Les Grandes Fonctions de l’organisme Généralités
Pouvez-vous donner une définition de la Physiologie? R: La Physiologie est l’étude du rôle des différentes fonctions de l’organisme dans le maintien de la vie
Physiologie Étude du fonctionnement des organismes vivants. Anatomie Étude des structures constituant les organismes vivants
1 - Principes de bases et niveaux d’organisation structurale : Corps humain = système ouvert avec un milieu interne doit se protéger des perturbations de l’environnement, dépendant de l’environnement (échanges de chaleur, d’O2, de nutriments, de déchets et d’information) Le corps humain comprend différents niveaux d’organisation structurale reliés de différentes façons :
le niveau chimique : le plus élémentaire de l’organisation: atomes et molécules essentiels au maintien de la vie (C, H, O, N, Ca, K et Na). Les combinaisons d’atomes forment des molécules (protéines, glucides, lipides, vitamines…).
le niveau cellulaire : Groupement de molécules: cellules = unités structurales et fonctionnelles d’un organisme (cellules sanguines, musculaires, nerveuses…). contient des structures spécialisées (organites) qui remplissent une fonction déterminée.
le niveau tissulaire : groupes de cellules semblables = tissus 4 types fondamentaux de tissus du corps : tissus épithélial, musculaire, conjonctif et nerveux.
le niveau organique : jonction de différents types de tissus = organe fonctions définies et de forme reconnaissable
le niveau systémique : ensemble d’organes = système ou appareil Fonction
Muscle (organe) Fibre (cellule) musculaire Myofibrille (organite complexe constitué de groupe de filaments) Sarcomère (unité contractile → myofibrille= sarcomères en série) Myofilaments de myosine et d’actine (molécules)
Système digestif Epithélium gastrique (tissu) Cellule pariétale Molécules secrétées Estomac (organe du tube digestif)
Système nerveux Contrôle de l’ensemble des fonctions
Système musculaire Mouvement Production de chaleur
Système cardio-vasculaire Transport : - gaz (O2, CO2) - nutriments - déchets
Système cardio-vasculaire
Système respiratoire Oxygénation du sang Évacuation du gaz carbonique
Système endocrinien Sécrétion d’hormones: - contrôle de la glycémie - contrôle de la reproduction - contrôle de la croissance - …..
Système osseux Soutien et protection des organes Charpente sur laquelle agissent les muscles Érythropoïèse
Système tégumentaire Protection des tissus internes
Système lymphatique et immunitaire Défense de l’organisme contre l’agression
Système digestif Dégradation des aliments Approvisionnement sanguin en nutriments Élimination des déchets
Système urinaire Élimination des déchets azotés Régulation de l’équilibre hydrique, électrolytique et acido-basique.
Système génital Reproduction
Interaction entre les systèmes
2- Les processus vitaux : le métabolisme : somme de tous les processus chimiques qui s’effectuent dans le corps catabolisme (dégradation de molécule) : fournit l’énergie anabolisme (synthèse) utilise l’énergie du catabolisme Ex: métabolisme des protéines
la faculté de réponse : aptitude à détecter et à réagir aux milieux externe et interne. cellules spécifiques (capteurs) Ex: Pancréas
le mouvement : du corps, des organes, des cellules isolées, des organites cellulaires. Ex: Contraction musculaire permet le déplacement d’un organe et du corps. Mouvement des globules blancs
la croissance : Augmentation en taille (dimension) et en complexité. Due à une augmentation du nombre (hyperplasie) et/ou de la taille des cellules (hypertrophie).
la différentiation : changement par lequel les cellules non spécialisées deviennent spécialisées. Ex : lignée érythroïde
la reproduction : formation de nouvelles cellules destinées à la croissance, à la réparation ou au remplacement, production d’un être nouveau.
3 - L’homéostasie : le maintien des limites physiologiques : Cellules : besoin d’un état relativement stable pour fonctionner efficacement = homéostasie. homéostasie perturbée de manière chronique = pathologie Pour survie des cellules composition des liquides extracellulaires et intracellulaires doit varier le moins possible autour de constantes physiologiques
Trois compartiments liquidiens Plasma (intravasculaire) Liquide interstitiel (entre les cellules)(extravasculaire - extracellulaire) Liquide intracellulaire = cytosol (liquide présent à l’intérieur de la cellule).
