Classification évolutive Travaux pratiques et cas de la lignée verte Cours du 10/03/2016 Présentation: Hugo FONTES Conception : Hugo FONTES et Pierre CELLIER

Classification Définition : "Répartition systématique en classes, en catégories, d'êtres, de choses ou de notions ayant des caractères communs notamment afin d'en faciliter l'étude; résultat de cette opération" (CNRTL- CNRS)

Classification Mise en garde : Dans la nature il n'y a que des individus Classification = faire des ensembles argumentés, les nommer, rattacher des éléments dans ces ensembles Répond à un "cahier des charges préalablement fixé" Nomination d'attributs, de traits communs Notion de hiérarchie Clé de détermination = outil pratique Trier ≠ Classer ≠ Ranger

Classification Différents types de classifications : -> Ecologique Ex : les plantes aquatiques -> Architecturale Ex : modèles architecturaux -> Culinaires Ex : fruits, légumes Et bien d'autres...

Classification Ici, on parlera de classification évolutive → selon les degrés de parentés (= cahier des charges) De l'origine des espèces (Darwin 1859) : "L'arrangement des groupes dans chaque classe, d'après leurs relations et leur degré de subordination mutuelle, doit, pour être naturel, être rigoureusement généalogique"

Taxinomie Règle et étude de la classification + classification elle-même (Cronquist 1991) → ordonner la diversité, la comprendre Taxon : unité quelconque (genre, famille, espèce, sous-espèce, etc.) des classifications hiérarchiques des êtres vivants.

Comment classer ? Comparaison de caractères communs → on classe sur la base des ressemblances! Ex : comparaison de caractères morphologiques et anatomiques.

● Plus on se ressemble, plus on est proche parents ● La ressemblance traduit la parenté ● Donc, plus deux êtres possèdent de caractères communs, plus ils sont proches (évolutivement) → Méthode des distances Attention : traduit parfois plus les ressemblances que la parenté

Comment classer ? Comparaison de caractères communs → différenciation des caractères communs ancestraux et dérivés. Ex : les ailes des oiseaux et des chauves-souris Homologie ≠ Analogie Convergence morphologique

Les êtres les plus proches sont ceux qui partagent le plus de caractères ancestraux. Ici, le partage de mêmes caractères ne traduit pas de proximité évolutive si ces caractères sont dérivés. Hypothèse : au cours de l'évolution, le nombre de changements d'états de caractères est minimisé. → Méthode parcimonique

Comment classer ? Comparaison de différentes classifications (différents scénarios évolutifs) Vraisemblance d'un modèle selon probabilité d'un événement → méthode probabiliste La plus utilisée actuellement en phylogénie

Un peu de pratique ! Ateliers : Créer une classification sur la base d'une matrice de caractères

Créer un arbre sur la base d'une matrice de caractères Chêne Epicéa Polypode Pissenlit Fougère aigle

Créer un arbre sur la base d'une matrice de caractères Ulve Polytric Chêne Epicéa Polypode Pissenlit Fougère aigle

Créer un arbre sur la base d'une matrice de caractères Ulve Polytric Chêne Epicéa Polypode Pissenlit Fougère aigle

Créer un arbre sur la base d'une matrice de caractères Ulve Polytric Chêne Epicéa Polypode Pissenlit Fougère aigle

Créer un arbre sur la base d'une matrice de caractères Ulve Polytric Chêne Epicéa Polypode Pissenlit Fougère aigle

Créer un arbre sur la base d'une matrice de caractères Pigment vert Tige Feuilles nervurées Graines Fronde Ancêtre commun hypothétique Ulve Polytric Chêne Epicéa Polypode Pissenlit Fougère aigle

La phylogénie moléculaire Définition : la genèse (genesis) des lignées (phylum) + moléculaire → utilisation des séquences de l'ADN pour l'établissement d'une classification

Présentation de la classification moderne des “plantes“ ou lignée verte

Présentation de la classification moderne de la lignée verte

Attention ! Vision linéaire de l'évolution avec des êtres peu évolués et des êtres évolués : faux !

Attention ! Vision linéaire de l'évolution avec des êtres peu évolués et des êtres évolués : faux !

Attention ! Vision linéaire de l'évolution avec des êtres peu évolués et des êtres évolués : faux ! L'Homme ne descend pas du singe, l'Homme est un singe

Merci de votre Attention !

Quelques références bibliographiques : -Guillaume Lecointre, Hervé Le Guyader, Classification phylogénétique du vivant. -François VERNIER, Histoire de la systématique botanique. Floraine