscrit article Le fournisseur (l'auteur) ne vend pas son produit (parfois, il paie) Une partie des services est gratuite (évaluation, parfois mise en forme) Le consommateur (le lecteur) n'est pas le client qui achète le produit (la bibliothèque) Le fournisseur de la revue et son client sont identiques = institutions de recherche (publiques ou privées) Revue Institutions de recherche $ Conclusion : les éditeurs sur la sellette ("L'Etat achète aux éditeurs ce qu'il leur a fourni gratuitement")

24 350 ans d'édition de revues scientifiques
Les dessous de la publication scientifique 3. La publication, modèle économique en pleine transition 350 ans d'édition de revues scientifiques L'exclusivité des sociétés savantes fin XVII° - fin XIX° siècle L'entrée discrète des éditeurs privés fin XIX° - début XX° siècle difficultés croissantes pour les sociétés savantes L'émancipation de l'édition commerciale années 2 facteurs : problème des "page charges" avènement du Science Citation Index 1665 1833 L'émergence d'un secteur capitaliste fin du XX° siècle particularités du marché concentration de l'offre investissement de groupes financiers cotés en Bourse 1964 2008

25 Un marché aux caractéristiques uniques
Les dessous de la publication scientifique 3. La publication, modèle économique en pleine transition Un marché aux caractéristiques uniques Pratiquement inélastique relation prix-demande fonction du facteur d'impact Très peu concurrentiel unicité du produit (article) mais concurrence forte entre grands éditeurs De plus en plus concentré quelques très gros éditeurs achats et prises de contrôle Elsevier : Cell, The Lancet, Pergamon, Academic Press, etc. Blackwell : fait partie de Wiley Taylor & Francis Autres Elsevier Springer-Kluwer Blackwell Wiley Les revues à comité de lecture ("peer-review") 2004 Les 6589 revues indexées par l'ISI (facteur d'impact) Non commerciaux Les 200 premiers facteurs d'impact 2008 Source : Pignard-Cheynel, 2004 => danger !

26 La crise du prix des abonnements
Les dessous de la publication scientifique 3. La publication, modèle économique en pleine transition La crise du prix des abonnements Dépense totale en périodiques Prix moyen des abonnements aux périodiques (8,8 %/an) Dépense totale en ouvrages Prix moyen des ouvrages (3,7 %/an) Nombre d’ouvrages achetés Nombre d’abonnements à des périodiques Source : Association of Research Libraries (USA) Le cauchemar des bibliothèques désabonnements massifs et douloureux impact sur les achats d'ouvrages Polémiques sur les raisons de la crise pour les éditeurs : causes conjoncturelles : inflation, taux de change, augmentation des coûts,… juste rémunération des risques de l'entreprise spirale inflationniste : augmentation du coût, moins de clients, etc. pour les scientifiques : abus de position des éditeurs et recherche de profits

27 La crise du prix des abonnements (suite)
Les dessous de la publication scientifique 3. La publication, modèle économique en pleine transition La crise du prix des abonnements (suite) Dépense totale en périodiques Prix moyen des abonnements aux périodiques Dépense totale en ouvrages Prix moyen des ouvrages Nombre d’ouvrages achetés Nombre d’abonnements à des périodiques Source : Association of Research Libraries (USA) coût de l’abonnement aux revues Elsevier pour l’Ifremer (K€) Renversement de tendance : réalité ou illusion ? groupement d'acheteurs en "consortium" versions électroniques des revues les "big deals" (ex. Science Direct chez Elsevier) prix moyen et dépenses totales Source : Ifremer

28 Les revues électroniques : un modèle économique radicalement différent
Les dessous de la publication scientifique 3. La publication, modèle économique en pleine transition Les revues électroniques : un modèle économique radicalement différent De la numérisation du texte écrit à la production de texte numérique bouleversement du processus de production coûts fixes et coûts variables Propriété définitive et droits d'accès temporaires vente -> licence révolution dans le rôle des bibliothèques fragilité de la capitalisation documentaire L'article, unité de base du système réseau d'articles reliés par les citations nouveaux services (moteurs de recherche, etc) rôle principal de la revue : "label de qualité" implications sur le mode de paiement De nouvelles opportunités pour les grands éditeurs structure des coûts : stratégies des "big deals" statistiques d'accès et de téléchargements : une scientométrie privée et exclusive pas de remise en cause de leur hégémonie