Milieu interne et homéostasie substances dissoutes dans l’eau des liquides extracellulaire et intracellulaire : gaz, nutriments et ions nécessaires au maintien de la vie. Homéostasie lorsque son milieu interne : contient la concentration optimale de gaz, de nutriments, d’ions et d’eau, a une température optimale, a un volume optimal pour la santé des cellules.
Le Stress Stress = perturbateur de l’homéostasie déséquilibre interne Stress systémique Stress neurogénique
Mécanismes régulateurs d’homéostasie s’opposent aux forces du stress rééquilibrer le milieu intérieur Ex de la T° centrale
Régulation de l’homéostasie par les systèmes nerveux et endocrinien SN : décele l’état de déséquilibre, et envoyant des messages Ex : La concentration sanguine en oxygène Système endocrinien : moins rapide (glandes hormones) Ex: Glycémie
Systèmes ou boucles de rétroaction : Un système de rétroaction comprend 3 composantes fondamentales : un récepteur un centre de régulation un effecteur Le récepteur capte/mesure changements d’homéostasie + envoie l’info centre de régulation. Centre de régulation : détermine le point auquel un certain aspect corporel appelé état contrôlé ou régulé doit être maintenu Ex: FC, FV, pH, glycémie, T° L’effecteur produit une réaction en réponse à centre de régulation Ex : Thermostat
3. L’homéostasie : le maintien des limites physiologiques Un certain stimulus (stress) perturbe l’homéostasie dans un état contrôlé qui est surveillé par les Composantes d’un système de rétroaction récepteurs qui envoient de l’ Retour à l’homéostasie quand la réaction ramène l’état contrôlé à la normale information à un centre de régulation qui reçoit l’information et fournit une réponse au effecteurs qui provoquent un changement ou une réaction qui modifie l’état contrôlé
Ex: Régulation de la température centrale
4- Le niveau d’organisation chimique Les éléments chimiques : 109 éléments chimiques dont 92 naturels.
Corps humain: 26 des 92 éléments naturels. O, C, H et N = 96% de la masse corporelle Ca, P, K, S, Na, Cl, Fe, I et magnésium = 3,9%
Conservation des éléments Pas d’apparition ni de perte d'éléments
Les composés chimiques et la synthèse protéique
Les composés chimiques et la synthèse protéique Composés inorganiques : habituellement pas de carbone (C): H2O, O2, CO2 et de nombreux sels, acides et bases. Composés organiques : contiennent toujours du carbone (C) et de l’hydrogène (H) Chaînes de carbone = support de nombreuses substances des cellules vivantes glucides (CHO), lipides, protéines, acides nucléiques ATP (adénosine triphosphate)
1 - Les composés inorganiques L’eau constitue 60% des globules rouges, 75% du tissu musculaire et 92% du plasma sanguin différentes fonctions essentielles : solvant et milieu de suspension excellent l’eau participe aux réactions chimiques l’eau absorbe et libère la chaleur très lentement l’eau a besoin d’une grande quantité de chaleur pour passer d’un état liquide à un état gazeux L’eau sert de lubrifiant
maintien du pH : les systèmes tampons pH doit rester dans des normes physiologiques (homéostasie) Sang: 7.35 < pH < 7.45 Urine: 4.6 < pH < 8.0) Suc gastrique 1.2 < pH < 3.0. Régulation du pH grâce aux systèmes tampons. Système tampon: convertit bases ou acides forts en bases ou acides faibles
2 - Les composés organiques CHO et parfois soufre (S) et phosphore (P). bonne source d’énergie Qui peuvent s’unir entre elles (polymères) Qui peuvent être dégradées (hydrolyse)
A- Les glucides (CnH2nOn) 2 à 3% du poids corporel total Principale fonction : fournir de l’énergie (ATP) rapidement en vue de produire des réactions métaboliques. peuvent servir à former des réserves nutritives (glycogène hépatique). 3 groupes principaux : les monosaccharides : 3 à 7 C les disaccharides les polysaccharides
B- Les lipides : 25% du poids chez des adultes maigres CHO, mais rapport H/O est différent de 2/1 la plupart des lipides sont insolubles dans l’eau (hydrophobes) ne peuvent circuler librement dans le sang qui est aqueux Transport dans le sang en s’unissant à des protéines lipoprotéines hydrosolubles
Les familles de lipides Plusieurs familles: Triglycérides Phospholipides Stéroïdes Autres lipides
Triglycérides (TG) ou graisses neutres Un TG = glycérol + acides gras.
