Projet de fin d’études – Semestre 10

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Transcription de la présentation:

Projet de fin d’études – Semestre 10 Réalisation par LOISEAU Marie 2017 - 2018 Encadré par BOISNEAU Catherine Quel outil d’analyse utiliser pour expliquer la répartition des Gomphidae en Loire ?

Contexte et application Résultats Perspectives Contrat pour la Loire et ses Annexes 2015-2020 Quel outil d’analyse utiliser pour évaluer la répartition des Gomphidae en Loire? Contexte Incompatibilité entre les conditions d’application et les données récoltées Employabilité du logiciel MaxEnt Quels tests statistiques utiliser? Quelles variables environnementales influencent le plus la répartition des individus? Tests statistiques

Choix du test en fonction de… Contexte et application Résultats Perspectives Choix du test en fonction de… Variables à traiter Hauteur d’eau, vitesse du courant, concentration en dioxygène, substrat (sable fin ou sable grossier) Type de variables Variables mixtes (quantitatives et qualitatives) Problématique Corrélations entre les variables environnementales et la présence des individus Ressources disponibles Logiciel R, R studio, XLSTAT, Excel 3

Contexte et application Résultats Perspectives Choix du test Nombre d’individus, population observée, variables à traiter Population étudiée Analyse multivariée Traitement de variables homogènes Traitement de variables mixtes ACP / AFC / ACM AFM / Modèle linéaire / Hill Smith 4

Contexte et application Résultats Perspectives Application 1 Création du tableau de données (.csv) Paramètres à respecter Test de Fisher Abondance vs substrat 2 Traitement des données sur R et R-studio. Implémentation d’un langage informatique particulier. Tests de Spearman, de Kendall, et de Pearson Abondance vs hauteur d’eau Abondance vs vitesse de courant Abondance vs dioxygène Abondance vs substrat fin Abondance vs substrat grossier 3 Analyses bivariées entre les variables environnementales et l’abondance. 5

Résultats Contexte et application Perspectives Observations Corrélation positive entre le substrat grossier et l’abondance Corrélation positive entre la vitesse du courant et l’abondance Corrélation négative entre le substrat fin et l’abondance Corrélation négative entre la concentration en dioxygène et l’abondance 6

Résultats 7 Contexte et application Perspectives Variables p-value Taux de corrélation Test Corrélation Abondance vs vcourant 0.0001075 0.3689582 Spearman Positive Abondance vs hauteur_eau 0.0001388 0.3634079 Abondance vs dioxygene 0.5991 -0.05188592 X Abondance vs substrat 0.8063 0.07516329 Fisher Variables p-value Taux de corrélation Test Corrélation Abondance vs subs-sgr 0.01099 0.2172595 Kendall Positive Abondance vs subst_s -0.2172595 Négative 7

Résultats Contexte et application Perspectives Les variables influençant le plus la répartition des Caenis seraient : Une hauteur d’eau relativement élevée Une vitesse de courant relativement importante Un substrat à granularité plus grossière Genre ubiquiste trouvé dans de nombreuses conditions Difficile d’estimer la pertinence du modèle pour ce genre Larve du genre Caenis (Perla) 8

Résultats Méthode prometteuse. Contexte et application Perspectives Méthode prometteuse. Aperçu des corrélations s’entretenant entre les variables de manière claire. Facile à implémenter. Analyse de données mixtes. Pas de quantification. Doit être couplée à d’autres tests statistiques. Difficile de juger sa pertinence avec le genre Caenis. Peut être insuffisante pour des études plus poussées. Avantages Inconvénients 9

Contexte et application Perspectives Contexte et application Résultats Réaliser l’analyse avec des individus d’un genre plus exigeant Comparer les résultats avec la littérature Tester la validité de l’analyse Hill Smith Faire de nouvelles campagnes de prélèvement Implémenter les tests statistiques sur ces populations Définir les variables environnementales influençant la répartition des Gomphidae Chercher/tester de nouveaux tests statistiques (modèles linéaires, AFM) Chercher/tester de nouveaux outils d’analyse (XLSTAT-Ecology) S’assurer que l’analyse Hill Smith soit la plus pertinente 10

Perspectives Contexte et application Résultats Quel outil d’analyse utiliser pour déterminer les habitats préférentiels des larves de Gomphidae en Loire? Employabilité du logiciel MaxEnt pour représenter la répartition potentielle des Gomphidae ? Utilisation de tests statistiques pour déterminer l’influence des variables environnementales sur l’abondance des individus ? (test avec Caenis) Oui - Données d’observations non aléatoires - Non-accès aux valeurs des variables sur l’ensemble de la zone - Analyse Hill Smith : aperçu des corrélations - Combinaison à d’autres tests (Fisher, Spearman) : quantification. Perspectives de recherches Non 11

Merci de votre ATTENTION Remerciements Mme Catherine BOISNEAU Mme Nina RICHARD Mme Clémence CHAUDRON Merci de votre ATTENTION