Tableaux croisés dynamiques sous Excel: des outils simples pour une analyse rapide de jeux de données en cytométrie Camille SANTA MARIA Ingénieur d’étude Samuel GRANJEAUD Ingénieur de recherche Herve LUCHE, PhD R&D manager

Qu’est ce qu’un Tableau Croisé Dynamique ? Un tableau croisé dynamique est un outil Excel permettant de réaliser rapidement des tableaux de synthèse sur des volumes de données importants. Gérer un grand nombre de données Agréger les valeurs sous forme de somme, moyenne, écart-type… Combiner métadonnées et statistiques Trier, filtrer et modifier les données rapidement Utiliser pour la visualisation graphique

L’objectif est de passer rapidement de données brutes au format CSV à des graphes interprétables facilement

Les tableaux croisés dynamiques Sommaire Les tableaux croisés dynamiques Métadonnées Statistiques Récapitulatif (métadonnées + statistiques) Création Tableaux et graphiques croisés dynamiques Le module Tableau L’outil IMPACT

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Informations caractéristiques de nos échantillons Les métadonnées Informations caractéristiques de nos échantillons Numéro d’échantillon, âge, sexe, poids, identification du patient… Varient à chaque expérience Nécessaire pour l’analyse, associés aux statistiques correspondants à chaque échantillon

Organiser les métadonnées Mettre sous forme de tableau Organiser les métadonnées dans l’ordre de l’acquisition

Organiser les métadonnées Rappel facilité des informations : Le Gestionnaire de noms permet de rappeler aisément les données depuis n’importe quelle table, à partir du nom de la colonne. Les données seront retranscrites à la même ligne que dans le tableau source. ! Le gestionnaire des noms ne lit pas les « + » et « - », pensez à les remplacer par des « pos » et «  neg »

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Ajouter les statistiques brutes Concerne les statistiques extraites de l’analyse (fichier au format .csv) Créer un nouveau classeur Coller les statistiques extraites de l’analyse Le mettre sous forme de tableau Enregistrer les noms comme précédemment

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Regrouper métadonnées et statistiques Indispensable à la création du TCD 1ere ligne : rentrer les noms manuellement A partir de la 2ème ligne : taper le début du nom de la colonne souhaitée (Gestionnaire des noms) Rentrer colonne « commentaire » pour filtrer les tube à ne pas conserver par la suite

Regrouper métadonnées et statistiques Indispensable à la création du TCD Grouper les métadonnées et les statistiques. Rappeler facilement les informations grâce au Gestionnaire de noms Organiser les données Faire des calculs Possibilité de créer une colonne « commentaire » pour annoter les tubes anormaux peut être utile pour les ex-filtrer par la suite Pour créer un TCD il faut un tableau à simples entrées

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Créer un tableau croisé dynamique Il est maintenant possible de créer le tableau croisé dynamique Sélectionner le tableau qui regroupe métadonnées et statistiques et cliquer sur « TblCroiséDynamique » dans l’onglet « Insertion » Les valeurs ne s’actualisent pas automatiquement, penser à cliquer sur « actualiser tout » après chaque modification

Créer un tableau croisé dynamique Cette page s’affiche. Il faut maintenant sélectionner les données à afficher

Créer un tableau croisé dynamique Eléments à filtrer Eléments à classer en colonne Valeurs à étudier dans le tableau (Somme, moyenne, écart-type…) Eléments à classer en ligne (paramètres) Le tableau croisé dynamique va se construire automatiquement au fur et à mesure que vous ajouterez des champs

Créer un tableau croisé dynamique

Tableaux croisés dynamiques : le champs valeurs Permet le choix des valeurs à étudier. Par défaut, la somme sera affichée lorsqu’il n’y aura que des valeurs numériques. Pour modification, clique droit, paramètres des champs de valeurs, et sélectionner le type de calcul.

Tableaux croisés dynamiques : le champs filtre Le filtre permet de ne visualiser qu’une partie des éléments d’une catégorie (par exemple filtrer la catégorie « comment  ») Avec les filtres, vous pouvez éliminer de votre analyse les échantillons pour lesquels vous avez entré un commentaire

Le Tableau croisé dynamique obtenu

Les graphes croisés dynamiques Après création TCD visualiser ces données en graphique Il est également possible de créer directement un graphique croisé dynamique

Les graphes croisés dynamiques Manip 2 Manip 1

Les segments : un moyen rapide de filtrer les données Les segments sont un autre moyen de filtrer les données. Ils peuvent être particulièrement utiles pour les graphes : permet de visualiser successivement différents groupes très aisément. Disponible à partir de la version Excel 2010

Transformer les valeurs En cliquant sur une valeur vous pouvez sélectionner une autre manière d’afficher les valeurs. Peut être utile pour une comparaison (« différence en % par rapport… ») En double cliquant sur une valeur du tableau, un onglet vous donne les informations « source »

Expériences standardisées Vous avez maintenant différents classeurs : Les métadonnées Les statistiques Les fréquences calculées Le tableau croisé dynamique Éventuellement les graphiques croisés dynamiques

Expériences standardisées Pour une manipulation standardisée, lorsque vous en ferez une nouvelle vous n’aurez que peu de champs à modifier : Attention Ne jamais toucher les entêtes Ne pas reprendre les noms type « MUT, CTRL… » servant pour l’établissement des TCD

Expériences standardisées Remplacer les métadonnées qui changent Coller les nouvelles statistiques Remplir la colonne « comment » si nécessaire Actualiser tout Les TCD et graphes se mettent à jour

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Lien vers le téléchargement du module Tableau Le module Tableau Il est possible d’ajouter un complément « Tableau » à votre logiciel Excel. Lien vers le téléchargement du module Tableau

Le module Tableau Permet de modifier en un clique toute une catégorie, en mettant par exemple «moyenne de... » sur l’ensemble des paramètres Sélectionner la 1ère valeur numérique de votre tableau

Le module Tableau

Le module Tableau

Quelle méthode choisir ? Le module Tableau Quelle méthode choisir ? Analyse unique avec beaucoup de paramètres Analyse longitudinale

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L’outil IMPACT http://impact.marseille.inserm.fr/

L’outil IMPACT

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