Triglycérides (TG) ou graisses neutres les plus abondants dans le corps et les régimes alimentaires la + grande source d’énergie chimique Une molécule de glycérol = 3 atomes C = support des TG. A chacun de ces atomes C, est fixé un acide gras par des réactions de synthèse par déshydratation. Hydrolyse d’un TG glycérol et des acides gras.
Les graisses saturées = TG qui contiennent que des liaisons covalentes entre les atomes de C des acides gras. Chaque C lié au nombre maximal de H (AG saturé en H) TG renfermant de nombreux acides gras saturés tissus animaux.
Les graisses monoinsaturées contiennent une double liaison covalente entre deux atomes C : elles ne sont donc pas complètement saturées d’atomes H huile d’olive et d’arachide : riches en TG assortis d’acides gras monoinsaturées.
Les graisses polyinsaturées contiennent plus d’une double liaison covalente entre les atomes C des acides gras. huiles de maïs, de tournesol, de sésame, de soja pourcentage élevé d’acides gras polyinsaturés.
Localisation des TG Tissus adipeux sous-cutané (adipocyte) ou autour de certains organes Protection, isolation Réserve d’énergie
Les Phospholipides Support de glycérol (idem TG) 2 AG fixés aux deux premiers C un groupement phosphate (PO43-) + un groupement azoté liés au 3ème C = tête Tête polaire (peut se lier à l’eau) Les 2 AG: non polaires (ne peuvent interagir qu’avec d’autres lipides).
Localisation des phospholipides membrane de chaque cellule = bicouche lipidique composée de phospholipides alignés par les queues en double rang Transport des lipides dans le plasma
Les stéroïdes Formés à partir du cholestérol
hormones sexuelles (testostérone, oestrogènes, progestérone) Hormones corticosurrénales: cortisol (contrôle glycémie), aldostérone (régulation des sels et de l’eau) sels biliaires : synthétisé par le foie; favorise digestion et absorption des graisses vitamine D: synthétisée dans la peau sous l’effet des UV ; joue un rôle dans la croissance osseuse
non polaires et liposolubles Pas seulement athérosclérose : 4 anneaux d’atomes de C non polaires et liposolubles Pas seulement athérosclérose : composant des membranes cellulaires sert de produit de départ en vue des la synthèse d’autres stéroïdes vitaux
Vitamines Liposolubles A : pigment photorécepteur de la rétine E : anti-radicalaire K : sert à la coagulation sanguine
Lipoprotéines Ensemble formé de lipides et de protéines; Sert au transport des AG et du cholestérol dans le sang (Ex : HDL, LDL)
C-Les protéines 12 à 18% de protéines dans un corps ordinaire et maigre. structure plus complexe et fonctions plus variées que celles des glucides ou des lipides.
Rôle des protéines Structural = matériaux de base cellulaires collagène dans l’os kératine dans la peau, les cheveux et les ongles Transport transport de l’O2 par l’hémoglobine, Glut et le glucose, …
Rôle des protéines Physiologiques : enzymes catalysent (accélèrent) la plupart des réactions chimiques ATPase, enzymes du cycle de krebs, lipase, d’autres protéines fournissent le mécanisme nécessaire dans la contraction musculaire (myosine, actine).
Rôle des protéines anticorps (immunoglobulines) = protéines de défenses contre les microbes. Contrôle de l’homéostasie hormones : érythropoïétine, insuline… Albumine (régulation du pH)
Composition des protéines contiennent toujours du C, H, O et N. Parfois aussi du S. 1 protéine = assemblage de plusieurs acides aminés 20 types d’acides aminés qui comprennent toujours : un groupement amine (-NH2), un groupement carboxyle (acide) (-COOH) et une chaîne latérale (groupement R).
Formation d’une protéine un acide aminé s’unit à un deuxième, puis un troisième s’ajoute aux deux premiers…. La liaison entre chaque paire d’acides aminés s’appelle la liaison peptidique (entre le groupement carboxyle d’un acide aminé et le groupement amine d’un autre acide aminé) dipeptide, tripeptide, …, polypeptide. Une protéine peut être former de plusieurs chaînes polypeptidiques (l’hémoglobine en a 4).
