IGM LRI LaBRI Claire Herrbach François Lefèvre Michel Termier Alain Denise LaBRI Serge Dulucq
Importance des ARN dans la vie cellulaire Activité liée à structure 3 D, seulement partiellement liée à la séquence niveau traduction niveau régulation Prédire les ARN, deviner leur fonction comparaison un alignement nucléique rend compte seulement des parentés proches car pas de codages multiples d’un même résidu, pas de connaissance sur les taux de substitution (homologie – analogie) Comparaison des structures 2D : arbres Essayer d’élaborer des matrices de substitution Pourquoi les tRNA ? connus, disponibles, modélisés le problème des bases modifiées
régulation par structure secondaire blocage start ferritine site d'initiation bloqué aconitase inactive : pas de traduction transférine blocage 5' 3' aconitase inactive : messager stable traduit M T
Modélisation par arbre
M T
M T
Interactions Protéines ARN