Bi 231: Ingénierie des Protéines

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Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 4

Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine. IV. Mutagenèse: techniques et applications. V. L'insuline : exemple d'une stratégie. VI. Analyse d'articles.

IV. Mutagenèse: techniques et applications. Mutagenèse aléatoire. Alanine scanning. Mutagenèse dirigée

41 Mutagenèse aléatoire. Objectifs : modification du phénotype, recherche de la mutation associée Moyens : irradiations (UV, RX), produits chimiques utilisation de DNApol modifiée

Agents mutagènes Irradiations  modification d'une ou plusieurs bases produits chimiques : DNApol modifiée, suppression de la fonction exonucléasique  pas de correction possible (exple fragment kleenow, MutaGen™ )

42 Alanine scanning. Objectifs :  recherche du (des) résidu(s) responsable(s) de la fonction d'une protéine. Moyens : amplification par PCR du gène de la protéine d'intérêt avec oligonucléotides adaptés.

Principe de la PCR.

T V V L R P S R G L Y H H P A G L R H H Séquence nucléique actgtggttcttcggccatcccgaggtctatatcatcatcctgccgggcttcggcatcatca ------------cttcggccatcccgaggtgcttatcatcatcctgccgg------------------------ Séquence protéique T V V L R P S R G L Y H H P A G L R H H - - - - - - R P S R G A Y H H P A G L R H H

43 mutagenèse dirigée Objectifs :  Modification ciblée d'un résidu pour étudier sa fonction dans une protéine. Moyens : amplification par PCR du gène de la protéine d'intérêt avec oligonucléotides adaptés.

T V V L R P S R G L Y H H P A G L R H H - - - - -L R P S R D L Y H H P Séquence nucléique actgtggttcttcggccatcccgaggtctatatcatcatcctgccgggcttcggcatcatca ------------cttcggccatcccgagacctatatcatcatcctgc------------------------ Séquence protéique T V V L R P S R G L Y H H P A G L R H H - - - - -L R P S R D L Y H H P