Protéine en milieu hostile (pH modifiée, température modifiée…): se dénature et perdre sa forme caractéristique perte de fonctionnalité Exemple : la cuisson de l’œuf
Le cas des enzymes spécifiques (hexokinase, phosphofructokinase, …) Associée à un substrat catalyse conditions optimales pour l’efficacité d’une enzyme Certaines enzymes ont besoin de cofacteurs ou de coenzymes afin de fonctionner efficacement.
D - Les acides nucléiques dans les noyaux des cellules Sont composés de C, O, H, N, P
2 types: ADN : acide désoxyribonucléique ARN : acide ribonucléique code génétique de la cellule gène = segment d’une molécule d’ADN = régule la synthèse protéique ARN : acide ribonucléique transmet les directives reçues des gènes afin de guider chaque assemblage d’acides aminés en protéines dans la cellule
Unité de base : nucléotide ADN = assemblage de nucléotides 1 nucléotide = assemblage de 3 composants: Base azotée Un pentose (désoxyribose) Un groupement phosphate 5 bases azotées: Adénine & Thymine, Guanine & Cytosine, Uracile
Un acide nucléique
L’ADN
La synthèse protéique A partir de l’ADN sur les ribosomes dépend de la collaboration de plusieurs classes d’ARN et nécessite une série d’étapes préalables. gène (une section de la molécule d'ADN) sert de matrice pour la synthèse d'une protéine. 2 phases : Transcription Traduction.
La transcription un morceau particulier d'ARN (ARN messager (ARNm)) est construit à l'aide d'une séquence génétique particulière comme matrice. Des enzymes déroulent une partie de l'hélice d'ADN et rompent les liaisons entre les paires de base complémentaires Un brin complémentaire d'ARN messager est synthétisé, utilisant comme matrice l'un des brins de l'ADN non déroulés.
une fois que l'ARN messager complémentaire est formé, le segment d'ADN reprend sa forme originale création d'une molécule d'ARN messager complémentaire à une section donnée d'ADN (qui constitue un gène). ARN messager libre de sortir du noyau par les pores de la membrane nucléaire vers le cytosol pour être traduit
La traduction Chaque séquence de trois bases d'ARN messager code pour un acide aminé particulier. Ribosomes : s'attachent au brin d'ARN messager descendent, « lisant » ainsi la séquence de nucléotides et reconstituant la protéine adéquate à mesure qu'ils se déplacent. ARN de transfert (ARNt) transporte les divers acides aminés et ARNr (ribosomal).
Triplet de nucléotides : code pour un acide aminé = codon
5- La cellule
Si une cellule animale avait la taille d'un immeuble de six logements 1 µm = 1/1000 mm 1 nm = 1/1000 µm Virus (50 à 100 nm) Protéine ~ 3 nm Bactérie (2 µm)
Surface de la peau (grenouille) Tous les tissus végétaux ou animaux sont faits de petites unités: les cellules Surface de la peau (grenouille) cellule On connaît près de 200 types différents de cellules dans le corps humain. Chaque type remplit une fonction précise.
La théorie cellulaire Tous les êtres vivants sont faits de cellules (au moins une cellule). La cellule est l'unité de base du vivant. Toute cellule provient d'une autre cellule Un être humain contient quelque chose comme 100 000 milliards de cellules (1014). Chacune de ces cellules est un être vivant.
Trois concepts découlent de la théorie cellulaire: 1. Unité du vivant 2. Homéostasie 3. Il n'y a pas de limite entre la vie et la mort
1. Unité du vivant Les cellules de tous les êtres vivants sont très semblables les unes par rapport aux autres. Au niveau microscopique, il n'y a que très peu de différences entre les espèces. Le fonctionnement des cellules change peu d'une espèce à l'autre.
2. Homéostasie Les cellules ne peuvent survivre que si le milieu dans lequel elles baignent demeure stable. Elles ne tolèrent que très peu de changement (sauf rares exceptions). Demeurer en vie = maintenir son homéostasie. Homéostasie = Propriété des êtres vivants à maintenir leur milieu interne STABLE
Doit demeurer le plus constant possible
3. Il n'y a pas de limite entre la vie et la mort La vie se définit au niveau cellulaire. Qu'est-ce qu'une cellule vivante? À quel moment peut-on dire qu'un pluricellulaire est mort?
