I) définition typologique de l’espèce Exemple : Karl von Linné (1707-1778) C’est une définition basée sur la morphologie, l’espèce est définie par comparaison avec un individu de référence conservé en muséum et qui a servi à décrire l’espèce, c’est le type d’où le nom d’espèce typologique. Cette définition ignore le polymorphisme, elle est fixiste, elle souffre d’évidentes limites. . 18ème siècle: classification biologique traditionnelle des êtres vivants (établie par le suédois Linné puis les français Jussieu et Cuvier): reposait sur une vision anthropocentrique et morphologique qui conduisait à décrire l’évolution biologique comme une série de perfectionnements aboutissant à l’homme.
Cuvier Jussieu
Par exemple, les groupes étaient construits négativement : - invertébrés (qui n’a pas de vertèbres comme l’homme) - procaryotes (qui n’a pas de noyau comme les cellules de l’homme ), De plus la vision de l’évolution était linéaire, c'est-à-dire que les êtres vivants se seraient succédés selon une lignée aboutissant à l’homme.
C’est Hennig (entomologiste allemand 1913- 1976), en s’appuyant sur les travaux de Darwin qui a entièrement remis en cause cette vision fixiste, en proposant une classification évolutive (phylogénique) des êtres vivants reposant sur l’établissement de groupes uniquement monophylétiques.
Les progrès de la biologie moléculaire, qui ont permis de comparer des séquences de gènes entre différents organismes, sont ensuite venus confirmer ses propos. En effet, seulement 5% du génome d’un vertébré détermine sa morphologie. Les seules données morphologiques utilisées dans l’ancienne classification sont donc très insuffisantes pour classer et retracer l’évolution des organismes vivants. Guillaume Lecointre (1964-)