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Le monde Microbien l Bactéries (taille 1-5 µm) monocellulaire –Procaryotes (noyau simplifié, paroi) –Multiplication rapide sur milieux (10 9 <24h) l Virus.

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1 Le monde Microbien l Bactéries (taille 1-5 µm) monocellulaire –Procaryotes (noyau simplifié, paroi) –Multiplication rapide sur milieux (10 9 <24h) l Virus (taille 10 nm) –Un seul acide nucleïque (ADN ou ARN) –Multiplication dans cellules obligatoire l Prions ou Agent Non Conventionnel –Proteine, accumulation intracellulaire l Parasites-Champignons eucaryotes – monocellulaire Protozoaires (Paludisme..) – ou pluricellulaires: helminthes - Arthropodes

2 Existence de micro-organismes responsables d'infection Epidémies et moyens de lutte –Tableaux cliniques identiques –Transmission entre individus (Peste 25 millions de morts 1347 en Europe) Infection expérimentale –Agent infectieux responsable –Reproductibilité (Postulats de Koch 1884) Microscope optique –microscope 17ème s, coloration de Gram fin 19 ème s Microscopie électronique –Mise en évidence Virus (agents ultrafiltrables à travers filtres bactériens 0,25 μm)

3 Prions ou Agents Transmissibles Non Conventionnels Accumulation dans le système nerveux – encéphalopathie spongiforme Grande résistance aux protocoles de base de désinfection

4 Virus à symétrie hélicoïdale et cubique

5 Bactéries Microscopie électronique Microscopie optique Coloration de Gram

6 Champignons l Forme filamenteuse l Forme levure

7 Protozoaires

8 Ectoparasites

9 Taille des agents infectieux

10 Epidémies 20ème siècle Tuberculose Paludisme Amibiase Schistosomiase Filariose Rougeole HIV SIDA Poliomyélite Amérique du sud, Afrique et Asie 19ème siècle Variole Choléra Diphtérie Lèpre Tuberculose Typhoide Europe

11 Culture des Bactéries Génération spontanée? (Pasteur 1861) Chirurgie antiseptique (Lister 1867) Lavage mains et réduction fièvre puerpérale (Ignace Semmelweis 1847) Agents ultra-filtrables-Microscopie électronique

12 La majorité des micro-organismes ne sont pas pathogènes: notion de niche écologique Eaux douces, mer, résiduaires sols propres et contaminés Végétaux Animaux Homme: les flores l Cutanée l tube digestif autres muqueuses

13 Notion de Pathogénicité germes saprophytes –Danger 0Bénéfice Hôte (symbiose) germes commensaux –Danger +/-Bénéfice Hôte +/- (mutualisme) germes pathogènes –Danger +Bénéfice parasite (parasitisme) Flore « normale » ou flore de barrière à préserver Limiter au maximum le danger de la flore commensale Prévenir le contact ou la susceptibilité aux germes pathogènes

14 Comment les micro-organismes peuvent ils être responsable d'infection? Facteurs de virulence –Adhérence (infection urinaire) –Toxines (Choléra) –autres facteurs limitant les défenses de lorganisme ou favorisant la multiplication des germes.

15 Bactéries Chromosome Plasmide Flagelles Peptidoglycan Membrane externe (endotoxine) Adhésines

16 La microscopie électronique montre la structure type prokaryote

17 Prokaryotes et Eucaryotes ont une organisation cellulaire différentes

18 Présence d appendices externes caractéristiques: pili (fimbriae) et flagelles

19 La microscopie électronique révèle des différences anatomiques importantes entre Bactéries Gram + et Gram -

20 Classification des bactéries l Morphologie et coloration de Gram –Coques, bacilles, spirilles… –Gram+, Gram-, autres…. l Caractéres culturaux –Aérobie, anaérobie, microaérophiles –Exigences nutritionnelles –Profil biochimique l Génétique l Pathogénicité

21 Classification

22 Morphologie et colonisation

23

24 Différentiation des colonies

25 Pourquoi tous les individus ne font pas une infection? Immunité naturelle Immunité acquise les moyens de défense de l'organisme Mécaniques humoraux immunité cellulaire non spécifique immunité cellulaire spécifique Autres facteurs: fièvre-cytokines Nutrition

26 Immunité cellulaire non spécifique

27 Bactéries intra-cellulaires

28 Adhérence

29 Capsule et phagocytose: Streptococcus pneumoniae

30 Epidémiologie des infections Prévention –Hygiène-vaccination-Prévention transmission Traitement Nouveaux agents pathogènes –Adaptation- résistance aux antibiotiques = anciens agents –nouveaux agents


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