29 La publication du 21° siècle
Les dessous de la publication scientifique 4. La publication du 21° siècle

30 De nouveaux modèles d'accès à l'information
Les dessous de la publication scientifique 4. La publication du 21° siècle De nouveaux modèles d'accès à l'information Un système de moins en moins satisfaisant perte de contrôle de la communauté scientifique inégalité croissante dans l'accès à l'information concentration et "big deals" : le cercle vicieux Se ré-approprier l'édition et la diffusion scientifiques SPARC (1998) : Scholarly Publishing and Resources Coalition PLoS (2001) : Public Library of Science déclarations de Budapest (2002), Bethesda, Berlin (2003), etc. L'émergence de "l'accès libre" accès gratuit, universel et permanent à l'information scientifique deux stratégies : en amont : revues électroniques en accès libre en aval : archives ouvertes

31 Les revues électroniques en "accès libre"
Les dessous de la publication scientifique 4. La publication du 21° siècle Les revues électroniques en "accès libre" Principes communs consultation libre et gratuite pas de cession totale de copyright frais à la charge des auteurs (500 à > 2500 $/article) dépôt par la revue dans une archive ouverte Quelques exemples : BioMed Central (1999) éditeur commercial "100 % électronique" plus de 130 revues libres PLoS (2003) éditeur sans but lucratif "100 % électronique" revues libres : 6 titres spécialisés + 1 généraliste Bentham (2007) éditeur commercial traditionnel (89 revues papier) 200 revues libres créées en 2 ans Coûts et bénéfices de PLoS Source : Nature, 2006 Un marché en pleine évolution croissance rapide du secteur part de marché encore très faible viabilité financière encore incertaine dans certains cas (PLoS)

32 Les archives ouvertes Définition Origine et développement Etat actuel
Les dessous de la publication scientifique 4. La publication du 21° siècle Les archives ouvertes Définition archivage en ligne de versions électroniques indépendant de la publication droit d'accès gratuit, irrévocable et mondial licence autorisant à copier, utiliser, distribuer, transmettre,… Source : OpenDOAR, 2008 Origine et développement premières expériences au début des années 1990 mobilisation progressive des scientifiques divers projets à la fin des années 1990, aux USA et en Europe Etat actuel près de 1000 archives, 15,5 millions de documents surtout développé aux Etats-Unis, plus récent en Europe Deux aspects importants juridiques : droits des auteurs et des éditeurs, pré- et post-publications techniques : interopérabilité, formats, normes, interrogation

33 Les acteurs de la recherche et les archives ouvertes
Les dessous de la publication scientifique 4. La publication du 21° siècle Les acteurs de la recherche et les archives ouvertes Auteurs encore peu sensibilisés rôle des archives ouvertes pas toujours bien compris importance de la tradition de chaque communauté scientifique Institutions (organismes, universités) création d'archives institutionnelles plus de recommandations que d'obligations plus facile pour certains documents (thèses) rôle des bibliothèques Bailleurs de fonds (Etats, fondations,…) intérêt direct en tant que financeurs obligations de dépôt parfois obligatoires (USA, GB) poids politique face au lobby des éditeurs Editeurs classiques réticents contraints de modifier leurs conditions de copyright la plupart des revues acceptent l'archivage des pré- ou des post-publications Editeurs "libres" partagent la même philosophie rôle actif : assurent souvent eux-mêmes l'archivage des articles

