PPD-Orsay-08/2014 Structure des populations et influence de l’aquaculture sur un bivalve exploité, la coquille Saint-Jacques (Pecten maximus) R. Morvezen, G. Charrier, P. Boudry, L. Chauvaud, F. Breton, Ø. Strand, J. Laroche © Daniel Vaulot

Introduction La coquille Saint-Jacques, Pecten maximus Caractéristiques principales -Mollusque bivalve -Benthique -Phase larvaire pélagique Larve de Pecten maximus Source : reproseed.eu Pecten maximus © Andy Pearson

Introduction La coquille Saint-Jacques, Pecten maximus Caractéristiques principales -Mollusque bivalve -Benthique -Phase larvaire pélagique -Intérêt économique (60 000T pêchées en 2009) ->Repeuplement en Rade de Brest (sea-ranching) Source : écloserie du Tinduff Pecten maximus © Andy Pearson

Introduction Distribution de Pecten maximus Espèce (?) proche Pecten jacobaeus Source : FAO

Introduction Etat de l’art en génétique des populations de P. maximus Technique Reference Allozymes Beaumont & Beveridge 1984 Beaumont et al., 1993 Mitochondrial DNA Wilding et al., 1997 Heipel et al., 1999 Ridgway & Dahle, 2000 Patry, 2005 RAPDs Heipel et al., 1998 Microsatellites Watts et al., 2005 Charrier et al. 2012 Hold et al. 2012 Hold et al. 2012, PhD (unpublished) Morvezen et al. 2013

Introduction Etat de l’art en génétique des populations de P. maximus Technique Reference Allozymes Beaumont & Beveridge 1984 Beaumont et al., 1993 Mitochondrial DNA Wilding et al., 1997 Heipel et al., 1999 Ridgway & Dahle, 2000 Patry, 2005 RAPDs Heipel et al., 1998 Microsatellites Watts et al., 2005 Charrier et al. 2012 Hold et al. 2012 Hold et al. 2012, PhD (unpublished) Morvezen et al. 2013

Introduction ADN mitochondrial Wilding et al. 1997 PCR-RFLP Φst = 0.0005 Pas de différence significative entre les populations

Introduction ADN mitochondrial Etude complétée par Ridgway & Dahle, (2000) : 2 Populations Norvégiennes : différence significative avec les données de Wilding et al.

Introduction Thèse de Nathalie Hold 12 Microsatellites tirés d’EST Fst = 0.012 (95% CI 0.008 – 0.015) Différenciation de la population Norvégienne et de la Méditerranée

Introduction Thèse de Nathalie Hold 12 Microsatellites tirés d’EST Fst = 0.012 (95% CI 0.008 – 0.015) Différenciation de la population Norvégienne et de la Méditerranée

Introduction Biologie des populations : Chauvaud et al. 2012 Plos ONE Existence de deux stratégies de croissance

Introduction Biologie des populations : Chauvaud et al. 2012 Plos ONE Existence de deux stratégies de croissance Discontinuité le long de l’aire de répartition

Echantillonnage Echantillonnage IRL 15 populations, Effectif : 24 < N < 48

Diversité allélique Latitude Baisse de diversité avec la latitude

Structure des populations Fst = 0.029*** MDS sur Fst linéarisé

Structure des populations Atlantique Norvège Méditerranée Fst = 0.029*** MDS sur Fst linéarisé

Structure des populations Echantillonnage - Barrière au flux de gènes en mer du Nord (fosse Norvégienne ?) IRL

Structure des populations Echantillonnage - Barrière au flux de gènes en mer du Nord (fosse Norvégienne ?) -Isolement par la distance significatif en Norvège : trace de la colonisation + effet de la courantologie ? IRL

Structure des populations Echantillonnage - Barrière au flux de gènes en mer du Nord (fosse Norvégienne ?) -Isolement par la distance significatif en Norvège : trace de la colonisation + effet de la courantologie ? -Un ou deux refuges glaciaires ? IRL

Structure des populations Echantillonnage - Barrière au flux de gènes en mer du Nord (fosse Norvégienne ?) -Isolement par la distance significatif en Norvège : trace de la colonisation + effet de la courantologie ? -Un ou deux refuges glaciaires ? -Migration pas à pas entre les populations du groupe Atlantique ? IRL

Génétique vs phénotypes Chauvaud et al. 2012 Plos ONE IRL Bonne correspondance globale entre la génétique et les phénotypes Situation autour des îles britanniques à confirmer (Hold et al. 2012)

Influence du repeuplement L’aquaculture de Pecten maximus Source : CLPMEM Débarquements de Coquille Saint-Jacques en rade de Brest 2/3 de la production de la rade est issue de l'écloserie (données 2007)

Influence du repeuplement Nombre de juvéniles de P. maximus semés en Rade de Brest par an Source : écloserie du Tinduff Rade de Brest : seul site considéré comme pouvant être impacté par des activités aquacoles. (Beaumont & Gjedrem, 2006)

Influence du repeuplement Latitude Pas de perte de diversité détectée en Rade de Brest -Bonnes pratiques d’écloserie ? -Flux de gènes ? -Faible contribution des semis à la reproduction par rapport à la population naturelle ? 24

Pecten jacobaeus -Diversité comparable aux populations atlantiques de P. maximus -Pas de problème de transfert des marqueurs entre espèces Différenciation marquée mais du même ordre de grandeur que la différenciation des deux groupes de population de P. maximus Résultat conforme à la littérature : Wilding et al. 1999, Saavedra & Peña 2005, Hold et al. 2012,

Conclusions Structure des populations de P. maximus -Confirmation de l’existence de deux groupes génétiques de populations Influence de l’aquaculture en rade de Brest -Pas d’impact détecté, mais étude plus approfondie nécessaire Pecten jacobaeus -Confortation de la non séparation en deux espèces

Merci de votre attention © Daniel Vaulot Photo : Keith Hiscock, www.marlin.ac.uk

Annexe Perspectives Perspectives Double anneau Issue de la reproduction dans le milieu naturel Issue de la reproduction en écloserie

Annexe Perspectives Perspectives Perspectives Perspectives Double anneau Issue de la reproduction dans le milieu naturel Issue de la reproduction en écloserie Partiellement confirmé par des méthodes génétiques

Annexe Ecloserie du Tinduff : géniteurs utilisés en 2007 (n = 49) Carte : © Google maps Ecloserie du Tinduff : géniteurs utilisés en 2007 (n = 49) Roscanvel : Population naturelle (n = 94) Le Fret : Production de l’écloserie (n = 55) L’Auberlac’h : Production de l’écloserie (n = 88) 30

Annexe Frères Individus 31

Annexe Croissance journalière 32

Annexe Croissance journalière : Plymouth Chauvaud et al. 2012 Plos ONE 33

Annexe Chauvaud et al. 2012 Plos ONE 34

Annexe Chauvaud et al. 2012 Plos ONE 35