Axe Transversal Interactions Durables (ID)

Une forte implication du laboratoire 1/3 du potentiel de recherche 1/4 des publications 1/3 des programmes Un ensemble de responsabilité au niveau national (prog. AFSSA, INSERM, GDR, GDRE, comité de pilotage et animation de groupes de réflexion du REID…) Une offre d’enseignement importante et renouvelée (UE ID en M1, Epidémiologie en M2…) Répartie équitablement dans les trois départements

= une nouvelle unité fonctionnelle Des systèmes où la complexité est l’objet d’étude Deux organismes Un phénotype = une nouvelle unité fonctionnelle

symbiote Co-évolution Hôte Environnement Analyse génomique (séquences et bio-info) Epidémiologie (suivis de populations et modélisation) Dynamique co-évolutive (Expérimentation, modélisation, Co-Phylogénie) Analyse fonctionnelle (quantification, post-génomique) Hôte symbiote Co-évolution cellule individu Infra-population population Transmission génome Environnement

Transferts et pertes de gènes Identification Structure du génome Transposition Transferts et pertes de gènes symbiote cellule individu population Infra-population Transmission génome Co-évolution Hôte Environnement

Interactions moléculaires et cellulaires Régulation (immunité…) Mécanismes et expresssion du phénotype étendu Hôte symbiote Co-évolution cellule individu population Infra-population Transmission génome Environnement

Conséquences du phénotype étendu Comportements Epidémiologie Conséquences du phénotype étendu Comportements Dynamique des populations Hôte symbiote Co-évolution cellule individu population Infra-population Transmission génome Environnement

Gestion (relation médecine-écologie) Transitions parasitisme-mutualisme Hôte symbiote Co-évolution cellule individu population Infra-population Transmission génome Environnement

Adaptation locale (interaction GxGxE/spécialisation) Émergence (perturbations environnementales / stochasticité) Hôte symbiote Co-évolution cellule individu population Infra-population Transmission génome Environnement

Les systèmes en poupées russes Hôte symbiote Co-évolution cellule individu population Infra-population Transmission génome Hôte symbiote Co-évolution génome individu Infra-population population Transmission cellule Environnement

Les cycles complexes et les réservoirs cellule individu population génome Hôte Co-évolution symbiote cellule individu population Infra-population Transmission génome Co-évolution Hôte Environnement

Objectif de l’axe ID Renforcer les interactions La démarche intégrative Quels mécanismes sont en jeu ? Sous quelles pressions de sélection se mettent-ils en place et quelles contraintes imposent-ils ? La démarche comparative Des modèles qui couvrent toute une gamme de type d’interactions

Impact individuel et populationnel Le compartiment intra-hôte Eléments transposables HIV/FIV Symbioses chez les insectes Mécanismes et conséquences génomiques Régulation Impact individuel et populationnel symbiote génome Infra-population Transmission Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement

Le compartiment intra-hôte - Listeria Toxoplasmose Pestivirose Eléments transposables HIV/FIV Symbioses chez les insectes Compétition/coopération Favorisation Transferts de gènes Mécanismes d’interactions Impact individuel et populationnel symbiote génome Infra-communauté Transmission Co-évolution génome cellule individu population Hôte Environnement

Fonctionnement de l’axe ID Journées thématiques intra-labo Dynamique intra-hôte, multi-infections et ID Comportement et ID Biologie Moléculaire, Génomique et post-génomique des ID … Actions ciblées « P(ID)2 » (Programmes Interactions Durables Inter-Départements) Financements Co-directions