34 Les archives ouvertes en France
Les dessous de la publication scientifique 4. La publication du 21° siècle Les archives ouvertes en France Un mouvement qui s'accélère 2000 : création au CNRS du Centre pour la Communication Scientifique Directe (CCSD) 2001 : ouverture de HAL (Hyper Article en Ligne) par le CCSD 2003 : signature de la Déclaration de Berlin en faveur "du libre accès à la connaissance" (CNRS, INRA, INRIA, INSERM, IRD) 2005 : avis favorable de l'Académie des sciences sur les archives ouvertes 2006 : protocole d'accord pour une approche nationale coordonnée 2007 : L’ ANR incite les chercheurs à déposer dans la base HAL HAL en 2008 plateforme commune d'archives ouvertes environ 25 archives institutionnelles ou thématiques instituts, universités, écoles d'ingénieurs, laboratoires,… plus de articles, près de thèses dépôt annuel : 18 % de la production scientifique française couplage avec archives thématiques : ArXiv et PubMed Central ouverture vers l'Europe et le secteur privé Source : CCSD - CNRS Les autres archives institutionnelles une trentaine d'autres archives : organismes (Archimer-Ifremer, Horizon-IRD couplée à HAL-IRD), universités, laboratoires, etc

35 la troisième révolution
Les dessous de la publication scientifique Conclusion Conclusion : la troisième révolution La publication, au-delà de la "communication" La philosophie du "libre" logiciels libres, encyclopédies libres, etc. complètement libéré du secteur privé ? Encore beaucoup de questions pas assez de recul sur les nouveaux modèles aspects économiques aspects juridiques ~1450 : l'imprimerie Johannes Gutenberg 1665 : la revue scientifique Henry Oldenburg ~2000 : Le numérique et l'accès libre La communauté scientifique Une certitude : l'évolution des pratiques auteur – référé – lecteur documentaliste – bibliothécaire éditeur La troisième révolution

36 Une sélection de sites web pour en savoir plus
Liens généraux La comunication des sciences sur internet. Stratégies et pratiques (N. Pignard-Cheynel, Univ. Grenoble 3, 2004) In Oldenburg's long shadow (J.C. Guédon, Univ. Montréal, 2001) La publication, vecteur de transmission de résultats Editorial Peer Review : part of the solution or part of the problem ? (I. E. Rockwood, 2007) Peer review and the acceptance of new scientific ideas (Sense about science, 2004) Page d'A. Sokal sur "l'affaire Sokal" Cloningate ? La publication scientifique et le clonage thérapeutique face à la mystification Hwang (H. Chneiweiss, Inserm, 2005) La fraude scientifique : La réponse de la communauté (G. Ramunni, univ. Lyon 2, 2003)

37 Une sélection de sites web pour en savoir plus
La publication, outil d'évaluation individuelle et collective Citations et facteurs d’impact : quel avenir pour l’évaluation ? (M. Durand-Barthez, Urfist, 2006) Du bon usage du facteur d'impact (N. Pinhas et C. Kordon, Inserm) Why the impact factor of journals should not be used for evaluating research (P. Seglen, British Medical Journal, 1997) Les indicateurs bibliométriques et la mesure des performances scientifiques (rapport Cner, chap. 4, 2003) Les nouvelles formes d’évaluation scientifique : quelles évolutions en sciences, technique et médecine ? (M. Durand-Barthez, SCD Toulouse 3, 2007) Site de l'ISI Web of Knowledge La publication, modèle économique en pleine transition Statistiques de l'Association of Research Libraries (ARL, 2006) L’impact des monopoles des grands éditeurs de périodiques : enjeux et perspectives pour le chercheur (F. Vandooren, Univ. Libre Bruxelles, 2003) The Librarians' Dilemma. Contemplating the Costs of the "Big Deal" (K. Frazier, univ. Wisconsin, 2001)

38 Une sélection de sites web pour en savoir plus
La publication du 21° siècle Libre accès à l'information scientifique et technique (Inist ) Directory of open access journals Archives ouvertes : quinze ans d'histoire (H. Bosc, Inra, 2005) Dossier documentaire : l'"open access" (K. Guha, ENPC, 2006) Politiques de copyright et d'auto-archivage des éditeurs (site Roméo) Archive ouverte HAL (Hyper Article en Ligne) Les archives ouvertes : problématiques et perspectives (F. André, Inist-CNRS, 2006) Directory of Open Access Repositories - OpenDOAR