Phylogénie des microbes endolithiques associés aux basaltes marins 40 cm Année 2008-2009 UE 106 DOM - Diversité des organismes marins 1

Connaissances antérieures Pillow lavas au niveau de la dorsale Est-Pacifique 40 cm 40 cm Stuctures cellulaires observées dans le basalte 5 µm 5 µm Santelli (2008) Nature 1

Exemple d’une communauté microbienne en relation avec le basalte au Mont Baby Bare Huber (2006) Environmental Microbiology 2

But de l’étude Phylogénie des microbes associés à ces roches Distribution géographique des clades déterminés Source : wikipedia Source : www.geologie.ens.fr 3

Résultats et Discussion 11 clades monophylétiques solides originaires des sédiments, du basalte et du gabbro  7 appartiennent aux bactéries 4 appartiennent au Marine Group 1 Crenarcheota ε-proteobacteria β-proteobacteria γ-proteobacteria Division Candidate TM6 δ-proteobacteria α-proteobacteria Verrucomicrobia Acidobacteria Planctomycetes Firmicutes Actinobacteria Chloroflexi Bacteroidetes (2 clades solides) MGI Crenarcheota (4 clades solides) (2 clades solides) 4

Colonisation de la croûte par clades cosmopolites et spécifiques. Un clade du MG1 endémique du basalte. Clades différents de ceux trouvés dans les autres habitats marins Un nouveau monde … 5

Travail des autres équipes Massana, 2000 - Etude basée uniquement sur les Archea - Répartition mondiale Huber, 2006 - Domination des Bactéries - Clades différents de ceux des autres biotopes 6

Bactéries (66% de Proteobacteria) plus abondantes que Archea Santelli, 2008 : Bactéries (66% de Proteobacteria) plus abondantes que Archea Clades différents de ceux des autres biotopes Répartition mondiale 7

Bibliographie Santelli C.M., Orcutt B.N., Banning E., Bach W., Moyer C.L., Sogin M.L., Staudigel H. & Edwards K.J. Abundance and diversity of microbial life in ocean crust. Nature 453 : 653-657 (2008) Huber J.A., Johnson P., Butterfield D.A. & Baross J.A. Microbial life in ridge flank crustal fluids. Environmental Microbiology 8 : 88-99 (2006) Santelli C.M., Edgcomb V.P., Bach W. & Edwards K.J. The diversity and abundance of bacteria inhabiting seafloor lavas positively correlate with rock alteration. Environmental Microbiology 1-13 (2008) Massana R., DeLong E.F., Pedros-Alio C. A Few Cosmopolitan Phylotypes Dominate Planktonic Archaeal Assemblages in Widely Different Oceanic Provinces. Applied and Environmental Microbiology. 66 : 1777-1787 (2000) 8