Noyau Centre de contrôle de la cellule Cytoplasme Lieu de la plupart des activités cellulaires Membrane plasmique (cytoplasme) Contrôle le passage des substances vers la cellule et en dehors de la cellule
Le noyau Contient l’ADN Pratiquement tout l’ADN est entouré par une membrane nucléaire. ADN: organisé en chromosomes séparés Dans une cellule humaine, il existe 23 paires de chromosomes (46 chromosomes).
NUCLÉOPLASME Liquide semi- visqueux (eau, sels, protéines solubles, sucres, etc.). Fournit un milieu favorable à l'activité du noyau CHROMATINE Matériel génétique : ADN et protéines. NUCLÉOLE Un ou plusieurs. Formé d'ADN nucléolaire, d'ARN ribosomique et de protéines. Lieu de l'assemblage des ribosomes. MEMBRANE NUCLÉAIRE Double, séparée par un espace, percée de pores, en continuité avec la membrane du REG. Contrôle les échanges entre le noyau et le cytoplasme
Le cytoplasme = CYTOSOL Liquide semi-visqueux (eau, ions, protéines, sucres…) Fournit un milieu favorable à l'activité cellulaire ORGANITES MEMBRANEUX RÉTICULUM ENDOPLASMIQUE GRANULEUX (REG) RÉTICULUM ENDOPLASMIQUE LISSE (REL) APPAREIL DE GOLGI (AG) VACUOLES NUTRITIVES ET VÉSICULES LYSOSOMES MITOCHONDRIES PEROXYSOMES
Les organites de la cellule animale
Le réticulum endoplasmique granuleux (REG) Réseau membraneux de tubules et de sacs applatis Granules = ribosomes 2 rôles principaux Produire des vésicules de transition destinées à l'AG (assemblage des glycoprotéines et emballage) Produire des membranes internes et des vésicules de membrane
Un rôle du REG : produire des vésicules de transition Le REG capte les protéines que les ribosomes accrochés à sa membrane fabriquent. Le REG sucre ces protéines. Le REG emballe ces protéines sucrées (glycoprotéines) dans des vésicules de transition qui se dirigent vers l'appareil de Golgi.
Un rôle du REG : produire des membranes
Le réticulum endoplasmique lisse (REL) Réseau membraneux de tubules et de sacs applatis (pas de ribosomes) Plusieurs rôles Synthétiser des lipides Détoxiquer les médicaments et les autres drogues Produire des membranes internes et des vésicules de membranes Libérer le glucose vers le sang (cellules hépatiques) Accumuler des ions Ca+ (cellules musculaires)
L'appareil de Golgi (AG) Empilement de saccules membraneux
Deux rôles principaux Modifier les protéines qu'il reçoit Trier ces protéines et les emballer dans les vésicules de sécrétion ou dans les lysosomes.
Contenu des vésicules : Vésicules de sécrétion (venant de AG) fusionnent avec la membrane plasmique et déversent leur contenu à l'extérieur de la cellule. Contenu des vésicules : hormones enzymes des molécules structurantes
Les vacuoles nutritives Issue de la phagocytose. Par évagination de la membrane. Rôle Permet l'absorption de grosses particules par la cellule, telle une bactérie.
Les vésicules de pinocytose Par invagination de la membrane. Contient des gouttelettes et des électrolytes. Rôle Permettre l'absorption de gros ions fortement chargés
Les lysosomes Vésicule remplie d'enzymes Provient de AG et parfois directement du REG. Rôles Digérer le contenu des vacuoles et des vésicules. Digérer les vieux organites cellulaires.
La mitochondrie 2 membranes. Rôle Lieu essentiel de la respiration cellulaire, le processus métabolique qui permet de dégrader les substrats grâce à l'oxygène afin de produire de l'ATP (la source d'énergie principale de la cellule).
ATP ou adénosine triphosphate L'ATP est fabriqué en de multiples exemplaires par les mitochondries. Rôle de l'ATP Source d'énergie pour la plupart des réactions cellulaires qui l'exigent.
La membrane plasmique 2 couches de lipides dans lesquelles sont insérées des protéines Des sucres s'attachent à la surface externe de la membrane.
Rôles généraux Délimite la cellule de son environnement. Contrôle les échanges cellulaires avec le milieu via les phénomènes membranaires Permet aux cellules de se reconnaître entre elles et de s'aggréger en tissus (grâce aux sucres de surface) Permet le déclenchement du processus immunitaire.
