Le score de propension (ou méthode de la probabilité prédite)

Slides:



Advertisements
Présentations similaires
Probabilités et statistiques au lycée
Advertisements

GESTION DE PORTEFEUILLE chapitre n° 7
Introduction to Impact Evaluation training HSRC, Pretoria, South Africa April 10, 2008 Induction Causale Florence Kondylis Initiative pour lévaluation.
Test statistique : principe
Association entre variables
JIQH 2011 Liens entre indicateurs, PEP et certification Analyse et perspectives P. Loirat Conseiller médical du Directeur de la DAQSS.
Collecte de données F. Kohler.
Comparaison d'une distribution observée à une distribution théorique
Comparaison de plusieurs moyennes observées
Tests non paramétriques
Tests de comparaison de pourcentages
Master Pharmacologie - Module Pharmacologie du développement - Paris ANALYSE D'ESSAI THERAPEUTIQUE Pr E. Autret-Leca Pharmacologie CHRU Tours.
Estimation de la survie comparaison des courbes de survie
1. Les caractéristiques de dispersion. 11. Utilité.
Dr DEVILLE Emmanuelle J D V 12/07/2006
Estimation de la survie comparaison des courbes de survie FRT C3.
Régression -corrélation
Les Biais Item 14°) Relever les biais discutés. Rechercher d’autres biais non pris en compte dans la discussion et Relever leurs conséquences Dr Marie-Christine.
Schémas d’étude.
16ème Conférence Nationale des Présidents de Commissions locales dinformation Autorité de Sûreté Nucléaire Paris, 8 décembre 2004 Perception et Gestion.
Analyse de la variance à un facteur
Expériences contrôlées Quasi-expériences Études de cas
Tests de comparaison de moyennes
Tests de comparaison de moyennes
Rôle des Facteurs de confusion dans l’interprétation des résultats d’une association Dr J Ateudjieu J Ateudjieu. Cours Epiconc Master's Epi et SP Université.
Application des algorithmes génétiques
Les variables au plan fonctionnel
Etude longitudinale d’essais multilocaux: apports du modèle mixte
Régression linéaire simple
Howell, Chap. 1 Position générale
Paul-Marie Bernard Université Laval
1.Un rang de données multicolores 2. Deux permutations des n premiers entiers 3. b permutations des k premiers entiers 4. Choix de n points dans [0,1]
Interaction entre les possibles facteurs de risque
Commentaires sur les biais écologiques et les échelles non emboîtées
Le test t.
La corrélation et la régression
Corrélation Principe fondamental d’une analyse de corrélation
Comparaison de deux échantillons
Structure discriminante (analyse discriminante)
Objectifs du chap. 5: Plans de recherche classiques
La régression multiple
PLACE DU SCORE DE PROPENSION EN EPIDEMIOLOGIE CLINIQUE
Régression linéaire multiple : hypothèses & interprétation. Partie 2.
Régression linéaire multiple : hypothèses & interprétation
Régression linéaire multiple : hypothèses & tests. Partie 3.
Journée d’accompagnement de l’appel à recherches autisme
Multi-country Workshop on Development Impact Evaluation in Finance and Private Sector Development Dakar, Senegal, February 1-4, 2010 Non-Experimental Methods.
Analyse de survie.
Théorème de la limite centrale l’inférence statistique
* 16/07/96 Caractéristiques maternelles et infantiles associées à l’accident ischémique artériel cérébral périnatal de l’enfant *
Epidémiologie Dr Lydia Guittet.
Méthodes non expérimentales E4P workshop Lisbonne – 25 mars, 2014 Lodewijk Smets Université Catholique de Louvain (KUL) Université d’Anvers (UA)
Intervalles de confiance pour des proportions L’inférence statistique
Études écologiques.
* 16/07/96 Diabète gestationnel et malformations de l’appareil urinaire : une étude cas témoins en milieu hospitalier.     Avril 2013 Arnaud Seigneurin.
STATISTIQUE INFERENTIELLE LES TESTS STATISTIQUES
Lecture et présentation d’une étude pronostique
Journées du GDR "Statistique et Santé" 13 et 14 novembre 2008
Échantillonnage (STT-2000)
Facteurs de risque de contamination par le virus de l’hépatite C. Etude cas-témoin en population générale.
Téléphone mobile, risque de tumeurs cérébrales et du nerf vestibuloacoustique: l’étude cas-témoins INTERPHONE en France. Lecture critique d’article Décembre.
ECHANTILLONAGE ET ESTIMATION
LECTURE CRITIQUE D’UN ARTICLE
Tests relatifs aux variables qualitatives: Tests du Chi-deux.
Tests relatifs aux variables qualitatives: Tests du Chi-deux.
ETUDES PRONOSTIQUES Pr Ganry.
Statistiques: mesures de liaisons tests d’hypothèse
Prise en compte de l'effet centre dans le score de propension: cas des données de survie E. Gayat, J.-Y. Mary et R. Porcher UMR-S 717, Université Paris.
Méthodes biostatistiques et épidémiologiques employées pour la recherche biomédicale : implications pour la formation médicale initiale MQ. Picat, M. Savès,
Transcription de la présentation:

Le score de propension (ou méthode de la probabilité prédite) D ’après : Rosenbaum et Rubin 1983. Biometrika 70, 1, 41-55 Drake et Fisher, 1995. Int. J. Epidemiol. 24, 1, 183-187 Austin, 2007. Stat. Med. 26, 3078-3094 Austin, 2008. Stat. Med. 27, 2037-2049 www.infectiologie.com/site/medias/JNI/JNI06/CP/cp1-Alla.pdf 18/11/2008 C. Fermanian