Pour régler ces mécanismes, les cellules doivent communiquer entre elles
Transport membranaire Nos cellules baignent dans un liquide extracellulaire (liquide interstitiel) AA , AG, sucres, vitam., hormones, neurotransmetteurs , sels et déchets Chaque cellule doit prendre dans ce liquide les substances dont elle a besoin et empêcher l'entrée des substances excédentaires Membrane = barrière à perméabilité sélective ou différentielle, c'est‑à‑dire qu'elle ne laisse passer que certaines substances, en excluant de nombreux produits indésirables (cellule endommagée barrière perméable)
Transport membranaire 2 types de mouvement à travers la membrane plasmique : - actif (la cellule dépense une énergie métabolique (ATP) pour transporter la substance en question à travers la membrane) - passif (les molécules traversent la membrane sans que la cellule fournisse d'énergie).
Mécanismes passifs: diffusion rôle important dans toutes les cellules de l'organisme La diffusion est la tendance qu'ont les molécules et les ions à se répandre dans l'environnement : les molécules vont des endroits où leur concentration est forte vers les endroits où leur concentration est plus faible on dit qu'elles diffusent suivant leur gradient de concentration. Plus la différence de concentration entre deux endroits est élevée, plus le mouvement net de diffusion des particules est important.
Diffusion passive 2 types: - diffusion simple (substances non polaires ou liposolubles) : pour solvants = osmose - diffusion facilitée
Diffusion simple substances non polaires et liposolubles diffusent directement à travers la bicouche lipidique (02, CO2, graisses, alcool) substances polaires (chargées) diffusent par pores certains pores sont toujours ouverts, alors que d'autres sont munis d'une porte qu'ils peuvent ouvrir ou fermer en réponse à divers signaux chimiques ou électriques
Diffusion simple
Osmose Comme l'eau est fortement polaire, elle ne peut pas traverser la bicouche lipidique, mais elle peut passer facilement dans les pores L'osmose a lieu quand la concentration d'eau n'est pas la même des deux côtés d'une membrane Osmolarité : concentration totale de toutes les particules d’une solution
Différences d’osmolarité diffusion pour égalité de concentrations
Diffusion facilitée glucose = non liposolubles et trop volumineux pour passer par les pores de la membrane plasmique traverse celle‑ci très rapidement grâce à la diffusion facilitée combinaison à des transporteurs protéiques présents dans la membrane plasmique Diffusion facilitée = extrêmement sélective
Diffusion facilitée
Mécanismes actif: Dans tous les cas où la cellule consomme l'énergie qu'elle contient sous forme d'ATP pour faire passer des substances à travers la membrane 2 principaux mécanismes actifs : transport actif transport vésiculaire
Transport actif = pompage ; ressemble à la diffusion facilitée (transporteurs protéiques spécifiques) déplace les solutés (acides aminés et ions) « à contre‑courant », c'est‑à‑dire contre leur gradient de concentration consommation d'énergie (ATP) Souvent couplés
Pompe NA+ - K+
Transport vésiculaire (en vrac) 2 principaux modes : exocytose et endocytose. Exocytose = passage de substances de l'intérieur de la cellule à l'espace extracellulaire (sécrétion d'hormones, libération de neurotransmetteurs, élimination des déchets) sac membraneux (vésicule) qui migre vers la membrane plasmique, fusionne avec elle et déverse son contenu à l'extérieur de la cellule
Exocytose
Transport vésiculaire (en vrac) Endocytose : macromolécules qui entrent dans la cellule invagination de la membrane plasmique 3 formes d'endocytose: phagocytose (macrophages) pinocytose (toutes les cellules) endocytose par récepteurs interposés
Endocytose
Qu’est-ce que le milieu intérieur? Le milieu intérieur du corps est constitué par le liquide extracellulaire dans lequel baignent toutes les cellules.
Quels sont les échanges cellulaires indispensables à la vie de la cellule entre le liquide intracellulaire et le milieu extracellulaire? Pour assurer son activité métabolique basale, la cellule doit synthétiser de l'ATP à partir de la dégradation de nutriments prélevés dans le milieu extracellulaire. Ces nutriments sont des substrats énergétiques (glucides, lipides), des acides aminés nécessaires à la biosynthèse des protéines cellulaires. Le catabolisme aérobie exige de l'oxygène prélevé dans le milieu extracellulaire. A l'inverse, les déchets produits par la cellule tels que le C02 sont rejetés dans le milieu extra‑cellulaire.