-> étude observationnelle. Quand un essai thérapeutique contrôlé randomisé n'est pas perçu comme possible -> étude observationnelle. Les études d'observation ne permettent habituellement pas de conclure en termes de causalité, car une différence observée entre les patients traités et non traités (ou exposés et non exposés) peut être liée non pas au choix thérapeutique (ou au facteur d'exposition), mais aux raisons de ce choix (biais d'indication, ou plus largement biais de sélection). 18/11/2008 C. Fermanian

Historiquement, les études ayant analysé cette situation ont utilisé des modèles de régression pour estimer des effets traitement conditionnels (régression logistique « classique » ou modèles de Cox). 18/11/2008 C. Fermanian

L'analyse de propension consiste à tenir compte, dans l'analyse de la relation entre un traitement et son résultat, de la probabilité d'avoir été traité. Si on tient compte de cette probabilité dans l'estimation de l'effet du traitement, on se met en situation 'quasi-expérimentale'. 18/11/2008 C. Fermanian

Etapes d'une analyse de propension: 1) Identifier les variables pouvant avoir un lien avec la nature du traitement / de l'exposition (variables de confusion) 2) Estimer la Pr conditionnelle d'être traité sachant la valeur de certaines covariables (= score de propension, SP) 3) Etudier la relation entre le traitement et le résultat en appariant, ajustant et/ou stratifiant sur les variables de confusion, utilisées soit individuellement, soit combinées dans le SP. 18/11/2008 C. Fermanian

Proposition (Rosenbaum et Rubin, 1983) : Si la variable de résultat Y0 est indépendante de l’accès au traitement T conditionnellement aux observables X, alors elle est également indépendante de T conditionnellement au score de propension P(X) = Pr (T = 1| X) : Y0  T | X  Y0  T | P(X) En raison de cette propriété, il suffit d’apparier les individus sur leur score de propension, lequel constitue un résumé unidimensionnel de l’ensemble de ces variables L’individu non traité noté ĩ, qui est apparié avec l’individu traité i, est alors défini par P(xi) = P(xĩ ) 18/11/2008 C. Fermanian

Evolution du nombre de publications utilisant des analyses de SP: => Le besoin est réel. 18/11/2008 C. Fermanian

Exemple: endocardite infectieuse (d ’après Alla et al. , 2008 Ann Exemple: endocardite infectieuse (d ’après Alla et al., 2008 Ann. Cardiol. Angeiol. (Paris). 57(2):98-101) 1) identification des facteurs de confusion 18/11/2008 C. Fermanian

1) calcul du SP -> constitution de strates (chacune ayant sa propre distribution des facteurs de confusion) 18/11/2008 C. Fermanian

18/11/2008 C. Fermanian

Apports de la recherche empirique et théorique Par rapport à la stratification, l ’appariement sur le SP élimine une plus grande proportion des différences de ligne de base entre traités et témoins. Cependant l ’analyse des échantillons appariés sur le SP requiert des méthodes statistiques spécifiques (test t apparié et test des rangs signés de Wilcoxon, ou test de McNemar pour les données binaires) 18/11/2008 C. Fermanian

Revue de la littérature (47 articles sur la période 1996-2003) sur l ’appariement sur le SP (Austin, 2008, Stat. Med. 27: 2037-2049) -> seulement 2 des articles ont parlé des caractéristiques de ligne de base entre traités et témoins dans l ’échantillon apparié et utilisé des méthodes correctes pour quantifier le degré de déséquilibre. 18/11/2008 C. Fermanian

Treize articles sur 47 (28%) ont utilisé des méthodes statistiques adaptées aux données appariées lors de l ’estimation de l ’effet traitement. Des erreurs courantes sont 1) l ’utilisation du test du log-rank pour comparer des courbes de survie de Kaplan-Meier dans l ’échantillon apparié, et 2) l ’utilisation de modèles de régression ou de tests pour échantillons indépendants. 18/11/2008 C. Fermanian

Comparaison SP / régression «classique» Sur 43 études ayant utilisé simultanément les méthodes de SP et l’ajustement par régression « classique » pour estimer les effets traitement -> au total 59 effets traitement différents En moyenne, les méthodes de SP ont mené à un OR ou un HR 6,4 % plus proche de 1 que les méthodes conventionnelles. 18/11/2008 C. Fermanian

Dans 8 des associations (13,6%), il a été observé une différence relative entre méthodes dépassant 25%. Egalement chez 8 des associations, l’effet a été classé comme significatif par ajustement par régression, alors qu’il était NS en utilisant les méthodes basées sur le SP. 18/11/2008 C. Fermanian

Inconvénients de la méthode On ne peut pas prétendre, le plus souvent, être exhaustif sur le choix des facteurs de confusion. Le SP doit être estimé, usuellement à l’aide d’un modèle paramétrique. Si on veut faire intervenir des variables pronostiques on doit utiliser un modèle qui contiendra par ailleurs le SP (lui-même estimé). La recherche concernant ce que le fait de travailler conditionnellement au SP induit comme biais dans les autres mesures de l ’effet traitement est encore embryonnaire. Quid des sujets ne pouvant pas être appariés ? -> perte d ’information et de précision dans l ’estimation 18/11/2008 C. Fermanian

Comment utiliser à bon escient le SP ? Réserver son emploi dans des conditions définies. Définir précisément le design de l ’étude et les variables de confusion, identifier et mesurer les potentiels facteurs de confusion non mesurés. Vérifier l ’équilibre entre les facteurs de confusion, car il reflète directement la force du score de propension. 18/11/2008 C. Fermanian